PA052 Úvod do systémové biologie

Fakulta informatiky
jaro 2015
Rozsah
2/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.
Vyučující
prof. RNDr. Luboš Brim, CSc. (přednášející)
doc. RNDr. David Šafránek, Ph.D. (přednášející)
Garance
doc. RNDr. Aleš Horák, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Rozvrh
St 16:00–17:50 B410
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Studenti budou po absolvování tohoto kurzu seznámeni s problematikou komplexních systémů v biologii; porozumí základním principům systémové biologie; získají jasnou motivaci pro uplatnění informatických přístupů a myšlení v moderní biologii.
Osnova
  • Historie a zaměření systémové biologie.
  • Úvod do biologických pojmů.
  • Základní pojmy a principy systémového paradigmatu.
  • Modelové organismy.
  • Získávání biologických dat - Databáze systémově biologických znalostí.
  • Průběh výzkumu v systémové biologii, role informatiky.
  • Pojem modelu v systémové biologii, databáze modelů.
  • Příklady systémově biologického výzkumu.
  • Syntetická biologie - Návrh a rekonstrukce biologických systémů.
  • Informace v biologii a o biologii.
Literatura
    doporučená literatura
  • ALON, Uri. An Introduction to Systems Biology: Design Principles of Biological Circuits. Chapman & Hall/Crc, 2006. info
Výukové metody
přednáška, samostatné studium
Metody hodnocení
Zkouška je písemná. V případě zadání průběžných testů během semestru, mají tyto podíl nejvýše 30% na závěrečném hodnocení. Pomocné materiály nejsou povoleny.
Navazující předměty
Informace učitele
http://sybila.fi.muni.cz/cz/predmety/PA052
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2010, podzim 2011, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025, podzim 2025.