PA052 Úvod do systémové biologie

Fakulta informatiky
podzim 2010
Rozsah
2/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.
Vyučující
prof. RNDr. Luboš Brim, CSc. (přednášející)
doc. RNDr. David Šafránek, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Rozvrh
Čt 16:00–17:50 B411
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
předmět má 22 mateřských oborů, zobrazit
Cíle předmětu
Studenti budou po absolvování tohoto kurzu seznámeni s problematikou komplexních systémů v biologii, porozumí základním principům systémové biologie a získají jasnou motivaci pro uplatnění informatických přístupů a myšlení v moderní biologii.
Osnova
1.Historie a zaměření systémové biologie 2. Úvod do biologických pojmů 3. Základní pojmy a principy systémové biologie 4. Získávání biologických dat - Databáze systémově biologických znalostí 5. Průběh výzkumu v systémové biologii - Uplatnění informatických metod 6. Uchopení a specifikace biologického systému - Biologické sítě a jejich rekonstrukce 7. Pojem modelu v systémové biologii -- Modelování a simulace dynamických dějů uvnitř biologických systémů 8. Příklady systémově biologického výzkumu 9. Přehled případových studií modelů živých organismů 10. Validace modelu - Vztah analýzy in silico modelu a experimentální analýzy 11. Návrh a rekonstrukce biologických systémů
Literatura
    doporučená literatura
  • ALON, Uri. An Introduction to Systems Biology: Design Principles of Biological Circuits. Chapman & Hall/Crc, 2006. info
Výukové metody
přednáška, samostatné studium
Metody hodnocení
Zkouška je písemná. V případě zadání průběžných testů během semestru, mají tyto podíl nejvýše 30% na závěrečném hodnocení. Pomocné materiály nejsou povoleny.
Informace učitele
http://www.fi.muni.cz/usr/brim/vyuka/pa052.html
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2011, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025, podzim 2025.