FI:PV082 Počítačová chemie - Informace o předmětu
PV082 Počítačová chemie
Fakulta informatikyjaro 2026
- Rozsah
- 2/0. 2 kr. (plus ukončení). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: z.
- Vyučující
- doc. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D. (přednášející)
RNDr. Tomáš Raček, Ph.D. (pomocník)
Mgr. Vladimír Horský, Ph.D. (pomocník) - Garance
- doc. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky - Předpoklady
- Základy lineární algebry a matematické analýzy.
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
- Mateřské obory/plány
- Bioinformatika (program PřF, N-BINF)
- Cíle předmětu
- Smyslem tohoto kursu je umožnit nahlédnutí do výpočetních metod používaných v chemii, aniž by bylo nutno absolvovat příslušné odborné studium. Absolvent kurzu získá přehled technik výpočetní chemie, bude schopen se orientovat v jejich vhodnosti pro řešení konkrétních problémů. Absolvent bude rovněž schopen porozumět a vysvětlit základní principy metod výpočetní chemie.
- Výstupy z učení
- Absolvent získá přehled technik výpočetní chemie, bude schopen se orientovat v jejich vhodnosti pro řešení konkrétních problémů. Absolvent bude schopen porozumět a vysvětlit základní principy metod výpočetní chemie.
- Osnova
- Molekula: a) Konformace molekuly: reprezentace pomocí grafu a matice, izomorfismus a kanonické indexování grafů. b) Geometrie molekuly: reprezentace pomocí kartézských a interních souřadnic, porovnávání geometrií. c) Visualizace molekul. d) Vyhledávání a vytváření molekul.
- Molekulová mechanika: silové pole, potenciální energie, hyperplocha potenciální energie (PES), minimalizace, prohledávání PES.
- Kvantová mechanika: semiempirické metody a ab-initio metody.
- Molekulová dynamika.
- Literatura
- Handbook of Computational Chemistry. Edited by Jerzy Leszczynski - Anna Kaczmarek-Kedziera - Tomasz Puzyn - Manthos G. 2nd ed. 2017. Cham: Imprint: Springer, 2017, 588 illus. ISBN 9783319272825. URL info
- JENSEN, Frank. Introduction to computational chemistry. Third edition. Chichester: Wiley, 2017, xxii, 638. ISBN 9781118825990. info
- Encyclopedia of computational chemistry. Edited by Paul von R. Schleyer. [S.l.]: Wiley Online Library, 2014, 1 online. ISBN 9780470845011. info
- Výukové metody
- Přednášky, řešení příkladů, provádění analýz.
- Metody hodnocení
- Písemná zkouška.
- Další komentáře
- Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.
- Statistika zápisu (nejnovější)
- Permalink: https://is.muni.cz/predmet/fi/jaro2026/PV082