VSAG011 Moderní technologie pro analýzu genomu

Lékařská fakulta
podzim 2010
Rozsah
1/0. 2 kr. Ukončení: z.
Vyučující
RNDr. Jitka Malčíková, Ph.D. (přednášející)
prof. MUDr. Mgr. Marek Mráz, Ph.D. (přednášející)
prof. RNDr. Šárka Pospíšilová, Ph.D. (přednášející)
MVDr. Boris Tichý, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. RNDr. Šárka Pospíšilová, Ph.D.
Interní hematologická a onkologická klinika – Společná pracoviště s Fakultní nemocnicí Brno - pracoviště Nemocnice Bohunice a Porodnice – Lékařská fakulta
Předpoklady
PřF – magisterské navazující a vyšší, LF – bez omezení
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 30 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/30, pouze zareg.: 0/30, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/30
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Seznámit se s genomikou, transkriptomikou a epigenomikou. Porozumět metodám umožňujícím studium celého genomu – čipové technologie a sekvenování nové generace. Obeznámit se s využitím moderních metod v současném biomedicínském výzkumu.
Osnova
  • Úvod do genomiky; Čipové technologie (CGH, SNP, resekvenační, expresní, proteinové čipy); Sekvenování nové generace (454, SMRT, sequencing by synthesis, sequencing by ligation, iontorent); Metody pro analýzu miRNA; Aplikace nových technologíí v genomice, transkriptomice, epigenomice; Analýza extrahumánního genomu – problematika oportunních infekcí; Detekce chimérismu u pacientů po transplantaci krvetvorných kmenových buněk; Další technologické přístupy: Fluidigm, Sequenom, Luminex, Nanostring
Literatura
  • není doporučena žádná literatura
Výukové metody
Přednáška
Metody hodnocení
Písemná zkouška
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2011.