MBKM071c Klinická mikrobiologie II - cvičení

Lékařská fakulta
podzim 2022
Rozsah
0/1/0. 15. 1 kr. Ukončení: z.
Vyučující
MUDr. Alena Ševčíková (přednášející)
MUDr. Jana Bednářová, Ph.D. (cvičící)
doc. MUDr. Milan Dastych, CSc., MBA (cvičící)
MUDr. Ivana Vítková (cvičící)
MUDr. Zdeňka Čermáková, Ph.D. (pomocník)
Michaela Gregorovičová (pomocník)
Garance
MUDr. Ivana Vítková
Katedra laboratorních metod – Pracoviště nelékařských oborů – Lékařská fakulta
Kontaktní osoba: Michaela Gregorovičová
Dodavatelské pracoviště: Katedra laboratorních metod – Pracoviště nelékařských oborů – Lékařská fakulta
Rozvrh
Út 13. 9. 14:00–15:40 N02255, Út 20. 9. 14:00–15:40 N02255, Út 27. 9. 14:00–15:40 N02255, Út 4. 10. 14:00–15:40 N02255, Út 11. 10. 14:00–15:40 N02255, Út 18. 10. 14:00–15:40 N02255, Út 25. 10. 14:00–15:40 N02255, Út 1. 11. 14:00–15:40 N02255, St 2. 11. 14:00–15:40 N02255, Út 8. 11. 14:00–15:40 N02255, Út 15. 11. 14:00–15:40 N02255, Út 22. 11. 14:00–15:40 N02255
Předpoklady
bakalářské studium zaměřené na laboratorní medicínu nebo přírodní vědy
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Výuka předmětu Lékařská mikrobiologie staví na základech, které získali studenti absolvováním bakalářského studia.
Cílem teoretické části přípravy je poskytnout rozšířené informace o vlastnostech lékařsky významných mikroorganismů a o patogenezi, klinice, epidemiologii a terapii infekčních onemocnění a podrobné informace o mikrobiologických vyšetřovacích postupech vč. zásad indikace mikrobiologických vyšetření, správného odběru a zasílání infekčního materiálu a správné interpretace výsledků vzhledem ke klinickému stavu pacienta včetně možností antibiotické terapie. V praktické části přípravy je cílem získat praktické zkušenosti a dovednosti v analýze biochemických vlastností, v analýze antigenní, proteomické a molekulárně biologické.
Po absolvování předmětu bude student orientován v detailní diagnostice jednotlivých etiologických agens infekčních chorob: bakterií, virů, parazitů a kvasinek a plísní. Bude moci provádět diagnostika jednotlivých etiologických agens na základě detailních znalostí biochemie, antigenní struktury, složení bílkovin a molekulárně biologických vlastností mikroorganismů. Bude seznámen se základními i specializovanými mikrobiologickými postup, včetně znalosti práce na přístrojích, dostupných v současné laboratorní mikrobiologické praxi. Bude schopen interpretovat výsledek laboratorního vyšetření. Bude cvičen ve schopnostech kombinačních, chápání širších souvislostí infekčních onemocnění. Bude se schopen orientovat v problematice nozokomiálních nákaz. Bude znát zásady racionální antibiotické terapie a antibiotické politiky na národní i mezinárodní úrovni. Bude seznámen se zásady managementu kvality v lékařské mikrobiologii.
Výstupy z učení
Po absolvování předmětu bude student orientován v detailní diagnostice jednotlivých etiologických agens infekčních chorob: bakterií, virů, parazitů a kvasinek a plísní. Bude moci provádět diagnostika jednotlivých etiologických agens na základě detailních znalostí biochemie, antigenní struktury, složení bílkovin a molekulárně biologických vlastností mikroorganismů. Bude seznámen se základními i specializovanými mikrobiologickými postup, včetně znalosti práce na přístrojích, dostupných v současné laboratorní mikrobiologické praxi. Bude schopen interpretovat výsledek laboratorního vyšetření. Bude cvičen ve schopnostech kombinačních, chápání širších souvislostí infekčních onemocnění. Bude se schopen orientovat v problematice nozokomiálních nákaz. Bude znát zásady racionální antibiotické terapie a antibiotické politiky na národní i mezinárodní úrovni. Bude seznámen se zásady managementu kvality v lékařské mikrobiologii.
Osnova
  • Zásady práce v mikrobiologické laboratoři (praktické uplatnění zásad protiepidemického provozního řádu – dezinfekce, likvidace laboratorních havárií, první pomoc),zásady správné laboratorní práce
  • Mikroskopie a barvící techniky základní i pokročilé
  • Kultivační půdy (příprava základních i vysoce specializovaných kultivačních médií)
  • Biochemická identifikace bakterií (očkování a odečítání biochemických testů , manuální a automatické identifikační systémy)
  • Imunologická identifikace mikroorganizmů
  • Proteomická identifikace mikroorganizmů
  • Molekulárně biologické metody identifikace mikroorganizmů
  • Praktická dezinfekce a sterilizace v laboratoři (příprava a kontrola roztoků, práce s autoklávem)
  • Stanovení citlivosti a rezistence na antibiotika (diskové testy, stanovení MIC)
  • Průkaz mikrobiálních složek ve vzorku
  • Sérologické vyšetření (ředění séra, výpočet titrů, pipetování)
  • Sérologické techniky - aglutinace (aglutinace na sklíčku a na nosičích, aglutinace ve zkumavkách – Widalova reakce, aglutinace v sérologických destičkách)
  • Sérologické techniky – precipitace (precipitace v gelu, vločkovací reakce)
  • Sérologické techniky – vazba komplementu (titrace komplementu, vlastní KFR)
  • Sérologické techniky – neutralizační testy
  • Sérologické techniky – reakce se značenými složkami (imunofluorescence, ELISA, Western blot)
  • Zpracování jednotlivých typů materiálu na bakteriologické vyšetření
  • Laboratorní diagnostika jednotlivých skupin bakterií (s využitím všech dostupných metod)
  • Enterobakterií, kampylobakterů a helikobakterů
  • gramnegativních nefermentujících tyčinek, zejména pseudomonád
  • hemofilů, bordetel, neisserií a branhamel
  • stafylokoků, streptokoků, enterokoků a grampozitivních tyčinek
  • borrelií a treponem
  • anaerobních mikrobů
  • tuberkulózy
  • Mykologické techniky – laboratorní diagnostika kvasinek a plísní (louhový preparát, kultivace, identifikace), sérologie v mykologii
  • Virologické techniky - zpracování vzorků na izolaci viru, tkáňové kultury, molekulárně biologické metody
  • Parazitologické techniky – laboratorní diagnostika prvoků (MOP, dg malárie, trichomonózy, lambliózy a toxoplazmózy)
  • Parazitologické techniky – laboratorní diagnostika mnohobuněčných střevních parazitů (zpracování stolice na parazity)
  • Laboratorní informační systém v mikrobiologické laboratoři
  • Správná laboratorní praxe a systém interního a externího hodnocení kvality v mikrobiologické laboratoři, validace a verifikace metod
Literatura
  • JURÁNKOVÁ, Jana. Klinická mikrobiologie v laboratorní praxi : bakalářský obor Zdravotní laborant. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2011, 73 s. ISBN 9788021056572. info
Výukové metody
Provedení, zápis a vyhodnocení laboratorního úkolu. Konzultace dosažených výsledků s lektorem.
Metody hodnocení
Zápočet se udílí za aktivní přístup, účast ve výuce a vypracování kvalitních protokolů z jednotlivých úloh
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2015, podzim 2016, podzim 2017, podzim 2018, podzim 2019, podzim 2020, podzim 2021, podzim 2023, podzim 2024.