VIKMB21 Bioinformatika

Filozofická fakulta
jaro 2010
Rozsah
1/1. 4 kr. Ukončení: z.
Vyučující
Ing. Jiří Sekora, MBA (přednášející)
PhDr. Michal Lorenz, Ph.D. (pomocník)
Garance
PhDr. Petr Škyřík, Ph.D.
Kabinet informačních studií a knihovnictví – Ústav české literatury – Filozofická fakulta
Kontaktní osoba: Mgr. Iva Dušová
Rozvrh
Čt 18:20–19:55 A01
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 20 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/20, pouze zareg.: 0/20, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/20
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Předmět je orientován na získání znalostí o řadících algoritmech a o databázích, způsobech zálohy a ochrany dat. Zabývá se využitím informatiky v biomedicíně. Studenti získají přehled o algoritmech rozhodování v medicíně, o pravděpodobnosti usuzování, neurčitosti v datech a fuzzy logice. Součástí je i seznámení s expertní systémy a jejich využitím.
Student bude schopen navrhnout a implementovat řadicími algoritmy, porozumí datobázovým systémům, bude seznámen s využitím informatiky v biomedicíně, porozumí pojmu expertní systém a jeho využití.
Osnova
  • Řadící algoritmy – Bubble Sort, Insertion Sort, Quick Sort, Merge Sort
  • Databáze – záznam, pole, hodnota
  • Záloha a ochrana dat
  • Základy genetiky
  • Bioinformatika
  • Pravděpodobnostní rozhodování
  • Neurčitost v datech a fuzzy logika
  • Expertní systémy
Literatura
  • Zvárová, J. Biomedicínská informatika. Praha : Karolinum, 2002. 162 s. ISBN 80-246-0609-7.
  • Oppel, A. Databáze bez předchozích znalostí. Computer Press, 2006. 320 s. ISBN 80-251-1199-7.
  • Preston, C.W. Backup & Recovery. Sebastopol : O'Reilly Media, 2007. ISBN 978-0-596-10246-3.
  • CVRČKOVÁ, Fatima. Úvod do praktické bioinformatiky. Praha: Academia, 2006, 150 s. ISBN 80-200-1360-1. info
  • POPPER, Mikuláš a Jozef KELEMEN. Expertné systémy. 1. vyd. Bratislava: Alfa, vydavateľstvo technickej a ekonomickej literatúry, 1989, 358 s. ISBN 80-05-00051-0. info
Výukové metody
Přednášky
Laboratorní cvičení
Metody hodnocení
Závěrečný týmový projekt: návrh jednoduchého expertního systému.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2011, jaro 2012, jaro 2013.