Informace o předmětu

Bi7004 Evoluční ekologie

Rozsah

2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.
Vyučováno prezenčně.

Vyučující

prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD.
Dodavatelské pracoviště: Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Bi6340 Ekologie společ. a makroekol. && Bi8150 Evoluční biologie

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Ekologie (program PřF, D-BI4)
• Zoologie (program PřF, D-BI4)
• Zoologie (program PřF, N-ZOL)

Cíle předmětu

Centrální myšlenkou předmětu evoluční ekologie je propojení pohledů ekologického a evolučně-biologického tj. analýza současných i historických vlivů na zákonitosti změn v živé přírodě. Cílem předmětu je objasnit studentům vztahy mezi organizmy a jejich prostředím (abiotickým i biotickým) a procesy generující tyto asociace z pohledu ekologického a podat vysvětlení příčin těchto vztahů z pohledu evolučního.

Výstupy z učení

Na konci tohoto kurzu bude student schopen: interpretovat vztahy a zákonitosti pozorované v živé přírodě a současně vysvětlit mechanizmy a příčiny jejich vzniku. Více specificky bude student schopen definovat selekci a adaptaci, popsat genetické základy evolučních změn, interpretovat znalosti o prostředí organizmů a mezidruhových interakcích z pohledu evoluční ekologie, popsat životní historie organizmů, jejich základní složky a kompromisy, srovnat evoluční a ekologické výhody a nevýhody sexuální a asexuální reprodukce, orientovat se v problematice speciace druhů, nahlížet na druhovou diverzitu z pohledu evolučního biologa, a propojit evoluční ekologii s imunologií.

Osnova

• (1) Úvod do evoluční ekologie – představení náplně studia evoluční ekologie, interaktivní příklady s návaznosti na jednotlivé tematické okruhy přednášky. Přírodní výběr, Darwinův evoluční scénář. Typy selekce. Přirozený a pohlavní výběr. Adaptace a fitness. (2) Genetické základy evoluční změny. Genotyp a fenotyp, genetické interakce. Genetické a environmentální komponenty variability fenotypu. Odhad dědičnosti. Změny frekvence alel v populaci – HW rovnováha, genetický drift, tok genů, selekce. Efektivní velikost populace. Neutrální evoluce molekulární evoluce. Inbreeding. Hybridizace. Udržování genetické variability. Dědičnost fitness. (3) Selekce a adaptace. Jednotky selekce. Co a jak je selektováno?, Selekce pro skupinu vs. Selekce pro jedince. Selekce na úrovni genů – altruizmus, příbuzenská selekce. Faktory limitující adaptaci – tok genů, čas pro objevení adaptace, kompromisy, omezení. Popis selekce. (4) Prostředí organizmů z pohledu evoluční ekologie. Habitat, nika a role organizmů. Koevoluce – další druh jako fluktuující habitat (gen pro gen, specifická koevoluce, guildová koevoluce, závody ve zbrojení, konflikt zájmů v případě mutualizmu). Výběr potravního zdroje – specialista vs. generalista. Dělení zdrojů a kompetice. Interpretace divergence niky. Prostor volný od nepřátel. Evidence kompromisů. Ideální volná distribuce. Strategie sázka na zajištění a averze k riziku, adaptivní převrácení mince. Vztah mezi distribucí a abundancí. Klasifikace habitatů. (5) Evoluční ekologie interagujících druhů. Ekologické a evoluční procesy kompetice. Predace – modely dynamiky v systému predátor-kořist. Co řeší predátor? Hledá predátor kořist optimálně? Teorie maximalizace energie vs. minimalizace času. Strategie kořisti. Parazitizmus – efekt parazita na dynamiku hostitele. Strategie parazita s cílem předcházení extinkce. Koevoluce parazit-hostitel. Mutualistické interakce. (6) Životní historie a kompromisy. Životní historie a fitness – semelparné a iteroparné organizmy. Životní historie – růst a vývoj před reprodukcí, začlenění do reprodukce, distribuce celoživotní reprodukce, život po reprodukčním období. Kompromisy v evoluci životních historií. (7) Reprodukční úsilí a základní složky životních historií. Růst a dosažení pohlavní zralosti, role diapauzy, složité vývojové cykly, optimalizace růstových kroků. Reprodukce semelparních a iteroparních organizmů – reprodukce velký třesk, terminální reprodukční investice. Věk a velikost v období reprodukce – analýza efektů na dosažení pohlavní zralosti, modely optimálního věku dosažení pohlavní zralosti. Počet a velikost potomků – Lackova snůška a odchylky od modelu. Reprodukční délka života a stárnutí. (8) Evoluční ekologie sexuální reprodukce. Evoluční náklady sexuální reprodukce. Výhody sexuální reprodukce. Kdy je asexuální reprodukce výhodná? Nevýhody asexuální reprodukce. Původ sexuální reprodukce. Delimitace pohlaví, hermafroditizmus. Poměr pohlaví v populaci a jeho odchylky. Sexuální selekce – rozdíly v příležitosti pro selekci u samců a samic. Sexuální selekce a evoluce pohlavního dimorfizmu. (9) Ekologický koncept speciace. Problémy s vymezením druhu. Biologický koncept druhu – prezygotické a postzygotické reprodukčně-izolační mechanizmy. Reprodukční izolace v případě sekundárního kontaktu. Role sexuální selekce pro prezygotickou reprodukční izolaci. Mechanizmy alopatrické speciace. Mechanizmy sympatrické speciace. Parapatrická speciace. Radiace druhů. Teorie fyletického gradualizmu vs. přerušované rovnováhy. Rovnováha mezi procesy speciace a extinkce. (10) Diverzita organizmů. Co je příčinou vysoké diverzity? Globální procesy generující diverzitu - diverzita z pohledu velikosti plochy, času kolonizace, energie. Procesy generující diverzitu uvnitř společenstev a regionů. Extinkce – masová, background, antropogenní. Diverzifikace. Efekt člověka na diverzitu. (11) Evoluční imunoekologie – imunita obratlovců, imunitní obranné mechanizmy, imunokompetence. Náklady na imunitu – imunita jako složka životních historií. Investice do imunity vs. investice do reprodukce. Další náklady spojené s imunitní investicí. Evoluce imunitních genů – MHC geny – parazity zprostředkovaná selekce a sexuální selekce, výběr dobrých nebo kompatibilních genů?

Literatura

doporučená literatura
• Stearns S. C. , Hoekstra R. F. 2005. Evolution, an introduction, second edition - Oxford university Press, Oxford
• Gotelli N. J. 1998. A Primer of Ecology, second edition - Sinauer Associates, Inc.
• Fox C. W., Rolf D. A., Fairbain D.J. 2001. Evolutionary Ecology: Concepts and Case Studies. Oxford University Press.
• Moya A., Font E. 2004. Evolution, from molecules to ecosystems - Oxford university press, Oxford.
• Bell G. 2008. Selection, the mechanism of evolution, second edition, Oxford University Press, Oxford.
• Westneat D. F., Fox C. W. 2010. Evolutionary behavioral ecology - Oxford university press, Oxford.
• Rose M. R., Mueller L. D. 2006. Evolution and ecology of the organism. Pearson Prentice Hall, USA.
• POULIN, Robert. Evolutionary ecology of parasites. 2nd ed. Princeton, N.J.: Princeton University Press, 2007, x, 332. ISBN 9780691120850. info
• FLEGR, Jaroslav. Evoluční biologie. Vyd. 1. Praha: Academia, 2005, 559 s. ISBN 8020012702. info

Výukové metody

teoretická příprava

Metody hodnocení

ústní zkouška

Další komentáře

Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

Bi7004 Evoluční ekologie

Rozsah

2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.
Vyučováno prezenčně.

Vyučující

prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD.
Dodavatelské pracoviště: Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Po 14:00–15:50 D31/238

Předpoklady

Bi6340 Ekologie společ. a makroekol. && Bi8150 Evoluční biologie

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Ekologie (program PřF, D-BI4)
• Zoologie (program PřF, D-BI4)
• Zoologie (program PřF, N-ZOL)

Cíle předmětu

Centrální myšlenkou předmětu evoluční ekologie je propojení pohledů ekologického a evolučně-biologického tj. analýza současných i historických vlivů na zákonitosti změn v živé přírodě. Cílem předmětu je objasnit studentům vztahy mezi organizmy a jejich prostředím (abiotickým i biotickým) a procesy generující tyto asociace z pohledu ekologického a podat vysvětlení příčin těchto vztahů z pohledu evolučního.

Výstupy z učení

Na konci tohoto kurzu bude student schopen: interpretovat vztahy a zákonitosti pozorované v živé přírodě a současně vysvětlit mechanizmy a příčiny jejich vzniku. Více specificky bude student schopen definovat selekci a adaptaci, popsat genetické základy evolučních změn, interpretovat znalosti o prostředí organizmů a mezidruhových interakcích z pohledu evoluční ekologie, popsat životní historie organizmů, jejich základní složky a kompromisy, srovnat evoluční a ekologické výhody a nevýhody sexuální a asexuální reprodukce, orientovat se v problematice speciace druhů, nahlížet na druhovou diverzitu z pohledu evolučního biologa, a propojit evoluční ekologii s imunologií.

Osnova

• (1) Úvod do evoluční ekologie – představení náplně studia evoluční ekologie, interaktivní příklady s návaznosti na jednotlivé tematické okruhy přednášky. Přírodní výběr, Darwinův evoluční scénář. Typy selekce. Přirozený a pohlavní výběr. Adaptace a fitness. (2) Genetické základy evoluční změny. Genotyp a fenotyp, genetické interakce. Genetické a environmentální komponenty variability fenotypu. Odhad dědičnosti. Změny frekvence alel v populaci – HW rovnováha, genetický drift, tok genů, selekce. Efektivní velikost populace. Neutrální evoluce molekulární evoluce. Inbreeding. Hybridizace. Udržování genetické variability. Dědičnost fitness. (3) Selekce a adaptace. Jednotky selekce. Co a jak je selektováno?, Selekce pro skupinu vs. Selekce pro jedince. Selekce na úrovni genů – altruizmus, příbuzenská selekce. Faktory limitující adaptaci – tok genů, čas pro objevení adaptace, kompromisy, omezení. Popis selekce. (4) Prostředí organizmů z pohledu evoluční ekologie. Habitat, nika a role organizmů. Koevoluce – další druh jako fluktuující habitat (gen pro gen, specifická koevoluce, guildová koevoluce, závody ve zbrojení, konflikt zájmů v případě mutualizmu). Výběr potravního zdroje – specialista vs. generalista. Dělení zdrojů a kompetice. Interpretace divergence niky. Prostor volný od nepřátel. Evidence kompromisů. Ideální volná distribuce. Strategie sázka na zajištění a averze k riziku, adaptivní převrácení mince. Vztah mezi distribucí a abundancí. Klasifikace habitatů. (5) Evoluční ekologie interagujících druhů. Ekologické a evoluční procesy kompetice. Predace – modely dynamiky v systému predátor-kořist. Co řeší predátor? Hledá predátor kořist optimálně? Teorie maximalizace energie vs. minimalizace času. Strategie kořisti. Parazitizmus – efekt parazita na dynamiku hostitele. Strategie parazita s cílem předcházení extinkce. Koevoluce parazit-hostitel. Mutualistické interakce. (6) Životní historie a kompromisy. Životní historie a fitness – semelparné a iteroparné organizmy. Životní historie – růst a vývoj před reprodukcí, začlenění do reprodukce, distribuce celoživotní reprodukce, život po reprodukčním období. Kompromisy v evoluci životních historií. (7) Reprodukční úsilí a základní složky životních historií. Růst a dosažení pohlavní zralosti, role diapauzy, složité vývojové cykly, optimalizace růstových kroků. Reprodukce semelparních a iteroparních organizmů – reprodukce velký třesk, terminální reprodukční investice. Věk a velikost v období reprodukce – analýza efektů na dosažení pohlavní zralosti, modely optimálního věku dosažení pohlavní zralosti. Počet a velikost potomků – Lackova snůška a odchylky od modelu. Reprodukční délka života a stárnutí. (8) Evoluční ekologie sexuální reprodukce. Evoluční náklady sexuální reprodukce. Výhody sexuální reprodukce. Kdy je asexuální reprodukce výhodná? Nevýhody asexuální reprodukce. Původ sexuální reprodukce. Delimitace pohlaví, hermafroditizmus. Poměr pohlaví v populaci a jeho odchylky. Sexuální selekce – rozdíly v příležitosti pro selekci u samců a samic. Sexuální selekce a evoluce pohlavního dimorfizmu. (9) Ekologický koncept speciace. Problémy s vymezením druhu. Biologický koncept druhu – prezygotické a postzygotické reprodukčně-izolační mechanizmy. Reprodukční izolace v případě sekundárního kontaktu. Role sexuální selekce pro prezygotickou reprodukční izolaci. Mechanizmy alopatrické speciace. Mechanizmy sympatrické speciace. Parapatrická speciace. Radiace druhů. Teorie fyletického gradualizmu vs. přerušované rovnováhy. Rovnováha mezi procesy speciace a extinkce. (10) Diverzita organizmů. Co je příčinou vysoké diverzity? Globální procesy generující diverzitu - diverzita z pohledu velikosti plochy, času kolonizace, energie. Procesy generující diverzitu uvnitř společenstev a regionů. Extinkce – masová, background, antropogenní. Diverzifikace. Efekt člověka na diverzitu. (11) Evoluční imunoekologie – imunita obratlovců, imunitní obranné mechanizmy, imunokompetence. Náklady na imunitu – imunita jako složka životních historií. Investice do imunity vs. investice do reprodukce. Další náklady spojené s imunitní investicí. Evoluce imunitních genů – MHC geny – parazity zprostředkovaná selekce a sexuální selekce, výběr dobrých nebo kompatibilních genů?

Literatura

doporučená literatura
• Stearns S. C. , Hoekstra R. F. 2005. Evolution, an introduction, second edition - Oxford university Press, Oxford
• Gotelli N. J. 1998. A Primer of Ecology, second edition - Sinauer Associates, Inc.
• Fox C. W., Rolf D. A., Fairbain D.J. 2001. Evolutionary Ecology: Concepts and Case Studies. Oxford University Press.
• Moya A., Font E. 2004. Evolution, from molecules to ecosystems - Oxford university press, Oxford.
• Bell G. 2008. Selection, the mechanism of evolution, second edition, Oxford University Press, Oxford.
• Westneat D. F., Fox C. W. 2010. Evolutionary behavioral ecology - Oxford university press, Oxford.
• Rose M. R., Mueller L. D. 2006. Evolution and ecology of the organism. Pearson Prentice Hall, USA.
• POULIN, Robert. Evolutionary ecology of parasites. 2nd ed. Princeton, N.J.: Princeton University Press, 2007, x, 332. ISBN 9780691120850. info
• FLEGR, Jaroslav. Evoluční biologie. Vyd. 1. Praha: Academia, 2005, 559 s. ISBN 8020012702. info

Výukové metody

teoretická příprava

Metody hodnocení

ústní zkouška

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.

Bi7004 Evoluční ekologie

Rozsah

2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.
Vyučováno prezenčně.

Vyučující

prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD.
Dodavatelské pracoviště: Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Út 8:00–9:50 D32/329

Předpoklady

Bi6340 Ekologie společ. a makroekol. && Bi8150 Evoluční biologie

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Ekologie (program PřF, D-BI4)
• Zoologie (program PřF, D-BI4)
• Zoologie (program PřF, N-ZOL)

Cíle předmětu

Centrální myšlenkou předmětu evoluční ekologie je propojení pohledů ekologického a evolučně-biologického tj. analýza současných i historických vlivů na zákonitosti změn v živé přírodě. Cílem předmětu je objasnit studentům vztahy mezi organizmy a jejich prostředím (abiotickým i biotickým) a procesy generující tyto asociace z pohledu ekologického a podat vysvětlení příčin těchto vztahů z pohledu evolučního.

Výstupy z učení

Na konci tohoto kurzu bude student schopen: interpretovat vztahy a zákonitosti pozorované v živé přírodě a současně vysvětlit mechanizmy a příčiny jejich vzniku. Více specificky bude student schopen definovat selekci a adaptaci, popsat genetické základy evolučních změn, interpretovat znalosti o prostředí organizmů a mezidruhových interakcích z pohledu evoluční ekologie, popsat životní historie organizmů, jejich základní složky a kompromisy, srovnat evoluční a ekologické výhody a nevýhody sexuální a asexuální reprodukce, orientovat se v problematice speciace druhů, nahlížet na druhovou diverzitu z pohledu evolučního biologa, a propojit evoluční ekologii s imunologií.

Osnova

• (1) Úvod do evoluční ekologie – představení náplně studia evoluční ekologie, interaktivní příklady s návaznosti na jednotlivé tematické okruhy přednášky. Přírodní výběr, Darwinův evoluční scénář. Typy selekce. Přirozený a pohlavní výběr. Adaptace a fitness. (2) Genetické základy evoluční změny. Genotyp a fenotyp, genetické interakce. Genetické a environmentální komponenty variability fenotypu. Odhad dědičnosti. Změny frekvence alel v populaci – HW rovnováha, genetický drift, tok genů, selekce. Efektivní velikost populace. Neutrální evoluce molekulární evoluce. Inbreeding. Hybridizace. Udržování genetické variability. Dědičnost fitness. (3) Selekce a adaptace. Jednotky selekce. Co a jak je selektováno?, Selekce pro skupinu vs. Selekce pro jedince. Selekce na úrovni genů – altruizmus, příbuzenská selekce. Faktory limitující adaptaci – tok genů, čas pro objevení adaptace, kompromisy, omezení. Popis selekce. (4) Prostředí organizmů z pohledu evoluční ekologie. Habitat, nika a role organizmů. Koevoluce – další druh jako fluktuující habitat (gen pro gen, specifická koevoluce, guildová koevoluce, závody ve zbrojení, konflikt zájmů v případě mutualizmu). Výběr potravního zdroje – specialista vs. generalista. Dělení zdrojů a kompetice. Interpretace divergence niky. Prostor volný od nepřátel. Evidence kompromisů. Ideální volná distribuce. Strategie sázka na zajištění a averze k riziku, adaptivní převrácení mince. Vztah mezi distribucí a abundancí. Klasifikace habitatů. (5) Evoluční ekologie interagujících druhů. Ekologické a evoluční procesy kompetice. Predace – modely dynamiky v systému predátor-kořist. Co řeší predátor? Hledá predátor kořist optimálně? Teorie maximalizace energie vs. minimalizace času. Strategie kořisti. Parazitizmus – efekt parazita na dynamiku hostitele. Strategie parazita s cílem předcházení extinkce. Koevoluce parazit-hostitel. Mutualistické interakce. (6) Životní historie a kompromisy. Životní historie a fitness – semelparné a iteroparné organizmy. Životní historie – růst a vývoj před reprodukcí, začlenění do reprodukce, distribuce celoživotní reprodukce, život po reprodukčním období. Kompromisy v evoluci životních historií. (7) Reprodukční úsilí a základní složky životních historií. Růst a dosažení pohlavní zralosti, role diapauzy, složité vývojové cykly, optimalizace růstových kroků. Reprodukce semelparních a iteroparních organizmů – reprodukce velký třesk, terminální reprodukční investice. Věk a velikost v období reprodukce – analýza efektů na dosažení pohlavní zralosti, modely optimálního věku dosažení pohlavní zralosti. Počet a velikost potomků – Lackova snůška a odchylky od modelu. Reprodukční délka života a stárnutí. (8) Evoluční ekologie sexuální reprodukce. Evoluční náklady sexuální reprodukce. Výhody sexuální reprodukce. Kdy je asexuální reprodukce výhodná? Nevýhody asexuální reprodukce. Původ sexuální reprodukce. Delimitace pohlaví, hermafroditizmus. Poměr pohlaví v populaci a jeho odchylky. Sexuální selekce – rozdíly v příležitosti pro selekci u samců a samic. Sexuální selekce a evoluce pohlavního dimorfizmu. (9) Ekologický koncept speciace. Problémy s vymezením druhu. Biologický koncept druhu – prezygotické a postzygotické reprodukčně-izolační mechanizmy. Reprodukční izolace v případě sekundárního kontaktu. Role sexuální selekce pro prezygotickou reprodukční izolaci. Mechanizmy alopatrické speciace. Mechanizmy sympatrické speciace. Parapatrická speciace. Radiace druhů. Teorie fyletického gradualizmu vs. přerušované rovnováhy. Rovnováha mezi procesy speciace a extinkce. (10) Diverzita organizmů. Co je příčinou vysoké diverzity? Globální procesy generující diverzitu - diverzita z pohledu velikosti plochy, času kolonizace, energie. Procesy generující diverzitu uvnitř společenstev a regionů. Extinkce – masová, background, antropogenní. Diverzifikace. Efekt člověka na diverzitu. (11) Evoluční imunoekologie – imunita obratlovců, imunitní obranné mechanizmy, imunokompetence. Náklady na imunitu – imunita jako složka životních historií. Investice do imunity vs. investice do reprodukce. Další náklady spojené s imunitní investicí. Evoluce imunitních genů – MHC geny – parazity zprostředkovaná selekce a sexuální selekce, výběr dobrých nebo kompatibilních genů?

Literatura

doporučená literatura
• Stearns S. C. , Hoekstra R. F. 2005. Evolution, an introduction, second edition - Oxford university Press, Oxford
• Gotelli N. J. 1998. A Primer of Ecology, second edition - Sinauer Associates, Inc.
• Fox C. W., Rolf D. A., Fairbain D.J. 2001. Evolutionary Ecology: Concepts and Case Studies. Oxford University Press.
• Moya A., Font E. 2004. Evolution, from molecules to ecosystems - Oxford university press, Oxford.
• Bell G. 2008. Selection, the mechanism of evolution, second edition, Oxford University Press, Oxford.
• Westneat D. F., Fox C. W. 2010. Evolutionary behavioral ecology - Oxford university press, Oxford.
• Rose M. R., Mueller L. D. 2006. Evolution and ecology of the organism. Pearson Prentice Hall, USA.
• POULIN, Robert. Evolutionary ecology of parasites. 2nd ed. Princeton, N.J.: Princeton University Press, 2007, x, 332. ISBN 9780691120850. info
• FLEGR, Jaroslav. Evoluční biologie. Vyd. 1. Praha: Academia, 2005, 559 s. ISBN 8020012702. info

Výukové metody

teoretická příprava

Metody hodnocení

ústní zkouška

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.

Bi7004 Evoluční ekologie

Rozsah

2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.
Vyučováno prezenčně.

Vyučující

prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD.
Dodavatelské pracoviště: Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Po 8:00–9:50 D31/238

Předpoklady

Bi6340 Ekologie společ. a makroekol. && Bi8150 Evoluční biologie

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Ekologie (program PřF, D-BI4)
• Zoologie (program PřF, D-BI4)
• Zoologie (program PřF, N-ZOL)

Cíle předmětu

Centrální myšlenkou předmětu evoluční ekologie je propojení pohledů ekologického a evolučně-biologického tj. analýza současných i historických vlivů na zákonitosti změn v živé přírodě. Cílem předmětu je objasnit studentům vztahy mezi organizmy a jejich prostředím (abiotickým i biotickým) a procesy generující tyto asociace z pohledu ekologického a podat vysvětlení příčin těchto vztahů z pohledu evolučního.

Výstupy z učení

Na konci tohoto kurzu bude student schopen: interpretovat vztahy a zákonitosti pozorované v živé přírodě a současně vysvětlit mechanizmy a příčiny jejich vzniku. Více specificky bude student schopen definovat selekci a adaptaci, popsat genetické základy evolučních změn, interpretovat znalosti o prostředí organizmů a mezidruhových interakcích z pohledu evoluční ekologie, popsat životní historie organizmů, jejich základní složky a kompromisy, srovnat evoluční a ekologické výhody a nevýhody sexuální a asexuální reprodukce, orientovat se v problematice speciace druhů, nahlížet na druhovou diverzitu z pohledu evolučního biologa, a propojit evoluční ekologii s imunologií.

Osnova

• (1) Úvod do evoluční ekologie – představení náplně studia evoluční ekologie, interaktivní příklady s návaznosti na jednotlivé tematické okruhy přednášky. Přírodní výběr, Darwinův evoluční scénář. Typy selekce. Přirozený a pohlavní výběr. Adaptace a fitness. (2) Genetické základy evoluční změny. Genotyp a fenotyp, genetické interakce. Genetické a environmentální komponenty variability fenotypu. Odhad dědičnosti. Změny frekvence alel v populaci – HW rovnováha, genetický drift, tok genů, selekce. Efektivní velikost populace. Neutrální evoluce molekulární evoluce. Inbreeding. Hybridizace. Udržování genetické variability. Dědičnost fitness. (3) Selekce a adaptace. Jednotky selekce. Co a jak je selektováno?, Selekce pro skupinu vs. Selekce pro jedince. Selekce na úrovni genů – altruizmus, příbuzenská selekce. Faktory limitující adaptaci – tok genů, čas pro objevení adaptace, kompromisy, omezení. Popis selekce. (4) Prostředí organizmů z pohledu evoluční ekologie. Habitat, nika a role organizmů. Koevoluce – další druh jako fluktuující habitat (gen pro gen, specifická koevoluce, guildová koevoluce, závody ve zbrojení, konflikt zájmů v případě mutualizmu). Výběr potravního zdroje – specialista vs. generalista. Dělení zdrojů a kompetice. Interpretace divergence niky. Prostor volný od nepřátel. Evidence kompromisů. Ideální volná distribuce. Strategie sázka na zajištění a averze k riziku, adaptivní převrácení mince. Vztah mezi distribucí a abundancí. Klasifikace habitatů. (5) Evoluční ekologie interagujících druhů. Ekologické a evoluční procesy kompetice. Predace – modely dynamiky v systému predátor-kořist. Co řeší predátor? Hledá predátor kořist optimálně? Teorie maximalizace energie vs. minimalizace času. Strategie kořisti. Parazitizmus – efekt parazita na dynamiku hostitele. Strategie parazita s cílem předcházení extinkce. Koevoluce parazit-hostitel. Mutualistické interakce. (6) Životní historie a kompromisy. Životní historie a fitness – semelparné a iteroparné organizmy. Životní historie – růst a vývoj před reprodukcí, začlenění do reprodukce, distribuce celoživotní reprodukce, život po reprodukčním období. Kompromisy v evoluci životních historií. (7) Reprodukční úsilí a základní složky životních historií. Růst a dosažení pohlavní zralosti, role diapauzy, složité vývojové cykly, optimalizace růstových kroků. Reprodukce semelparních a iteroparních organizmů – reprodukce velký třesk, terminální reprodukční investice. Věk a velikost v období reprodukce – analýza efektů na dosažení pohlavní zralosti, modely optimálního věku dosažení pohlavní zralosti. Počet a velikost potomků – Lackova snůška a odchylky od modelu. Reprodukční délka života a stárnutí. (8) Evoluční ekologie sexuální reprodukce. Evoluční náklady sexuální reprodukce. Výhody sexuální reprodukce. Kdy je asexuální reprodukce výhodná? Nevýhody asexuální reprodukce. Původ sexuální reprodukce. Delimitace pohlaví, hermafroditizmus. Poměr pohlaví v populaci a jeho odchylky. Sexuální selekce – rozdíly v příležitosti pro selekci u samců a samic. Sexuální selekce a evoluce pohlavního dimorfizmu. (9) Ekologický koncept speciace. Problémy s vymezením druhu. Biologický koncept druhu – prezygotické a postzygotické reprodukčně-izolační mechanizmy. Reprodukční izolace v případě sekundárního kontaktu. Role sexuální selekce pro prezygotickou reprodukční izolaci. Mechanizmy alopatrické speciace. Mechanizmy sympatrické speciace. Parapatrická speciace. Radiace druhů. Teorie fyletického gradualizmu vs. přerušované rovnováhy. Rovnováha mezi procesy speciace a extinkce. (10) Diverzita organizmů. Co je příčinou vysoké diverzity? Globální procesy generující diverzitu - diverzita z pohledu velikosti plochy, času kolonizace, energie. Procesy generující diverzitu uvnitř společenstev a regionů. Extinkce – masová, background, antropogenní. Diverzifikace. Efekt člověka na diverzitu. (11) Evoluční imunoekologie – imunita obratlovců, imunitní obranné mechanizmy, imunokompetence. Náklady na imunitu – imunita jako složka životních historií. Investice do imunity vs. investice do reprodukce. Další náklady spojené s imunitní investicí. Evoluce imunitních genů – MHC geny – parazity zprostředkovaná selekce a sexuální selekce, výběr dobrých nebo kompatibilních genů?

Literatura

doporučená literatura
• Stearns S. C. , Hoekstra R. F. 2005. Evolution, an introduction, second edition - Oxford university Press, Oxford
• Gotelli N. J. 1998. A Primer of Ecology, second edition - Sinauer Associates, Inc.
• Fox C. W., Rolf D. A., Fairbain D.J. 2001. Evolutionary Ecology: Concepts and Case Studies. Oxford University Press.
• Moya A., Font E. 2004. Evolution, from molecules to ecosystems - Oxford university press, Oxford.
• Bell G. 2008. Selection, the mechanism of evolution, second edition, Oxford University Press, Oxford.
• Westneat D. F., Fox C. W. 2010. Evolutionary behavioral ecology - Oxford university press, Oxford.
• Rose M. R., Mueller L. D. 2006. Evolution and ecology of the organism. Pearson Prentice Hall, USA.
• POULIN, Robert. Evolutionary ecology of parasites. 2nd ed. Princeton, N.J.: Princeton University Press, 2007, x, 332. ISBN 9780691120850. info
• FLEGR, Jaroslav. Evoluční biologie. Vyd. 1. Praha: Academia, 2005, 559 s. ISBN 8020012702. info

Výukové metody

teoretická příprava

Metody hodnocení

ústní zkouška

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.

Bi7004 Evoluční ekologie

Rozsah

2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.

Vyučující

prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD.
Dodavatelské pracoviště: Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

St 10:00–11:50 D31/238

Předpoklady

Bi6340 Ekologie společ. a makroekol. && Bi8150 Evoluční biologie

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Ekologie (program PřF, D-BI4)
• Zoologie (program PřF, D-BI4)
• Zoologie (program PřF, N-ZOL)

Cíle předmětu

Centrální myšlenkou předmětu evoluční ekologie je propojení pohledů ekologického a evolučně-biologického tj. analýza současných i historických vlivů na zákonitosti změn v živé přírodě. Cílem předmětu je objasnit studentům vztahy mezi organizmy a jejich prostředím (abiotickým i biotickým) a procesy generující tyto asociace z pohledu ekologického a podat vysvětlení příčin těchto vztahů z pohledu evolučního.

Výstupy z učení

Na konci tohoto kurzu bude student schopen: interpretovat vztahy a zákonitosti pozorované v živé přírodě a současně vysvětlit mechanizmy a příčiny jejich vzniku. Více specificky bude student schopen definovat selekci a adaptaci, popsat genetické základy evolučních změn, interpretovat znalosti o prostředí organizmů a mezidruhových interakcích z pohledu evoluční ekologie, popsat životní historie organizmů, jejich základní složky a kompromisy, srovnat evoluční a ekologické výhody a nevýhody sexuální a asexuální reprodukce, orientovat se v problematice speciace druhů, nahlížet na druhovou diverzitu z pohledu evolučního biologa, a propojit evoluční ekologii s imunologií.

Osnova

• (1) Úvod do evoluční ekologie – představení náplně studia evoluční ekologie, interaktivní příklady s návaznosti na jednotlivé tematické okruhy přednášky. Přírodní výběr, Darwinův evoluční scénář. Typy selekce. Přirozený a pohlavní výběr. Adaptace a fitness. (2) Genetické základy evoluční změny. Genotyp a fenotyp, genetické interakce. Genetické a environmentální komponenty variability fenotypu. Odhad dědičnosti. Změny frekvence alel v populaci – HW rovnováha, genetický drift, tok genů, selekce. Efektivní velikost populace. Neutrální evoluce molekulární evoluce. Inbreeding. Hybridizace. Udržování genetické variability. Dědičnost fitness. (3) Selekce a adaptace. Jednotky selekce. Co a jak je selektováno?, Selekce pro skupinu vs. Selekce pro jedince. Selekce na úrovni genů – altruizmus, příbuzenská selekce. Faktory limitující adaptaci – tok genů, čas pro objevení adaptace, kompromisy, omezení. Popis selekce. (4) Prostředí organizmů z pohledu evoluční ekologie. Habitat, nika a role organizmů. Koevoluce – další druh jako fluktuující habitat (gen pro gen, specifická koevoluce, guildová koevoluce, závody ve zbrojení, konflikt zájmů v případě mutualizmu). Výběr potravního zdroje – specialista vs. generalista. Dělení zdrojů a kompetice. Interpretace divergence niky. Prostor volný od nepřátel. Evidence kompromisů. Ideální volná distribuce. Strategie sázka na zajištění a averze k riziku, adaptivní převrácení mince. Vztah mezi distribucí a abundancí. Klasifikace habitatů. (5) Evoluční ekologie interagujících druhů. Ekologické a evoluční procesy kompetice. Predace – modely dynamiky v systému predátor-kořist. Co řeší predátor? Hledá predátor kořist optimálně? Teorie maximalizace energie vs. minimalizace času. Strategie kořisti. Parazitizmus – efekt parazita na dynamiku hostitele. Strategie parazita s cílem předcházení extinkce. Koevoluce parazit-hostitel. Mutualistické interakce. (6) Životní historie a kompromisy. Životní historie a fitness – semelparné a iteroparné organizmy. Životní historie – růst a vývoj před reprodukcí, začlenění do reprodukce, distribuce celoživotní reprodukce, život po reprodukčním období. Kompromisy v evoluci životních historií. (7) Reprodukční úsilí a základní složky životních historií. Růst a dosažení pohlavní zralosti, role diapauzy, složité vývojové cykly, optimalizace růstových kroků. Reprodukce semelparních a iteroparních organizmů – reprodukce velký třesk, terminální reprodukční investice. Věk a velikost v období reprodukce – analýza efektů na dosažení pohlavní zralosti, modely optimálního věku dosažení pohlavní zralosti. Počet a velikost potomků – Lackova snůška a odchylky od modelu. Reprodukční délka života a stárnutí. (8) Evoluční ekologie sexuální reprodukce. Evoluční náklady sexuální reprodukce. Výhody sexuální reprodukce. Kdy je asexuální reprodukce výhodná? Nevýhody asexuální reprodukce. Původ sexuální reprodukce. Delimitace pohlaví, hermafroditizmus. Poměr pohlaví v populaci a jeho odchylky. Sexuální selekce – rozdíly v příležitosti pro selekci u samců a samic. Sexuální selekce a evoluce pohlavního dimorfizmu. (9) Ekologický koncept speciace. Problémy s vymezením druhu. Biologický koncept druhu – prezygotické a postzygotické reprodukčně-izolační mechanizmy. Reprodukční izolace v případě sekundárního kontaktu. Role sexuální selekce pro prezygotickou reprodukční izolaci. Mechanizmy alopatrické speciace. Mechanizmy sympatrické speciace. Parapatrická speciace. Radiace druhů. Teorie fyletického gradualizmu vs. přerušované rovnováhy. Rovnováha mezi procesy speciace a extinkce. (10) Diverzita organizmů. Co je příčinou vysoké diverzity? Globální procesy generující diverzitu - diverzita z pohledu velikosti plochy, času kolonizace, energie. Procesy generující diverzitu uvnitř společenstev a regionů. Extinkce – masová, background, antropogenní. Diverzifikace. Efekt člověka na diverzitu. (11) Evoluční imunoekologie – imunita obratlovců, imunitní obranné mechanizmy, imunokompetence. Náklady na imunitu – imunita jako složka životních historií. Investice do imunity vs. investice do reprodukce. Další náklady spojené s imunitní investicí. Evoluce imunitních genů – MHC geny – parazity zprostředkovaná selekce a sexuální selekce, výběr dobrých nebo kompatibilních genů?

Literatura

doporučená literatura
• Stearns S. C. , Hoekstra R. F. 2005. Evolution, an introduction, second edition - Oxford university Press, Oxford
• Gotelli N. J. 1998. A Primer of Ecology, second edition - Sinauer Associates, Inc.
• Fox C. W., Rolf D. A., Fairbain D.J. 2001. Evolutionary Ecology: Concepts and Case Studies. Oxford University Press.
• Moya A., Font E. 2004. Evolution, from molecules to ecosystems - Oxford university press, Oxford.
• Bell G. 2008. Selection, the mechanism of evolution, second edition, Oxford University Press, Oxford.
• Westneat D. F., Fox C. W. 2010. Evolutionary behavioral ecology - Oxford university press, Oxford.
• Rose M. R., Mueller L. D. 2006. Evolution and ecology of the organism. Pearson Prentice Hall, USA.
• POULIN, Robert. Evolutionary ecology of parasites. 2nd ed. Princeton, N.J.: Princeton University Press, 2007, x, 332. ISBN 9780691120850. info
• FLEGR, Jaroslav. Evoluční biologie. Vyd. 1. Praha: Academia, 2005, 559 s. ISBN 8020012702. info

Výukové metody

teoretická příprava

Metody hodnocení

ústní zkouška

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.

Bi7004 Evoluční ekologie

Rozsah

2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.

Vyučující

prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD.
Dodavatelské pracoviště: Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Čt 10:00–11:50 D31/238

Předpoklady

Bi6340 Ekologie společ. a makroekol. && Bi8150 Evoluční biologie

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Ekologie (program PřF, D-BI4)
• Zoologie (program PřF, D-BI4)
• Zoologie (program PřF, N-ZOL)

Cíle předmětu

Centrální myšlenkou předmětu evoluční ekologie je propojení pohledů ekologického a evolučně-biologického tj. analýza současných i historických vlivů na zákonitosti změn v živé přírodě. Cílem předmětu je objasnit studentům vztahy mezi organizmy a jejich prostředím (abiotickým i biotickým) a procesy generující tyto asociace z pohledu ekologického a podat vysvětlení příčin těchto vztahů z pohledu evolučního.

Výstupy z učení

Na konci tohoto kurzu bude student schopen: interpretovat vztahy a zákonitosti pozorované v živé přírodě a současně vysvětlit mechanizmy a příčiny jejich vzniku. Více specificky bude student schopen definovat selekci a adaptaci, popsat genetické základy evolučních změn, interpretovat znalosti o prostředí organizmů a mezidruhových interakcích z pohledu evoluční ekologie, popsat životní historie organizmů, jejich základní složky a kompromisy, srovnat evoluční a ekologické výhody a nevýhody sexuální a asexuální reprodukce, orientovat se v problematice speciace druhů, nahlížet na druhovou diverzitu z pohledu evolučního biologa, a propojit evoluční ekologii s imunologií.

Osnova

• (1) Úvod do evoluční ekologie – představení náplně studia evoluční ekologie, interaktivní příklady s návaznosti na jednotlivé tematické okruhy přednášky. Přírodní výběr, Darwinův evoluční scénář. Typy selekce. Přirozený a pohlavní výběr. Adaptace a fitness. (2) Genetické základy evoluční změny. Genotyp a fenotyp, genetické interakce. Genetické a environmentální komponenty variability fenotypu. Odhad dědičnosti. Změny frekvence alel v populaci – HW rovnováha, genetický drift, tok genů, selekce. Efektivní velikost populace. Neutrální evoluce molekulární evoluce. Inbreeding. Hybridizace. Udržování genetické variability. Dědičnost fitness. (3) Selekce a adaptace. Jednotky selekce. Co a jak je selektováno?, Selekce pro skupinu vs. Selekce pro jedince. Selekce na úrovni genů – altruizmus, příbuzenská selekce. Faktory limitující adaptaci – tok genů, čas pro objevení adaptace, kompromisy, omezení. Popis selekce. (4) Prostředí organizmů z pohledu evoluční ekologie. Habitat, nika a role organizmů. Koevoluce – další druh jako fluktuující habitat (gen pro gen, specifická koevoluce, guildová koevoluce, závody ve zbrojení, konflikt zájmů v případě mutualizmu). Výběr potravního zdroje – specialista vs. generalista. Dělení zdrojů a kompetice. Interpretace divergence niky. Prostor volný od nepřátel. Evidence kompromisů. Ideální volná distribuce. Strategie sázka na zajištění a averze k riziku, adaptivní převrácení mince. Vztah mezi distribucí a abundancí. Klasifikace habitatů. (5) Evoluční ekologie interagujících druhů. Ekologické a evoluční procesy kompetice. Predace – modely dynamiky v systému predátor-kořist. Co řeší predátor? Hledá predátor kořist optimálně? Teorie maximalizace energie vs. minimalizace času. Strategie kořisti. Parazitizmus – efekt parazita na dynamiku hostitele. Strategie parazita s cílem předcházení extinkce. Koevoluce parazit-hostitel. Mutualistické interakce. (6) Životní historie a kompromisy. Životní historie a fitness – semelparné a iteroparné organizmy. Životní historie – růst a vývoj před reprodukcí, začlenění do reprodukce, distribuce celoživotní reprodukce, život po reprodukčním období. Kompromisy v evoluci životních historií. (7) Reprodukční úsilí a základní složky životních historií. Růst a dosažení pohlavní zralosti, role diapauzy, složité vývojové cykly, optimalizace růstových kroků. Reprodukce semelparních a iteroparních organizmů – reprodukce velký třesk, terminální reprodukční investice. Věk a velikost v období reprodukce – analýza efektů na dosažení pohlavní zralosti, modely optimálního věku dosažení pohlavní zralosti. Počet a velikost potomků – Lackova snůška a odchylky od modelu. Reprodukční délka života a stárnutí. (8) Evoluční ekologie sexuální reprodukce. Evoluční náklady sexuální reprodukce. Výhody sexuální reprodukce. Kdy je asexuální reprodukce výhodná? Nevýhody asexuální reprodukce. Původ sexuální reprodukce. Delimitace pohlaví, hermafroditizmus. Poměr pohlaví v populaci a jeho odchylky. Sexuální selekce – rozdíly v příležitosti pro selekci u samců a samic. Sexuální selekce a evoluce pohlavního dimorfizmu. (9) Ekologický koncept speciace. Problémy s vymezením druhu. Biologický koncept druhu – prezygotické a postzygotické reprodukčně-izolační mechanizmy. Reprodukční izolace v případě sekundárního kontaktu. Role sexuální selekce pro prezygotickou reprodukční izolaci. Mechanizmy alopatrické speciace. Mechanizmy sympatrické speciace. Parapatrická speciace. Radiace druhů. Teorie fyletického gradualizmu vs. přerušované rovnováhy. Rovnováha mezi procesy speciace a extinkce. (10) Diverzita organizmů. Co je příčinou vysoké diverzity? Globální procesy generující diverzitu - diverzita z pohledu velikosti plochy, času kolonizace, energie. Procesy generující diverzitu uvnitř společenstev a regionů. Extinkce – masová, background, antropogenní. Diverzifikace. Efekt člověka na diverzitu. (11) Evoluční imunoekologie – imunita obratlovců, imunitní obranné mechanizmy, imunokompetence. Náklady na imunitu – imunita jako složka životních historií. Investice do imunity vs. investice do reprodukce. Další náklady spojené s imunitní investicí. Evoluce imunitních genů – MHC geny – parazity zprostředkovaná selekce a sexuální selekce, výběr dobrých nebo kompatibilních genů?

Literatura

doporučená literatura
• Stearns S. C. , Hoekstra R. F. 2005. Evolution, an introduction, second edition - Oxford university Press, Oxford
• Gotelli N. J. 1998. A Primer of Ecology, second edition - Sinauer Associates, Inc.
• Fox C. W., Rolf D. A., Fairbain D.J. 2001. Evolutionary Ecology: Concepts and Case Studies. Oxford University Press.
• Moya A., Font E. 2004. Evolution, from molecules to ecosystems - Oxford university press, Oxford.
• Bell G. 2008. Selection, the mechanism of evolution, second edition, Oxford University Press, Oxford.
• Westneat D. F., Fox C. W. 2010. Evolutionary behavioral ecology - Oxford university press, Oxford.
• Rose M. R., Mueller L. D. 2006. Evolution and ecology of the organism. Pearson Prentice Hall, USA.
• POULIN, Robert. Evolutionary ecology of parasites. 2nd ed. Princeton, N.J.: Princeton University Press, 2007, x, 332. ISBN 9780691120850. info
• FLEGR, Jaroslav. Evoluční biologie. Vyd. 1. Praha: Academia, 2005, 559 s. ISBN 8020012702. info

Výukové metody

teoretická příprava

Metody hodnocení

ústní zkouška

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.

Bi7004 Evoluční ekologie

Rozsah

2/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.

Vyučující

prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD.
Dodavatelské pracoviště: Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Po 17. 9. až Pá 14. 12. Čt 10:00–11:50 D31/238

Předpoklady

Bi6340 Ekologie společ. a makroekol. && Bi8150 Evoluční biologie

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 10 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Evoluční ekologie představuje studium selektivních tlaků kladených prostředím na organismy a evolučních odpovědí k těmto tlakům. Centrálním tématem kurzu „Evoluční ekologie“ je analýza biologie druhů z pohledu evoluční biologie a ekologie.

Osnova

• 1. Darwinova biologie – ekologie a evoluce, evoluční stromy. Variabilita, její příčiny a evoluční význam variability. 2. Mechanizmy evoluce – přírodní selekce, molekulárni evoluce, adaptace, fenotypická plasticita, speciace a extinkce 3. Ekologické a biogeografické aspekty evolučních změn. 4. Evoluce a ekologie biodiverzity. Diverzifikace. 5. Fyzikální ekologie organizmů – vliv těploty a světla na funkce organizmů, adaptace organizmů, velikost a tvar organizmů – vliv na strukturu a funkci organizmů, alometrické metody. Jak organizmy pracují? – mechanizmy regulace, osmoregulace, látkové výměny a transportu látek. Evoluce fyzikálních systému organizmů, 6. Evoluce hlavních složek životních historií – teorie alokace energie na principu kompromisů, fitnesss a životní složky, vek a velikost v období pohlavní zralosti, velikost a počet potomků, evoluce stárnutí, životní cykly, poměry pohlaví a sexuální alokace, ekologická specializace a generalizace. 7. Fylogeneze a její aplikace v evolučně-ekologických studiích. Princípy makroevoluce -fylogenetický strom, komparativní metody, metoda fylogeneticky nezávislých kontrastů. Integrace micro- a makroevoluce – koevoluce, evoluce člověka – historie ovlivňující onemocnění, selekce a virulence. 8. Vnitrodruhové interakce z pohledu evolučně-ekologického. Evoluce a ekologie pohlavní chování (sexuální selekce, sexuální konflikt, strategie párování, sociální evoluce). Behaviorální ekologie a speciace. 9. Potravní chování, evoluční ekologie pohybu. 10. Mezidruhové interakce z pohledu evolučně-ekologického. Evoluce ekologické niky. Numerická a funkční odpověď kompetice, evoluční restrikce niky, koexistence druhů. 11. Evoluce a ekologie sexu – strategie rozmnožování, role sexuální ornamentace v sexuální selekci, hypotéze handicapu, hypotéze handicapu imunokompetence, hypotéze ochrany spermii, koexistence pohlavního a nepohlavního rozmnožování, Červená královna. 12. Parazitizmus v evoluční ekologii - evoluce ekologických charakterů parazitů, původ parazitizmu, speciace a diverzifikace parazitů, strategie využívaní hostitele, agregace parazitů - ekologické příčiny a evoluční následky 13. Imunita z pohledu evolučně-ekologického. Imunitní geny a investice do imunity. Imunita versus reprodukce. Parazity zprostředkovaná selekce MHC genů, role MHC v sexuální selekci.

Literatura

povinná literatura
• FLEGR, Jaroslav. Evoluční biologie. Vyd. 1. Praha: Academia, 2005, 559 s. ISBN 8020012702. info

doporučená literatura
• Fox C. W., Rolf D. A., Fairbain D.J. 2001. Evolutionary Ecology: Concepts and Case Studies. Oxford University Press.
• Stearns S. C. , Hoekstra R. F. 2005. Evolution, an introduction, second edition - Oxford university Press, Oxford
• Rose M. R., Mueller L. D. 2006. Evolution and ecology of the organism. Pearson Prentice Hall, USA.
• Moya A., Font E. 2004. Evolution, from molecules to ecosystems - Oxford university press, Oxford.
• Gotelli N. J. 1998. A Primer of Ecology, second edition - Sinauer Associates, Inc.
• Westneat D. F., Fox C. W. 2010. Evolutionary behavioral ecology - Oxford university press, Oxford.
• Bell G. 2008. Selection, the mechanism of evolution, second edition, Oxford University Press, Oxford.
• POULIN, Robert. Evolutionary ecology of parasites. 2nd ed. Princeton, N.J.: Princeton University Press, 2007, x, 332. ISBN 9780691120850. info

Výukové metody

teoretická příprava

Metody hodnocení

ústní zkouška

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.

Bi7004 Evoluční ekologie

Rozsah

2/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.

Vyučující

prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD.
Dodavatelské pracoviště: Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Po 18. 9. až Pá 15. 12. Čt 9:00–10:50 D31/238

Předpoklady

Bi6340 Ekologie společ. a makroekol. && Bi8150 Evoluční biologie

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 10 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Evoluční ekologie představuje studium selektivních tlaků kladených prostředím na organismy a evolučních odpovědí k těmto tlakům. Centrálním tématem kurzu „Evoluční ekologie“ je analýza biologie druhů z pohledu evoluční biologie a ekologie.

Osnova

• 1. Darwinova biologie – ekologie a evoluce, evoluční stromy. Variabilita, její příčiny a evoluční význam variability. 2. Mechanizmy evoluce – přírodní selekce, molekulárni evoluce, adaptace, fenotypická plasticita, speciace a extinkce 3. Ekologické a biogeografické aspekty evolučních změn. 4. Evoluce a ekologie biodiverzity. Diverzifikace. 5. Fyzikální ekologie organizmů – vliv těploty a světla na funkce organizmů, adaptace organizmů, velikost a tvar organizmů – vliv na strukturu a funkci organizmů, alometrické metody. Jak organizmy pracují? – mechanizmy regulace, osmoregulace, látkové výměny a transportu látek. Evoluce fyzikálních systému organizmů, 6. Evoluce hlavních složek životních historií – teorie alokace energie na principu kompromisů, fitnesss a životní složky, vek a velikost v období pohlavní zralosti, velikost a počet potomků, evoluce stárnutí, životní cykly, poměry pohlaví a sexuální alokace, ekologická specializace a generalizace. 7. Fylogeneze a její aplikace v evolučně-ekologických studiích. Princípy makroevoluce -fylogenetický strom, komparativní metody, metoda fylogeneticky nezávislých kontrastů. Integrace micro- a makroevoluce – koevoluce, evoluce člověka – historie ovlivňující onemocnění, selekce a virulence. 8. Vnitrodruhové interakce z pohledu evolučně-ekologického. Evoluce a ekologie pohlavní chování (sexuální selekce, sexuální konflikt, strategie párování, sociální evoluce). Behaviorální ekologie a speciace. 9. Potravní chování, evoluční ekologie pohybu. 10. Mezidruhové interakce z pohledu evolučně-ekologického. Evoluce ekologické niky. Numerická a funkční odpověď kompetice, evoluční restrikce niky, koexistence druhů. 11. Evoluce a ekologie sexu – strategie rozmnožování, role sexuální ornamentace v sexuální selekci, hypotéze handicapu, hypotéze handicapu imunokompetence, hypotéze ochrany spermii, koexistence pohlavního a nepohlavního rozmnožování, Červená královna. 12. Parazitizmus v evoluční ekologii - evoluce ekologických charakterů parazitů, původ parazitizmu, speciace a diverzifikace parazitů, strategie využívaní hostitele, agregace parazitů - ekologické příčiny a evoluční následky 13. Imunita z pohledu evolučně-ekologického. Imunitní geny a investice do imunity. Imunita versus reprodukce. Parazity zprostředkovaná selekce MHC genů, role MHC v sexuální selekci.

Literatura

povinná literatura
• FLEGR, Jaroslav. Evoluční biologie. Vyd. 1. Praha: Academia, 2005, 559 s. ISBN 8020012702. info

doporučená literatura
• Fox C. W., Rolf D. A., Fairbain D.J. 2001. Evolutionary Ecology: Concepts and Case Studies. Oxford University Press.
• Stearns S. C. , Hoekstra R. F. 2005. Evolution, an introduction, second edition - Oxford university Press, Oxford
• Rose M. R., Mueller L. D. 2006. Evolution and ecology of the organism. Pearson Prentice Hall, USA.
• Moya A., Font E. 2004. Evolution, from molecules to ecosystems - Oxford university press, Oxford.
• Gotelli N. J. 1998. A Primer of Ecology, second edition - Sinauer Associates, Inc.
• Westneat D. F., Fox C. W. 2010. Evolutionary behavioral ecology - Oxford university press, Oxford.
• Bell G. 2008. Selection, the mechanism of evolution, second edition, Oxford University Press, Oxford.
• POULIN, Robert. Evolutionary ecology of parasites. 2nd ed. Princeton, N.J.: Princeton University Press, 2007, x, 332. ISBN 9780691120850. info

Výukové metody

teoretická příprava

Metody hodnocení

ústní zkouška

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.

Bi7004 Evoluční ekologie

Rozsah

2/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.

Vyučující

prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD.
Dodavatelské pracoviště: Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Po 19. 9. až Ne 18. 12. Po 8:00–9:50 D31/238

Předpoklady

Bi6340 Ekologie společ. a makroekol. && Bi8150 Evoluční biologie

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 10 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Evoluční ekologie představuje studium selektivních tlaků kladených prostředím na organismy a evolučních odpovědí k těmto tlakům. Centrálním tématem kurzu „Evoluční ekologie“ je analýza biologie druhů z pohledu evoluční biologie a ekologie.

Osnova

• 1. Darwinova biologie – ekologie a evoluce, evoluční stromy. Variabilita, její příčiny a evoluční význam variability. 2. Mechanizmy evoluce – přírodní selekce, molekulárni evoluce, adaptace, fenotypická plasticita, speciace a extinkce 3. Ekologické a biogeografické aspekty evolučních změn. 4. Evoluce a ekologie biodiverzity. Diverzifikace. 5. Fyzikální ekologie organizmů – vliv těploty a světla na funkce organizmů, adaptace organizmů, velikost a tvar organizmů – vliv na strukturu a funkci organizmů, alometrické metody. Jak organizmy pracují? – mechanizmy regulace, osmoregulace, látkové výměny a transportu látek. Evoluce fyzikálních systému organizmů, 6. Evoluce hlavních složek životních historií – teorie alokace energie na principu kompromisů, fitnesss a životní složky, vek a velikost v období pohlavní zralosti, velikost a počet potomků, evoluce stárnutí, životní cykly, poměry pohlaví a sexuální alokace, ekologická specializace a generalizace. 7. Fylogeneze a její aplikace v evolučně-ekologických studiích. Princípy makroevoluce -fylogenetický strom, komparativní metody, metoda fylogeneticky nezávislých kontrastů. Integrace micro- a makroevoluce – koevoluce, evoluce člověka – historie ovlivňující onemocnění, selekce a virulence. 8. Vnitrodruhové interakce z pohledu evolučně-ekologického. Evoluce a ekologie pohlavní chování (sexuální selekce, sexuální konflikt, strategie párování, sociální evoluce). Behaviorální ekologie a speciace. 9. Potravní chování, evoluční ekologie pohybu. 10. Mezidruhové interakce z pohledu evolučně-ekologického. Evoluce ekologické niky. Numerická a funkční odpověď kompetice, evoluční restrikce niky, koexistence druhů. 11. Evoluce a ekologie sexu – strategie rozmnožování, role sexuální ornamentace v sexuální selekci, hypotéze handicapu, hypotéze handicapu imunokompetence, hypotéze ochrany spermii, koexistence pohlavního a nepohlavního rozmnožování, Červená královna. 12. Parazitizmus v evoluční ekologii - evoluce ekologických charakterů parazitů, původ parazitizmu, speciace a diverzifikace parazitů, strategie využívaní hostitele, agregace parazitů - ekologické příčiny a evoluční následky 13. Imunita z pohledu evolučně-ekologického. Imunitní geny a investice do imunity. Imunita versus reprodukce. Parazity zprostředkovaná selekce MHC genů, role MHC v sexuální selekci.

Literatura

povinná literatura
• FLEGR, Jaroslav. Evoluční biologie. Vyd. 1. Praha: Academia, 2005, 559 s. ISBN 8020012702. info

doporučená literatura
• Fox C. W., Rolf D. A., Fairbain D.J. 2001. Evolutionary Ecology: Concepts and Case Studies. Oxford University Press.
• Stearns S. C. , Hoekstra R. F. 2005. Evolution, an introduction, second edition - Oxford university Press, Oxford
• Rose M. R., Mueller L. D. 2006. Evolution and ecology of the organism. Pearson Prentice Hall, USA.
• Moya A., Font E. 2004. Evolution, from molecules to ecosystems - Oxford university press, Oxford.
• Gotelli N. J. 1998. A Primer of Ecology, second edition - Sinauer Associates, Inc.
• Westneat D. F., Fox C. W. 2010. Evolutionary behavioral ecology - Oxford university press, Oxford.
• Bell G. 2008. Selection, the mechanism of evolution, second edition, Oxford University Press, Oxford.
• POULIN, Robert. Evolutionary ecology of parasites. 2nd ed. Princeton, N.J.: Princeton University Press, 2007, x, 332. ISBN 9780691120850. info

Výukové metody

teoretická příprava

Metody hodnocení

ústní zkouška

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.

Bi7004 Evoluční ekologie

Rozsah

2/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.

Vyučující

prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD.
Dodavatelské pracoviště: Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Út 10:00–11:50 D31/238

Předpoklady

Bi6340 Ekologie společ. a makroekol. && Bi8150 Evoluční biologie

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 10 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Evoluční ekologie představuje studium selektivních tlaků kladených prostředím na organismy a evolučních odpovědí k těmto tlakům. Centrálním tématem kurzu „Evoluční ekologie“ je analýza biologie druhů z pohledu evoluční biologie a ekologie.

Osnova

• 1. Darwinova biologie – ekologie a evoluce, evoluční stromy. Variabilita, její příčiny a evoluční význam variability. 2. Mechanizmy evoluce – přírodní selekce, molekulárni evoluce, adaptace, fenotypická plasticita, speciace a extinkce 3. Ekologické a biogeografické aspekty evolučních změn. 4. Evoluce a ekologie biodiverzity. Diverzifikace. 5. Fyzikální ekologie organizmů – vliv těploty a světla na funkce organizmů, adaptace organizmů, velikost a tvar organizmů – vliv na strukturu a funkci organizmů, alometrické metody. Jak organizmy pracují? – mechanizmy regulace, osmoregulace, látkové výměny a transportu látek. Evoluce fyzikálních systému organizmů, 6. Evoluce hlavních složek životních historií – teorie alokace energie na principu kompromisů, fitnesss a životní složky, vek a velikost v období pohlavní zralosti, velikost a počet potomků, evoluce stárnutí, životní cykly, poměry pohlaví a sexuální alokace, ekologická specializace a generalizace. 7. Fylogeneze a její aplikace v evolučně-ekologických studiích. Princípy makroevoluce -fylogenetický strom, komparativní metody, metoda fylogeneticky nezávislých kontrastů. Integrace micro- a makroevoluce – koevoluce, evoluce člověka – historie ovlivňující onemocnění, selekce a virulence. 8. Vnitrodruhové interakce z pohledu evolučně-ekologického. Evoluce a ekologie pohlavní chování (sexuální selekce, sexuální konflikt, strategie párování, sociální evoluce). Behaviorální ekologie a speciace. 9. Potravní chování, evoluční ekologie pohybu. 10. Mezidruhové interakce z pohledu evolučně-ekologického. Evoluce ekologické niky. Numerická a funkční odpověď kompetice, evoluční restrikce niky, koexistence druhů. 11. Evoluce a ekologie sexu – strategie rozmnožování, role sexuální ornamentace v sexuální selekci, hypotéze handicapu, hypotéze handicapu imunokompetence, hypotéze ochrany spermii, koexistence pohlavního a nepohlavního rozmnožování, Červená královna. 12. Parazitizmus v evoluční ekologii - evoluce ekologických charakterů parazitů, původ parazitizmu, speciace a diverzifikace parazitů, strategie využívaní hostitele, agregace parazitů - ekologické příčiny a evoluční následky 13. Imunita z pohledu evolučně-ekologického. Imunitní geny a investice do imunity. Imunita versus reprodukce. Parazity zprostředkovaná selekce MHC genů, role MHC v sexuální selekci.

Literatura

povinná literatura
• FLEGR, Jaroslav. Evoluční biologie. Vyd. 1. Praha: Academia, 2005, 559 s. ISBN 8020012702. info

doporučená literatura
• Fox C. W., Rolf D. A., Fairbain D.J. 2001. Evolutionary Ecology: Concepts and Case Studies. Oxford University Press.
• Stearns S. C. , Hoekstra R. F. 2005. Evolution, an introduction, second edition - Oxford university Press, Oxford
• Rose M. R., Mueller L. D. 2006. Evolution and ecology of the organism. Pearson Prentice Hall, USA.
• Moya A., Font E. 2004. Evolution, from molecules to ecosystems - Oxford university press, Oxford.
• Gotelli N. J. 1998. A Primer of Ecology, second edition - Sinauer Associates, Inc.
• Westneat D. F., Fox C. W. 2010. Evolutionary behavioral ecology - Oxford university press, Oxford.
• Bell G. 2008. Selection, the mechanism of evolution, second edition, Oxford University Press, Oxford.
• POULIN, Robert. Evolutionary ecology of parasites. 2nd ed. Princeton, N.J.: Princeton University Press, 2007, x, 332. ISBN 9780691120850. info

Výukové metody

teoretická příprava

Metody hodnocení

ústní zkouška

Další komentáře

Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.

Bi7004 Evoluční ekologie

Předmět se v období podzim 2014 nevypisuje.

Rozsah

2/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.

Vyučující

prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD.
Dodavatelské pracoviště: Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Bi6340 Ekologie společ. a makroekol. && Bi8150 Evoluční biologie

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 10 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Evoluční ekologie představuje studium selektivních tlaků kladených prostředím na organismy a evolučních odpovědí k těmto tlakům. Centrálním tématem kurzu „Evoluční ekologie“ je analýza biologie druhů z pohledu evoluční biologie a ekologie.

Osnova

• 1. Darwinova biologie – ekologie a evoluce, evoluční stromy. Variabilita, její příčiny a evoluční význam variability. 2. Mechanizmy evoluce – přírodní selekce, molekulárni evoluce, adaptace, fenotypická plasticita, speciace a extinkce 3. Ekologické a biogeografické aspekty evolučních změn. 4. Evoluce a ekologie biodiverzity. Diverzifikace. 5. Fyzikální ekologie organizmů – vliv těploty a světla na funkce organizmů, adaptace organizmů, velikost a tvar organizmů – vliv na strukturu a funkci organizmů, alometrické metody. Jak organizmy pracují? – mechanizmy regulace, osmoregulace, látkové výměny a transportu látek. Evoluce fyzikálních systému organizmů, 6. Evoluce hlavních složek životních historií – teorie alokace energie na principu kompromisů, fitnesss a životní složky, vek a velikost v období pohlavní zralosti, velikost a počet potomků, evoluce stárnutí, životní cykly, poměry pohlaví a sexuální alokace, ekologická specializace a generalizace. 7. Fylogeneze a její aplikace v evolučně-ekologických studiích. Princípy makroevoluce -fylogenetický strom, komparativní metody, metoda fylogeneticky nezávislých kontrastů. Integrace micro- a makroevoluce – koevoluce, evoluce člověka – historie ovlivňující onemocnění, selekce a virulence. 8. Vnitrodruhové interakce z pohledu evolučně-ekologického. Evoluce a ekologie pohlavní chování (sexuální selekce, sexuální konflikt, strategie párování, sociální evoluce). Behaviorální ekologie a speciace. 9. Potravní chování, evoluční ekologie pohybu. 10. Mezidruhové interakce z pohledu evolučně-ekologického. Evoluce ekologické niky. Numerická a funkční odpověď kompetice, evoluční restrikce niky, koexistence druhů. 11. Evoluce a ekologie sexu – strategie rozmnožování, role sexuální ornamentace v sexuální selekci, hypotéze handicapu, hypotéze handicapu imunokompetence, hypotéze ochrany spermii, koexistence pohlavního a nepohlavního rozmnožování, Červená královna. 12. Parazitizmus v evoluční ekologii - evoluce ekologických charakterů parazitů, původ parazitizmu, speciace a diverzifikace parazitů, strategie využívaní hostitele, agregace parazitů - ekologické příčiny a evoluční následky 13. Imunita z pohledu evolučně-ekologického. Imunitní geny a investice do imunity. Imunita versus reprodukce. Parazity zprostředkovaná selekce MHC genů, role MHC v sexuální selekci.

Literatura

povinná literatura
• FLEGR, Jaroslav. Evoluční biologie. Vyd. 1. Praha: Academia, 2005, 559 s. ISBN 8020012702. info

doporučená literatura
• Fox C. W., Rolf D. A., Fairbain D.J. 2001. Evolutionary Ecology: Concepts and Case Studies. Oxford University Press.
• Stearns S. C. , Hoekstra R. F. 2005. Evolution, an introduction, second edition - Oxford university Press, Oxford
• Rose M. R., Mueller L. D. 2006. Evolution and ecology of the organism. Pearson Prentice Hall, USA.
• Moya A., Font E. 2004. Evolution, from molecules to ecosystems - Oxford university press, Oxford.
• Gotelli N. J. 1998. A Primer of Ecology, second edition - Sinauer Associates, Inc.
• Westneat D. F., Fox C. W. 2010. Evolutionary behavioral ecology - Oxford university press, Oxford.
• Bell G. 2008. Selection, the mechanism of evolution, second edition, Oxford University Press, Oxford.
• POULIN, Robert. Evolutionary ecology of parasites. 2nd ed. Princeton, N.J.: Princeton University Press, 2007, x, 332. ISBN 9780691120850. info

Výukové metody

teoretická příprava

Metody hodnocení

ústní zkouška

Další komentáře

Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

Bi7004 Evoluční ekologie

Předmět se v období podzim 2013 nevypisuje.

Rozsah

2/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.

Vyučující

prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD.
Dodavatelské pracoviště: Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Bi6340 Ekologie společ. a makroekol. && Bi8150 Evoluční biologie

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 10 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Evoluční ekologie představuje studium selektivních tlaků kladených prostředím na organismy a evolučních odpovědí k těmto tlakům. Centrálním tématem kurzu „Evoluční ekologie“ je analýza biologie druhů z pohledu evoluční biologie a ekologie.

Osnova

• 1. Darwinova biologie – ekologie a evoluce, evoluční stromy. Variabilita, její příčiny a evoluční význam variability. 2. Mechanizmy evoluce – přírodní selekce, molekulárni evoluce, adaptace, fenotypická plasticita, speciace a extinkce 3. Ekologické a biogeografické aspekty evolučních změn. 4. Evoluce a ekologie biodiverzity. Diverzifikace. 5. Fyzikální ekologie organizmů – vliv těploty a světla na funkce organizmů, adaptace organizmů, velikost a tvar organizmů – vliv na strukturu a funkci organizmů, alometrické metody. Jak organizmy pracují? – mechanizmy regulace, osmoregulace, látkové výměny a transportu látek. Evoluce fyzikálních systému organizmů, 6. Evoluce hlavních složek životních historií – teorie alokace energie na principu kompromisů, fitnesss a životní složky, vek a velikost v období pohlavní zralosti, velikost a počet potomků, evoluce stárnutí, životní cykly, poměry pohlaví a sexuální alokace, ekologická specializace a generalizace. 7. Fylogeneze a její aplikace v evolučně-ekologických studiích. Princípy makroevoluce -fylogenetický strom, komparativní metody, metoda fylogeneticky nezávislých kontrastů. Integrace micro- a makroevoluce – koevoluce, evoluce člověka – historie ovlivňující onemocnění, selekce a virulence. 8. Vnitrodruhové interakce z pohledu evolučně-ekologického. Evoluce a ekologie pohlavní chování (sexuální selekce, sexuální konflikt, strategie párování, sociální evoluce). Behaviorální ekologie a speciace. 9. Potravní chování, evoluční ekologie pohybu. 10. Mezidruhové interakce z pohledu evolučně-ekologického. Evoluce ekologické niky. Numerická a funkční odpověď kompetice, evoluční restrikce niky, koexistence druhů. 11. Evoluce a ekologie sexu – strategie rozmnožování, role sexuální ornamentace v sexuální selekci, hypotéze handicapu, hypotéze handicapu imunokompetence, hypotéze ochrany spermii, koexistence pohlavního a nepohlavního rozmnožování, Červená královna. 12. Parazitizmus v evoluční ekologii - evoluce ekologických charakterů parazitů, původ parazitizmu, speciace a diverzifikace parazitů, strategie využívaní hostitele, agregace parazitů - ekologické příčiny a evoluční následky 13. Imunita z pohledu evolučně-ekologického. Imunitní geny a investice do imunity. Imunita versus reprodukce. Parazity zprostředkovaná selekce MHC genů, role MHC v sexuální selekci.

Literatura

povinná literatura
• FLEGR, Jaroslav. Evoluční biologie. Vyd. 1. Praha: Academia, 2005, 559 s. ISBN 8020012702. info

doporučená literatura
• Westneat D. F., Fox C. W. 2010. Evolutionary behavioral ecology - Oxford university press, Oxford.
• Fox C. W., Rolf D. A., Fairbain D.J. 2001. Evolutionary Ecology: Concepts and Case Studies. Oxford University Press.
• Gotelli N. J. 1998. A Primer of Ecology, second edition - Sinauer Associates, Inc.
• Rose M. R., Mueller L. D. 2006. Evolution and ecology of the organism. Pearson Prentice Hall, USA.
• Bell G. 2008. Selection, the mechanism of evolution, second edition, Oxford University Press, Oxford.
• Moya A., Font E. 2004. Evolution, from molecules to ecosystems - Oxford university press, Oxford.
• Stearns S. C. , Hoekstra R. F. 2005. Evolution, an introduction, second edition - Oxford university Press, Oxford
• POULIN, Robert. Evolutionary ecology of parasites. 2nd ed. Princeton, N.J.: Princeton University Press, 2007, x, 332. ISBN 9780691120850. info

Výukové metody

teoretická příprava

Metody hodnocení

ústní zkouška

Další komentáře

Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

Bi7004 Evoluční ekologie

Předmět se v období podzim 2012 nevypisuje.

Rozsah

2/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.

Vyučující

prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD.
Dodavatelské pracoviště: Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Bi6340 Ekologie společ. a makroekol. && Bi8150 Evoluční biologie

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 10 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Evoluční ekologie představuje studium selektivních tlaků kladených prostředím na organismy a evolučních odpovědí k těmto tlakům. Centrálním tématem kurzu „Evoluční ekologie“ je analýza biologie druhů z pohledu evoluční biologie a ekologie.

Osnova

• 1. Darwinova biologie – ekologie a evoluce, evoluční stromy. Variabilita, její příčiny a evoluční význam variability. 2. Mechanizmy evoluce – přírodní selekce, molekulárni evoluce, adaptace, fenotypická plasticita, speciace a extinkce 3. Ekologické a biogeografické aspekty evolučních změn. 4. Evoluce a ekologie biodiverzity. Diverzifikace. 5. Fyzikální ekologie organizmů – vliv těploty a světla na funkce organizmů, adaptace organizmů, velikost a tvar organizmů – vliv na strukturu a funkci organizmů, alometrické metody. Jak organizmy pracují? – mechanizmy regulace, osmoregulace, látkové výměny a transportu látek. Evoluce fyzikálních systému organizmů, 6. Evoluce hlavních složek životních historií – teorie alokace energie na principu kompromisů, fitnesss a životní složky, vek a velikost v období pohlavní zralosti, velikost a počet potomků, evoluce stárnutí, životní cykly, poměry pohlaví a sexuální alokace, ekologická specializace a generalizace. 7. Fylogeneze a její aplikace v evolučně-ekologických studiích. Princípy makroevoluce -fylogenetický strom, komparativní metody, metoda fylogeneticky nezávislých kontrastů. Integrace micro- a makroevoluce – koevoluce, evoluce člověka – historie ovlivňující onemocnění, selekce a virulence. 8. Vnitrodruhové interakce z pohledu evolučně-ekologického. Evoluce a ekologie pohlavní chování (sexuální selekce, sexuální konflikt, strategie párování, sociální evoluce). Behaviorální ekologie a speciace. 9. Potravní chování, evoluční ekologie pohybu. 10. Mezidruhové interakce z pohledu evolučně-ekologického. Evoluce ekologické niky. Numerická a funkční odpověď kompetice, evoluční restrikce niky, koexistence druhů. 11. Evoluce a ekologie sexu – strategie rozmnožování, role sexuální ornamentace v sexuální selekci, hypotéze handicapu, hypotéze handicapu imunokompetence, hypotéze ochrany spermii, koexistence pohlavního a nepohlavního rozmnožování, Červená královna. 12. Parazitizmus v evoluční ekologii - evoluce ekologických charakterů parazitů, původ parazitizmu, speciace a diverzifikace parazitů, strategie využívaní hostitele, agregace parazitů - ekologické příčiny a evoluční následky 13. Imunita z pohledu evolučně-ekologického. Imunitní geny a investice do imunity. Imunita versus reprodukce. Parazity zprostředkovaná selekce MHC genů, role MHC v sexuální selekci.

Literatura

povinná literatura
• FLEGR, Jaroslav. Evoluční biologie. Vyd. 1. Praha: Academia, 2005, 559 s. ISBN 8020012702. info

doporučená literatura
• Westneat D. F., Fox C. W. 2010. Evolutionary behavioral ecology - Oxford university press, Oxford.
• Fox C. W., Rolf D. A., Fairbain D.J. 2001. Evolutionary Ecology: Concepts and Case Studies. Oxford University Press.
• Gotelli N. J. 1998. A Primer of Ecology, second edition - Sinauer Associates, Inc.
• Rose M. R., Mueller L. D. 2006. Evolution and ecology of the organism. Pearson Prentice Hall, USA.
• Bell G. 2008. Selection, the mechanism of evolution, second edition, Oxford University Press, Oxford.
• Moya A., Font E. 2004. Evolution, from molecules to ecosystems - Oxford university press, Oxford.
• Stearns S. C. , Hoekstra R. F. 2005. Evolution, an introduction, second edition - Oxford university Press, Oxford
• POULIN, Robert. Evolutionary ecology of parasites. 2nd ed. Princeton, N.J.: Princeton University Press, 2007, x, 332. ISBN 9780691120850. info

Výukové metody

teoretická příprava

Metody hodnocení

ústní zkouška

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

Bi7004 Evoluční ekologie

Předmět se v období podzim 2011 nevypisuje.

Rozsah

2/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.

Vyučující

prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 10 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Evoluční ekologie představuje studium selektivních tlaků kladených prostředím na organismy a evolučních odpovědí k těmto tlakům. Centrálním tématem kurzu „Evoluční ekologie“ je analýza biologie druhů z pohledu evoluční biologie a ekologie.

Osnova

• 1. Darwinova biologie – ekologie a evoluce, evoluční stromy. Variabilita, její příčiny a evoluční význam variability. 2. Mechanizmy evoluce – přírodní selekce, molekulárni evoluce, adaptace, fenotypická plasticita, speciace a extinkce 3. Ekologické a biogeografické aspekty evolučních změn. 4. Evoluce a ekologie biodiverzity. Diverzifikace. 5. Fyzikální ekologie organizmů – vliv těploty a světla na funkce organizmů, adaptace organizmů, velikost a tvar organizmů – vliv na strukturu a funkci organizmů, alometrické metody. Jak organizmy pracují? – mechanizmy regulace, osmoregulace, látkové výměny a transportu látek. Evoluce fyzikálních systému organizmů, 6. Evoluce hlavních složek životních historií – teorie alokace energie na principu kompromisů, fitnesss a životní složky, vek a velikost v období pohlavní zralosti, velikost a počet potomků, evoluce stárnutí, životní cykly, poměry pohlaví a sexuální alokace, ekologická specializace a generalizace. 7. Fylogeneze a její aplikace v evolučně-ekologických studiích. Princípy makroevoluce -fylogenetický strom, komparativní metody, metoda fylogeneticky nezávislých kontrastů. Integrace micro- a makroevoluce – koevoluce, evoluce člověka – historie ovlivňující onemocnění, selekce a virulence. 8. Vnitrodruhové interakce z pohledu evolučně-ekologického. Evoluce a ekologie pohlavní chování (sexuální selekce, sexuální konflikt, strategie párování, sociální evoluce). Behaviorální ekologie a speciace. 9. Potravní chování, evoluční ekologie pohybu. 10. Mezidruhové interakce z pohledu evolučně-ekologického. Evoluce ekologické niky. Numerická a funkční odpověď kompetice, evoluční restrikce niky, koexistence druhů. 11. Evoluce a ekologie sexu – strategie rozmnožování, role sexuální ornamentace v sexuální selekci, hypotéze handicapu, hypotéze handicapu imunokompetence, hypotéze ochrany spermii, koexistence pohlavního a nepohlavního rozmnožování, Červená královna. 12. Parazitizmus v evoluční ekologii - evoluce ekologických charakterů parazitů, původ parazitizmu, speciace a diverzifikace parazitů, strategie využívaní hostitele, agregace parazitů - ekologické příčiny a evoluční následky 13. Imunita z pohledu evolučně-ekologického. Imunitní geny a investice do imunity. Imunita versus reprodukce. Parazity zprostředkovaná selekce MHC genů, role MHC v sexuální selekci.

Literatura

• FLEGR, Jaroslav. Evoluční biologie. 2., oprav. a rozšíř. vyd. Praha: Academia, 2009, 569 s. ISBN 9788020017673. info

Informace učitele

2. Stephen C. Stearns, Rolf F. Hoekstra - Evolution, an introduction, second edition - Oxford university Press, 2005; ISBN: 0-19-925563-6 3. Fox C. W., Rolf D. A., Fairbain D.J. 2001. Evolutionary Ecology: Concepts and Case Studies. Oxford University Press. 4. Gotelli N. J. 1998. A Primer of Ecology, second edition - Sinauer Associates, Inc. 5. Westneat D. F., Fox C. W. 2010. Evolutionary behavioral ecology - Oxford university press, Oxford. 6. Moya A., Font E. 2004. Evolution, from molecules to ecosystems - Oxford university press, Oxford. 7. Bell G. 2008. Selection, the mechanism of evolution, second edition, Oxford University Press, Oxford. 8. Poulin R. 2007. Evolutionary ecology of parasites. Princeton University press. Princeton and Oxford. 9. Rose M. R., Mueller L. D. 2006. Evolution and ekology of the organism. Pearson Prentice Hall, USA.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

Bi7004 Evoluční ekologie

Údaje z období podzim 2011 - akreditace se nezveřejňují

Rozsah

2/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.

Vyučující

prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD.

Předpoklady

Bi6340 Ekologie společ. a makroekol. && Bi8150 Evoluční biologie

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 6 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Evoluční ekologie představuje studium selektivních tlaků kladených prostředím na organismy a evolučních odpovědí k těmto tlakům. Centrálním tématem kurzu „Evoluční ekologie“ je analýza biologie druhů z pohledu evoluční biologie a ekologie.

Osnova

• 1. Darwinova biologie – ekologie a evoluce, evoluční stromy. Variabilita, její příčiny a evoluční význam variability. 2. Mechanizmy evoluce – přírodní selekce, molekulárni evoluce, adaptace, fenotypická plasticita, speciace a extinkce 3. Ekologické a biogeografické aspekty evolučních změn. 4. Evoluce a ekologie biodiverzity. Diverzifikace. 5. Fyzikální ekologie organizmů – vliv těploty a světla na funkce organizmů, adaptace organizmů, velikost a tvar organizmů – vliv na strukturu a funkci organizmů, alometrické metody. Jak organizmy pracují? – mechanizmy regulace, osmoregulace, látkové výměny a transportu látek. Evoluce fyzikálních systému organizmů, 6. Evoluce hlavních složek životních historií – teorie alokace energie na principu kompromisů, fitnesss a životní složky, vek a velikost v období pohlavní zralosti, velikost a počet potomků, evoluce stárnutí, životní cykly, poměry pohlaví a sexuální alokace, ekologická specializace a generalizace. 7. Fylogeneze a její aplikace v evolučně-ekologických studiích. Princípy makroevoluce -fylogenetický strom, komparativní metody, metoda fylogeneticky nezávislých kontrastů. Integrace micro- a makroevoluce – koevoluce, evoluce člověka – historie ovlivňující onemocnění, selekce a virulence. 8. Vnitrodruhové interakce z pohledu evolučně-ekologického. Evoluce a ekologie pohlavní chování (sexuální selekce, sexuální konflikt, strategie párování, sociální evoluce). Behaviorální ekologie a speciace. 9. Potravní chování, evoluční ekologie pohybu. 10. Mezidruhové interakce z pohledu evolučně-ekologického. Evoluce ekologické niky. Numerická a funkční odpověď kompetice, evoluční restrikce niky, koexistence druhů. 11. Evoluce a ekologie sexu – strategie rozmnožování, role sexuální ornamentace v sexuální selekci, hypotéze handicapu, hypotéze handicapu imunokompetence, hypotéze ochrany spermii, koexistence pohlavního a nepohlavního rozmnožování, Červená královna. 12. Parazitizmus v evoluční ekologii - evoluce ekologických charakterů parazitů, původ parazitizmu, speciace a diverzifikace parazitů, strategie využívaní hostitele, agregace parazitů - ekologické příčiny a evoluční následky 13. Imunita z pohledu evolučně-ekologického. Imunitní geny a investice do imunity. Imunita versus reprodukce. Parazity zprostředkovaná selekce MHC genů, role MHC v sexuální selekci.

Literatura

povinná literatura
• FLEGR, Jaroslav. Evoluční biologie. Vyd. 1. Praha: Academia, 2005, 559 s. ISBN 8020012702. info

doporučená literatura
• Moya A., Font E. 2004. Evolution, from molecules to ecosystems - Oxford university press, Oxford.
• Westneat D. F., Fox C. W. 2010. Evolutionary behavioral ecology - Oxford university press, Oxford.
• Gotelli N. J. 1998. A Primer of Ecology, second edition - Sinauer Associates, Inc.
• Fox C. W., Rolf D. A., Fairbain D.J. 2001. Evolutionary Ecology: Concepts and Case Studies. Oxford University Press.
• Stearns S. C. , Hoekstra R. F. 2005. Evolution, an introduction, second edition - Oxford university Press, Oxford
• Rose M. R., Mueller L. D. 2006. Evolution and ecology of the organism. Pearson Prentice Hall, USA.
• Bell G. 2008. Selection, the mechanism of evolution, second edition, Oxford University Press, Oxford.
• POULIN, Robert. Evolutionary ecology of parasites. 2nd ed. Princeton, N.J.: Princeton University Press, 2007, x, 332. ISBN 9780691120850. info

Výukové metody

teoretická příprava

Metody hodnocení

ústní zkouška

Další komentáře

Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

• Statistika zápisu (podzim 2024, nejnovější)