Bi8080c Molekulární fyziologie rostlin - cvičení

Přírodovědecká fakulta
jaro 2026
Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: z.
Vyučováno kontaktně
Vyučující
doc. Mgr. Markéta Šámalová, Ph.D. (cvičící)
Garance
doc. Mgr. Markéta Šámalová, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
NOW( Bi8080 Molekulární fyziologie rostlin )
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Předmět navazuje na kurz Bi8080 Molekulární fyziologie rostlin, v rámci kterého se studenti seznámili s klíčovými mechanismy fungování rostlin na molekulární a buněčné úrovni. Kurz dále rozvíjí poznatky směrem k využití molekulárně-biologických přístupů v základním výzkumu rostlin a biotechnologických aplikacích. Zaměří se na základní metody molekulární biologie používané při přípravě geneticky modifikovaných organismů (GMO), včetně transgenních rostlin, a na cílenou úpravu rostlinného genomu, pomocí technologie CRISPR/Cas9.
Výstupy z učení
Po absolvování tohoto předmětu student získá teoretické i praktické znalosti a bude schopen: • porozumět a popsat hlavní metody používané v molekulární biologii pro přípravu GMO • ovládat přípravu transgenních rostlin a jejich analýzu včetně fluorescenční a konfokální mikroskopie • pochopit a analyzovat přínosy a rizika moderních rostlinných biotechnologií.
Osnova
• Základní postup přípravy geneticky modifikovaných rostlin • Genomické databáze, design primerů, PCR • Izolace plasmidové DNA, její stěpení a elektroforéza • Základy klonování • Techniky pro transformaci E. coli a agrobakteria • Transformace tabáku metodou in vitro • Transformace Arabidopsis thaliana metodou floral dip • Chemicky indukovatelné systémy, GUS barvení • Selekce transformantů • Fluorescenční proteiny a fluorescenční mikroskopie • Metoda cílené modifikace genomu (CRISPR/Cas9) • Transientní exprese v tabáku a konfokální mikroskopie • Přínosy a rizika GMO, legislativa.
Literatura
    povinná literatura
  • ŠÁMALOVÁ, Markéta; C. KIRCHHELLE a I. MOORE. Universal Methods for Transgene Induction Using the Dexamethasone-Inducible Transcription Activation System pOp6/LhGR in Arabidopsis and Other Plant Species. 2019. ISSN 2379-8068. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/cppb.20089. URL info
    doporučená literatura
  • ALBERTS, Bruce; Alexander JOHNSON; Julian LEWIS; David Owen MORGAN; Martin C. RAFF; Keith ROBERTS a Peter WALTER. Molecular biology of the cell. Edited by John H. Wilson - Tim Hunt. Sixth edition. New York, NY: Garland Science, 2014, xxxiv, 134. ISBN 9780815344322. info
  • SAMBROOK, Joseph a David W. RUSSELL. Molecular cloning : a laboratory manual. 3rd ed. Cold Spring Harbor, N.Y.: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2001, 1 sv. ISBN 0879695765. info
    neurčeno
  • Editing plant genomes with CRISPR/Cas9. Belhaj, K., Chaparro-Garcia, A., Kamoun, S., Patron, N.J. and Nekrasov, V. Current Opinion in Biotechnology 2015, 32:76–84.
Výukové metody
praktická výuka
Metody hodnocení
Test.
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2024, jaro 2025.