PřF:Bi9020c Evol. cytogenetika rostlin-cv. - Informace o předmětu

Bi9020c Evoluční a srovnávací cytogenetika rostlin - cvičení

Rozsah

0/2. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: k. Jiná možná ukončení: z.

Vyučující

prof. Mgr. Martin Lysák, Ph.D., DSc. (cvičící)
RNDr. Terezie Malík Mandáková, Ph.D. (cvičící)

Garance

prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Martin Lysák, Ph.D., DSc.

Předpoklady

Základy cytogenetiky a molekulární nebo buněčné biologie.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Předmět si smí zapsat nejvýše 20 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/20, pouze zareg.: 0/20

Mateřské obory/plány

předmět má 15 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Během cvičení se studenti seznámí s klasickými i nejmodernějšími metodami cytogenetiky rostlin. Každé praktické úloze předchází krátký teoretický úvod. Mezi nejdůležitější demonstrované techniky patří: fluorescence in situ hybridizace (FISH), FISH na DNA vláknech, genomická in situ hybridizace (GISH), značení DNA modifikovanými nukleotidy, srovnávací malování chromosomů (comparative chromosome painting), meiotické chromosomy v cytogenetice, immunololakalizace modifikovaných histonů, fluorescenční mikroskopie. Praktické cvičení navazuje na prednáškový kurs Bi9020 Evoluční a srovnávací cytogenetika rostlin. Na konci praktického cvičení by si studenti měli osvojit základní techniky moderní molekulární cytogenetiky rostlin.

Osnova

• Den 1
• - přímé a nepřímé značení DNA sond a jejich kontrola na agarosovém gelu (amplifikace a značení centromerické tandémové repetice A. thaliana pAL pomocí PCR; značení rDNA repetic a chromosomově-specifických BAC klonů A. thaliana pomocí nick translace; značení genomové DNA pomocí nick translace)
• - příprava mikroskopických preparátů z kořenových meristémů (hybridní rostliny Festuca x Lolium: mitotické chromosomy) a prašníků (A. thaliana: meiotické chromosomy)
• - analýza připravených preparátů pomocí fluorescenčního mikroskopu (výběr vhodných preparátů pro Den 2)
• Den 2
• - fluorescenční in situ hybridizace (FISH, chromosome painting)/genomická in situ hybridizace (GISH), část I (příprava mikroskopických preparátů pro FISH, příprava hybridizačních sond, hybridizace)
• - teoretické a praktické principy fluorescenční mikroskopie, práce s fluorescenčním mikroskopem a příslušným softwarem
• - studium meiosy (stádia meiosy analyzována na připravených preparátech pomocí fluorescenčního mikroskopu, digitálně fotografická dokumentace)
• Den 3
• - FISH, chromosome painting/GISH, část II (detekce nepřímo značených DNA sond)
• - analýza preparátů pomocí fluorescenčního mikroskopu, digitálně fotografická dokumentace (lokalizace tandémových repetic na chromosomech a v jádrech A. thaliana, chromosome painting: lokalizace BAC klonů A. thaliana na pachytenních chromosomech a v interfásních jádrech – chromosome territories; vyhodnocení výsledků GISH – demonstrace inter-genomových translokací).
• - zpracování fotografických výstupů
• Den 4
• - příprava natažených DNA vláken (A. thaliana) a FISH na natažených DNA vláknech, část I (přímo značené BAC klony připravené v rámci Dne 1)
• - analýza výsledků pomocí fluorescenčního mikroskopu
• - zpracování fotografických výstupů
• Den 5
• - FISH na natažených DNA vláknech, část II
• - analýza výsledků pomocí fluorescenčního mikroskopu
• - zpracování fotografických výstupů
• - závěr a shrnutí

Literatura

• SCHWARZACHER, T. a HESLOP-HARRISON. Practical in situ hybridization. Bios, 2000. info

Výukové metody

krátká teoretická příprava, laboratorní cvičení

Metody hodnocení

preparáty, protokoly, písemný test

Navazující předměty

• Bi9020 Evoluční a srovnávací cytogenetika rostlin

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Poznámka k četnosti výuky: blok 5 dni.

• Statistika zápisu (nejnovější)
  
• Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2011/Bi9020c