C3750 Data management

Přírodovědecká fakulta
podzim 2025
Rozsah
1/0/0. 2 kr. Ukončení: k.
Vyučováno kontaktně
Vyučující
doc. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Vladimír Horský, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Adrián Rošinec (přednášející)
Mgr. Ing. Tomáš Svoboda (přednášející)
Garance
doc. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: RNDr. Tomáš Raček, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Čt 18:00–19:50 C04/211
Předpoklady
Žádné, jedná se o úvodní kurz.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Cílem předmětu je seznámit studenty se základními aspekty správy vědeckých dat, tj. s plánováním životního cyklu dat, s řízením přístupu k datům, se způsoby dlouhodobého a krátkodobého ukládání dat a s popisem dat prostřednictvím metadat.
Výstupy z učení
Student bude po absolvování předmětu schopen:
- orientovat se v základních otázkách správy a uložení dat,
- popsat životní cyklus vědeckých dat z různých domén a vytvořit pro ně data management plán,
- zvolit vhodné softwarové nástroje pro dílčí aspekty správy dat konkrétního druhu a rozsahu, a
- zveřejňovat výsledky svého výzkumu tak, aby bylo možné je reprodukovat.
Osnova
  • Motivace pro data management. FAIR data. Životní cyklus výzkumných dat.
  • Metadata a metadatová schémata. Obecná schémata versus oborově-specifická schémata. Ontologie. Laboratorní deníky.
  • Systémy pro správu dat (Onedata, iRODS).
  • Plánování a akvizice dat. Řízení přístupu k datům. Citlivá data. Praktické ukázky nasazených systémů v centrálních laboratořích CEITEC.
  • Výpočty nad daty (Kubernetes, Jupyter notebooks). Provenance, nástroje pro zajištění reprodukovatelnosti výsledků výzkumu (GitHub, Zenodo, FigShare). Kontejnerizace.
  • Archivace a sdílení dat. Repozitáře dat a metadat. Národní repozitář. Perzistentní identifikátory. Vyhledávání.
Literatura
  • Shoshani, A., & Rotem, D. (Eds.). (2009). Scientific data management: challenges, technology, and deployment. CRC Press.
  • Briney, K. (2015). Data management for researchers: Organize, maintain and share your data for research success. Pelagic Publishing Ltd.
Výukové metody
Přednášky doplněné ukázkami reálných příkladů správy dat.
Metody hodnocení
Kolokviální rozprava nad probíranými tématy.
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
  • Statistika zápisu (nejnovější)
  • Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2025/C3750