C9095 RNA metabolism

Přírodovědecká fakulta
jaro 2009
Rozsah
2/0/0. 2 kr. (plus 2 za zk). Ukončení: zk.
Vyučující
prof. Mgr. Štěpánka Vaňáčová, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. Mgr. Štěpánka Vaňáčová, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
předmět má 20 mateřských oborů, zobrazit
Cíle předmětu
1. Introduction to the RNA world 2. Gene expression: prokaryotes versus eukaryotes 3. Transcription of mRNAs 4. mRNA processing: 5' end capping, polyadenylation 5. pre-mRNA splicing 6. tRNAs: transcription, processing, translation 7. rRNAs: transcription, processing, localization, ribosome synthesis 8. noncoding RNAs: snRNAs, snoRNAs 9. noncoding RNAs: miRNAs, piRNAs, siRNAs, dsRNAs 10. RNA silencing 11. RNA surveillance and degradation in the nucleus 12. RNA surveillance and degradation in the cytoplasm 13. Methods to study gene expression: microarray analysis, RT-PCR, Northern blot, 3' extension etc. 14. Methods of analysis of RNA conformation and modification
Osnova
  • 1. Introduction to the RNA world 2. Gene expression: prokaryotes versus eukaryotes 3. Transcription of mRNAs 4. mRNA processing: 5' end capping, polyadenylation 5. pre-mRNA splicing 6. tRNAs: transcription, processing, translation 7. rRNAs: transcription, processing, localization, ribosome synthesis 8. noncoding RNAs: snRNAs, snoRNAs 9. noncoding RNAs: miRNAs, piRNAs, siRNAs, dsRNAs 10. RNA silencing 11. RNA surveillance and degradation in the nucleus 12. RNA surveillance and degradation in the cytoplasm 13. Methods to study gene expression: microarray analysis, RT-PCR, Northern blot, 3' extension etc. 14. Methods of analysis of RNA conformation and modification
Literatura
  • The RNA world : the nature of modern RNA suggests a prebiotic RNA world. Edited by Raymond F. Gesteland - John F. Atkins. New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1993, xxiii, 630. ISBN 0-87969-456-4. info
Metody hodnocení
Lectures, discussions during the lectures, literature presentation. Oral examination.
Vyučovací jazyk
Angličtina
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2011 - akreditace, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, podzim 2023.