PřF:F9600 Spektroskopické studium biopol - Informace o předmětu

F9600 Spektroskopické studium biopolymerů

Rozsah

1/1. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

prof. Dr. Jiří Kozelka, PhD. (přednášející)
prof. RNDr. Tomáš Polívka, Ph.D. (přednášející)
doc. Mgr. Petr Táborský, Ph.D. (přednášející)
doc. RNDr. Oldřich Vrána, CSc. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Josef Humlíček, CSc.
Ústav fyziky kondenzovaných látek – Fyzikální sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Dr. Jiří Kozelka, PhD.
Dodavatelské pracoviště: Ústav fyziky kondenzovaných látek – Fyzikální sekce – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Kurz je určen především pro magisterské studenty s uzavřeným bakalářským vzděláním ve fyzice, chemii či biologii. Základní znalosti o principech spektroskopických metod jsou předpokladem. Velmi doporučujeme předchozí návštěvu kurzu F6530 "Spektroskopické metody".

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Biofyzika (angl.) (program PřF, N-FY)
• Biofyzika (program PřF, N-FY)
• Biofyzika (program PřF, N-FY, směr Aplikovaná biofyzika)
• Biofyzika (program PřF, N-FY, směr Molekulární biofyzika)

Cíle předmětu

Cílem kurzu je poskytnout přehled o informacích, které je možno získat o molekulové struktuře biopolymerů spektroskopickými metodami (absorpční spektrofotometrie, cirkulární dichroismus, luminiscence, vibrační spektroskopie, nukleární magnetická resonance a elektronová spinová resonance). Absolvent kurzu bude schopen rozhodnout, kterou metodu použít pro studium daného biopolymeru. Dále bude seznámen se základními spektroskopickými vlastnostmi DNA, RNA a proteinů.

Osnova

• 1. Absorpční spektrofotometrie a cirkulární dichroismus Interakce elektromagnetického pole s elektrickým dipólem, spontální a stimulované přechody, Einsteinovy koeficienty. Výběrová pravidla pro emisi a absorpci. Interakce elektromagnetického pole s magnetickým dipolem molekul. Chiralita molekul, cirkulární dichroismus. Metody měření absorpčních spekter a spekter cirkulárního dichroismu s aplikacemi na biopolymery. 2. Luminiscenční spektroskopie Jablonského diagram, Franck-Condonův princip. Luminiscence: fluorescence, fosforescence a zpožděná fluorescence. Emisní a excitační spektra, časové rozlišená luminiscence. Nativní luminiscence. Fluorescenční značky a sondy. 3. Vibrační spektroskopie Symetrie molekul a vibrační spektra. Výběrová pravidla pro vibrační přechody, infračervená spektroskopie, Ramanův rozptyl, struktura a intenzita linií. 4. NMR Na několika příkladech budou objasněny strategie pro určování rezonancí (assignment) a pro využití strukturálních informací z NMR-spekter při konstrukci 3D-modelů molekul. Důraz bude kladen především na modelování nukleových kyselin. 5. EPR Přínos EPR pro strukturální studie na biomolekulách bude diskutován na vybraných metaloproteinech a ribozymech. 6. Praktické příklady Poslední část kurzu budou věnovány diskusi konkrétních strukturních problémů, které posluchačům názorně ukáží přínos jednotlivých spektroskopických metod.

Výukové metody

Výuka v blocích po 3-4 hodinách. Rozvrh bude dohodnut se studenty.

Metody hodnocení

Kolokvium ve formě písemného testu nebo ústního pohovoru

Informace učitele

Literatura: Kurt Wüthrich: NMR of Proteins and Nucleic Acids, ISBN: 978-0-471-82893-8 F. A. Cotton: Chemical Applications of Group Theory, 3rd Edition, ISBN: 978-0471510949

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

• Statistika zápisu (jaro 2012, nejnovější)
  
• Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/jaro2012/F9600