C9088 RNAseq analýza

Přírodovědecká fakulta
jaro 2014
Rozsah
1/1. 2 kr. (plus ukončení). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.
Vyučující
Charlotte Sonenson, Ph.D. (přednášející)
doc. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Eva Budinská, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. RNDr. Zdeněk Glatz, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul - Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul - Přírodovědecká fakulta
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.
Předmět si smí zapsat nejvýše 20 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/20, pouze zareg.: 0/20, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/20
Osnova
  • During this course, we will go through the different steps of an RNA-seq experiment, including quality control, alignment of reads to a reference sequence, quantification of the expression of features, differential expression analysis and downstream analysis. We will discuss pitfalls, advantages and disadvantages of different approaches, and the participants will apply the methods in exercise sessions.
Výukové metody
Three days workshop (10.2.-14.2.) Lectures and exercise sessions
Metody hodnocení
written test
Informace učitele
Course will take place in University Campus Bohunice, pavilion A11, Room 235 Time: 09:00-17:00 - every day
Další komentáře
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2014, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022.