C8980c Příprava a charakterizace proteinů I - cvičení

Přírodovědecká fakulta
jaro 2022
Rozsah
0/2. blok 5 dnů. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: z.
Vyučující
RNDr. Lubomír Janda, Ph.D. (přednášející)
Ing. Blanka Pekárová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Radka Dopitová, Ph.D. (cvičící)
Garance
prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: RNDr. Lubomír Janda, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
C8980 Exprese a purifikace proteinů || NOW ( C8980 Exprese a purifikace proteinů )
Předpokladem pro porozumění předmětu je znalost základů biochemie nebo molekulární biologie.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
předmět má 19 mateřských oborů, zobrazit
Cíle předmětu
Student po absolvování praktického cvičení je schopen samostatně použít expresní systém pro produkci proteinu, vybrat vhodnou purifikační metodu a analyzovat získané výsledky.
Výstupy z učení
Po absolvování laboratorního cvičení jsou studenti schopni: - navrhnout klonovací strategii - exprimovat protein v heterologním prokaryotickém systému - purifikovat protein (srážení proteinů, afinitní, iontově výměnná a gelová permeační chromatografie) - analýza funkce a čistoty proteinů.
Osnova
  • 1. Bioinformatika a teoretická lekce klonování DNA. 2. Exprese proteinů v bakteriích. 3. Dezintegrace buněk. 4. Purifikace. 5. SDS-PAGE. 6. Měření aktivity proteinů.
Literatura
    doporučená literatura
  • HARDIN, Charles. Cloning, gene expression and protein purification : experimental procedures and process rationale. Online. New York: Oxford University Press, 2001. viii, 435. ISBN 0195132947. [citováno 2024-04-23] info
  • Guide to protein purification. Online. Edited by Richard R. Burgess - Murray P. Deutscher. 2nd ed. Boston: Elsevier/Academic Press, 2009. liii, 851. ISBN 9780123749789. [citováno 2024-04-23] info
Výukové metody
Laboratorní cvičení
Metody hodnocení
Vypracovaný protokol, prezentace získaných výsledků
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2012, podzim 2013, podzim 2014, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.