F9600 Spektroskopické studium biopolymerů

Přírodovědecká fakulta
jaro 2023
Rozsah
1/0/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
Vyučující
doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD. (přednášející)
prof. RNDr. Tomáš Polívka, Ph.D. (přednášející)
doc. RNDr. Oldřich Vrána, CSc. (přednášející)
Garance
doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD.
Ústav fyziky kondenzovaných látek – Fyzikální sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD.
Dodavatelské pracoviště: Ústav fyziky kondenzovaných látek – Fyzikální sekce – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
Studenti by měli být obeznámeni se strukturou proteinů a nukleových kyselin, mít základní povědomí o termodynamických zákonech a znalost matematiky a fyziky odpovídající 1.-2. ročníku nefyzikálních oborů.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
  • Biofyzika (program PřF, N-FY)
  • Biofyzika (program PřF, N-FY, směr Aplikovaná biofyzika)
  • Biofyzika (program PřF, N-FY, směr Molekulární biofyzika)
Cíle předmětu
Po absolvování předmětu by studenti měli být schopni - vysvětlit instrumentaci a interpretaci vybraných spektroskopických technik - aplikovat tyto techniky ke studiu biopolymerů
Výstupy z učení
Po absolvování předmětu by studenti měli být schopni - vysvětlit instrumentaci a interpretaci vybraných spektroskopických technik - aplikovat tyto techniky ke studiu biopolymerů
Osnova
  • Osnova předmětu je tvořena zejména těmito technikami:
  • Rezonance povrchového plazmonu (SPR)
  • Isothermální titrační kalorimetrie (ITC)
  • Analytická ultracentrifugace (AUC)
  • Cirkulární dichroismus (CD)
  • Elektronová paramagnetická rezonance (EPR)
Literatura
    doporučená literatura
  • ATKINS, P. W. a Julio DE PAULA. Atkins' physical chemistry. 9th ed. Oxford: Oxford University Press, 2010, xxxii, 972. ISBN 9780199543373. info
    neurčeno
  • Greg Ralston: Introduction to Analytical Ultracentrifugation
  • Modern techniques for circular dichroism and synchrotron radiation circular dichroism spectroscopy. Edited by Bonnie Ann Wallace - Robert William Janes. Amsterdam: IOS Press, 2009, xii, 231 p. ISBN 1607500000. info
  • Handbook of surface plasmon resonance. Edited by R. B. M. Schasfoort - Anna J. Tudos. Cambridge: RSC Publishing, 2008, xxi, 403. ISBN 9780854042678. info
  • Distance measurements in biological systems by EPR. Edited by Lawrence J. Berliner - Gareth R. Eaton - Sandra S. Eaton. London: Kluwer Academic/Plenum, 2000, xviii, 614. ISBN 0306465337. info
  • Circular dichroism and the conformational analysis of biomolecules. Edited by Gerald D. Fasman. New York: Plenum Press, 1996, ix, 738 s. ISBN 0-306-45142-5. info
Výukové metody
Výuka předmětu je vedena formou přednášek, diskusí a názornými příklady
Metody hodnocení
Předmět je zakončen ústní zkouškou
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2024, jaro 2025.