C8800 Rtg strukturní analýza

Přírodovědecká fakulta
jaro 2025
Rozsah
2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.
Vyučováno kontaktně
Vyučující
doc. RNDr. Jaromír Marek, Ph.D. (přednášející)
Garance
doc. RNDr. Jaromír Marek, Ph.D.
Ústav chemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Ústav chemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Po 17. 2. až So 24. 5. Po 13:00–14:50 Kontaktujte učitele
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
předmět má 21 mateřských oborů, zobrazit
Anotace
Cílem výuky je vysvětlit studentům základní principy monokrystalové rtg. strukturní analýzy, uvést je do kinematické teorie monokrystalové difrakce a seznámit je s přístroj. výbavou používanou při difrakčním experimentu a metodami pro vyhodnocování experimentálních RTG dat. Na rozdíl od analogického kursu CB070 Proteinová krystalografie je základní pozornost kursu C8800 soustředěna na krystalografii tzv. malých molekul.
Výstupy z učení
Na konci tohoto kurzu student bude znát: - principy monokrystalové rtg. strukturní analýzy; - historii rtg. krystalografie; - přístrojovou instrumentaci rtg. krystalografie; - základní postupy rtg. krystalografie; - uživatelská znalost krystalografických programů ShelxS a ShelxL a SW pro práci krystalografickými datatabázemi
Klíčová témata
  • Symetrie látek
  • Interakce rtg. záření s látkou
  • Difrakce na krystalu
  • Zdroje a detektory rtg. záření
  • Difraktometry
  • Fázový problém
  • Pattersonovské a přímé metody
  • Upřesňování modelu, R-faktory, metoda nejmenších čtverců.
  • Programy SHELXS a SHELXL
  • Příprava proteinových krystalů
  • Proteiny a metody kovových derivátů
  • Upřesňování proteinových strukturních modelů
  • Krystalografické databáze
Studijní zdroje a literatura
  • MAREK, Jaromír a Z. TRÁVNÍČEK. Monokrystalová rentgenová strukturní analýza. první. Olomouc: Vydavatelství Univerzity Palackého, 2002, 169 s. nedělí se na edice. ISBN 80-244-0551-2. info
  • GIACOVAZZO, C. Fundamentals of Crystallography. 1992. ISBN 0-19-855578-4. info
Přístupy, postupy a metody používané ve výuce
Teoretická příprava. Domácí práce prováděná na počítači.
Způsob ověření výstupů z učení a požadavky na ukončení
Během semestru je vyžadována domácí práce na počítači. Ústní zkouška či kolokvium
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, jaro 2000, jaro 2001, jaro 2002, jaro 2003, jaro 2004, jaro 2005, jaro 2006, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2026.