C9903 Databáze molekulových struktůr jako nástroj chemie a biologie

Přírodovědecká fakulta
podzim 2004
Rozsah
8/8. 2 kr. Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.
Vyučující
prof. Ing. Bohdan Schneider, CSc., DSc. (přednášející), Mgr. Eva Fadrná, Ph.D. (zástupce)
Garance
Mgr. Eva Fadrná, Ph.D.
Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: Mgr. Eva Fadrná, Ph.D.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 24 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/24, pouze zareg.: 0/24, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/24
Mateřské obory/plány
předmět má 18 mateřských oborů, zobrazit
Cíle předmětu
Velké množství experimentálně stanovených struktur organických a biologických molekul je možné efektivně využívat, studujeme-li je vhodnými nástroji. Mezi ty základní patří databáze molekulárních struktur a práci s databázemi od získávání strukturních dat k jejich zpracování je kurs věnován. Studenti se naučí používat tři databáze nejdůležitější pro biologii a chemii: CAMBRIDGE STRUCTURAL DATABASE (CSD), PROTEIN DATA BANK (PDB), NUCLEIC STRUCTURE DATABASE (NDB). Na databasové dotazy navazuje zpracování nalezené informace. V kurzu se zmíníme o základních metodách statistického zpracovaní dat se zvláštním zřetelem na (periodicky se opakující) torsní úhly. Studenti se naučí používat i originální metodu průměrování 3D distribicí bodů technikou Fourierových transformací.
Osnova
  • 1. CSD, 2. PDB, 3. NDB, 4. Další významné zdroje informací na webu a jejich použití, 5. Formáty souřadnicových soubor, příprava dat k dalšímu zpracování, 6. Základní statistické zpracování dat, 7. Metoda Fourierovského průměrování, 8. Příklady zpracování distribucí torsních úhlů
Metody hodnocení
Test + diskuse nad výsledky
Informace učitele
http://www.ncbr.chemi.muni.cz/~evaf/databaze.html
Upřesňující informace o místě konání kurzu budou uvedeny na jeho WWW stránce. Dotazy směřujte na e-mail evaf@chemi.muni.cz (Dr. Eva Fadrná).
Další komentáře
Předmět je vyučován jednorázově.
Výuka probíhá blokově.
Poznámka k četnosti výuky: 2.-4.11.
  • Statistika zápisu (nejnovější)
  • Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2004/C9903