PřF:Bi9393 Analytická cytometrie - Informace o předmětu
Bi9393 Analytická cytometrie
Přírodovědecká fakultapodzim 2014
- Rozsah
- 2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.
- Vyučující
- Mgr. Karel Souček, Ph.D. (přednášející)
prof. RNDr. Eva Bártová, Ph.D., DSc. (přednášející)
doc. Mgr. Lukáš Kubala, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Pavla Gajdušková, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Eva Slabáková, Ph.D. (přednášející)
doc. RNDr. Alena Hyršlová Vaculová, Ph.D. (přednášející) - Garance
- prof. RNDr. Alois Kozubík, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: Mgr. Karel Souček, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta - Rozvrh
- Út 16:00–17:50 BFU
- Předpoklady
- Předmět nemá žádné speciální předpoklady.
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: Na předmět se vztahuje povinnost registrace, bez registrace může být znemožněn zápis předmětu! - Mateřské obory/plány
- Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
- Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Experimentální biologie živočichů a imunologie)
- Cíle předmětu
- Na konci kurzu bude student schopen: - rozumět základním principům a aplikacím moderních metod analytické cytometrie jako je průtoková cytometrie, buněčná separace, digitální mikroskopie a mikroarrays; - pochopit základní principy analýzy dat, jejich interpretace a prezentace.
- Osnova
- * Obecný úvod do průtokové cytometrie - základní principy a historie (Karel Souček)
- * Principy průtokové cytometrie a sortrování (Karel Souček) -fluorescence -zdroje excitace, optické systémy a způsoby detekce fluorescence -zpracování a kompenzace signálu -vizualizace, analýza a softwarové zpracování dat
- * Biologické aplikace průtokové cytometrie (Karel Souček) - buněčné biologie (analýza nukleových kyselin , analýza buněčných funkcí, princip a praktické možnosti víceparametrových analýz) - cytogenetika - hydrobiologie
- Metody průtokové cytometrie ve studiu buněčné smrti (Alena Vaculova)
- * Aplikace průtokové cytometrie v klinické imunologii a hematologii (Lukáš Kubala)
- * Principy digitální mikroskopie (Eva Bártová) - fluorescenční mikroskopie, konfokální mikroskopie, "temporally-resolved" digitální mikroskopie, "time/frequency-resolved" digitální mikroskopie
- * Klinické a biologické aplikace digitální mikroskopie (Eva Bártová) - chromozómová a genová analýza - analýza buněčných kompartment a metabolismu (pH, ionty) - aplikace FRET a FRAP
- * Principy mikroarrays (Pavla Gajdušková) - DNA, RNA arrays - expresní, genové a mutační arrays
- * Biologické a klinické aplikace a analýza dat microarrays (Pavla Gajdušková) - praktické příklady aplikací jednotlivých typů arrays v lékařské diagnostice a základním výzkumu * miRNA arrays (Eva Lincová)
- Literatura
- doporučená literatura
- Flow Cytometry: Instrumentation and Data Analysis
- - The Handbook of Flow Cytometry Methods - Current Protocols in Cytometry
- Practical Flow Cytometry
- Výukové metody
- Kurz bude postaven zejména na přednáškách a diskuzích k nim. V rámci přednášek budou objasněny principy a způsoby základní analýzy dat k jednotlivým metodologiím. Studenti formou instruktáže seznámeni s vybavením pro průtokovou cytometrii a digitální mikroskopii které je v provozu na Biofyzikálním ústavu v Brně.
- Metody hodnocení
- Zkouška Každý student bude muset prezentovat krátký seminář, jehož téma bude konzultováno s přednášejícím a bude se týkat zaměření kurzu. Na základě této prezentace bude udělen zápočet a hodnocení vlastního semináře se bude také z 25-ti % odrážet v celkové známce. Kurz bude zakončen zkouškou ve formě testu shrnujícího látku za celý semestr. Výsledek testu bude tvořit 75% celkového hodnocení.
- Informace učitele
- Literatura: - Flow Cytometry: Instrumentation and Data Analysis (M.A. Van Dilla, P.N. Dean, O.D. Laerum, M.R. Melamed, eds.), Academic Press, London, 1985 - Practical Flow Cytometry 3nd edition (1994),H. Shapiro: Alan R. Liss, New York - The Handbook of Flow Cytometry Methods - Current Protocols in Cytometry
- Další komentáře
- Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně. - Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
- Bi9393en Analytical Cytometry
(!Bi9393) && !NOWANY(Bi9393)
- Bi9393en Analytical Cytometry
- Statistika zápisu (podzim 2014, nejnovější)
- Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2014/Bi9393