PřF:C7195 Pokročilé prakt. z biochemie - Informace o předmětu

C7195 Pokročilé praktikum z biochemie

Rozsah

0/0/5. 5 kr. (plus ukončení). Ukončení: z.

Vyučující

doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D. (cvičící)
doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Petr Lapčík, Ph.D. (pomocník)
Mgr. David Novák (pomocník)

Garance

doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D.
Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Út 15:00–19:50 C15/211

Předpoklady

C4220 Biochemie - laboratorní cvičení C6200 Biochemické metody

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 24 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 2/24, pouze zareg.: 0/24, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/24

Mateřské obory/plány

předmět má 8 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Cílem laboratorního kurzu je prakticky si vyzkoušet pokročilé biochemické metodiky. V rámci kurzu se studenti naučí samostatně provádět izolaci a separaci biomolekul (nukleové kyseliny, proteiny, nízkomolekulární látky), aplikovat metody pro stanovení aktivit enzymů, metody pro stanovení hladin mRNA a proteinů (qPCR, proteomika na bázi kvantitativní hmotnostní spektrometrie), práci s tkáňovými kulturami a moderními diagnostickými metodami, zpracovávat, statisticky vyhodnocovat a interpretovat získaná data.

Výstupy z učení

Student bude po absolvování předmětu schopen: - Provést nativní elektroforézu a stanovit enzymovou aktivitu - Izolovat proteiny z nádorových buněčných linií a stanovit celkovou koncentraci proteinu - Provést štěpení proteinů trypsinem a purifikovat získané peptidy v rámci proteomického experimentu - Provést databázové prohledávání proteomických LC-MS/MS dat, statisticky vyhodnotit a interpretovat výsledky - Provést molekulární klonování - Izolovat RNA z biologického materiálu - Provést reverzní transkripci - Provést qPCR a vyhodnotit data - Provést PCR-RFLP analýzu - Provádět kritické hodnocení získaných dat

Osnova

• Úloha A: Analýza izoenzymů askorbát peroxidasy pomocí nativní PAGE a aktivity phenylalanin-amoniak lyasy Úloha B: Porovnání proteotypů nádorových buněčných linií pomocí kvantitativní hmotnostní spektrometrie Úloha C: Klonování PCR produktu do plasmidu Úloha D: Identifikace neznámého elicitinu na základě jeho aktivity Úloha E: Identifikace jednotlivých druhů václavek ze vzorku půdy

Literatura

• Návody ke cvičením - viz Studijní materiály

Výukové metody

Laboratorní cvičení

Metody hodnocení

Student musí absolvovat všechny úlohy a odevzdat z nich požadované protokoly.

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

• Statistika zápisu (podzim 2022, nejnovější)
  
• Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2022/C7195