Bi1122 Statistická analýza experimentálních dat v R

Přírodovědecká fakulta
podzim 2024
Rozsah
1/0/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.
Vyučující
Mgr. Petra Ovesná, Ph.D. (přednášející)
Garance
Mgr. Petra Ovesná, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: Mgr. Petra Ovesná, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Jiné omezení: Na předmět se vztahuje povinnost registrace; bez registrace může být znemožněn zápis předmětu!
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Cílem předmětu je seznámit studenty s logikou realizace biologických experimentů, kdy jejich založení a design musí korespondovat jak s cíli daného pokusu, tak se statistickou metodou vyhodnocení získaných dat a správnou interpretací výsledků.
Výstupy z učení
Po absolvování tohoto kurzu jsou studenti schopni:
- navrhnout optimální design experimentu vhodný pro řešení specifikovaného problému;
- vybrat pro daná data a experiment vhodnou statistickou metodu;
- otestovat hypotézy pomocí vhodných statistických testů a modelů v programu R;
- zobecnit, interpretovat a vhodnou formou prezentovat vypočtené statistické veličiny a testy.
Osnova
  • Sběr dat, jejich organizace vhodná pro statistické analýzy v R.
  • Import dat z tabulkových procesorů. Typy proměnných, statistická rozložení, kvantily, testování hypotéz, nulová vs. alternativní hypotéza, chyba I. a II. druhu.
  • Design experimentu, volba vhodné statistické metody.
  • X2 test. F-test, t-test. Jednocestná analýza rozptylu, homogenita rozptylů, nezávislost reziduí, transformace dat, kontrasty, a priori a post-hoc testy.
  • Vícecestné analýzy rozptylu: faktoriální, hierarchické, blokové uspořádání, design opakovaných měření; interakce, model pevných a náhodných efektů, smíšený model.
  • Analýza kovariance. Korelační analýza, Pearsonův a Spearmanův korelační koeficient, parciální korelační koeficient.
  • Regresní analýza, linearní a nelineární regrese, vícenásobná regrese.
Literatura
  • LEPŠ, Jan. Biostatistika. Vyd. 1. České Budějovice: Jihočeská universita, 1996, 165 s. ISBN 8070401540. info
  • SOKAL, Robert R. a F. James ROHLF. Biometry : the principles and practice of statistics in biological research. 3rd ed. New York: W.H. Freeman and Company, 1995, xix, 887. ISBN 0716724111. info
  • PEKÁR, Stanislav a Marek BRABEC. Moderní analýza biologických dat 1 - 1. díl. Zobecněné lineární modely v prostředí R. 2. přepracované vydání. Brno: Masarykova univerzita, 2020, 278 s. ISBN 978-80-210-9622-6. info
  • PEKÁR, Stanislav a Marek BRABEC. Moderní analýza biologických dat 2. Lineární modely s korelacemi v prostředí R. 1. vyd. Brno: Masarykova universita, 2012, 256 s. ISBN 978-80-210-5812-5. info
  • PEKÁR, Stanislav a Marek BRABEC. Moderní analýza biologických dat. 3. díl. Nelineární modely v prostředí R. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2019, 218 s. ISBN 978-80-210-9277-8. info
Výukové metody
Přednáška zaměřená na vysvětlení teoretických principů, které budou procvičovány v praktickém cvičení.
Metody hodnocení
Zkouška je založena na vypočtení tří příkladů pokrývajících probíranou látku, s využitím programu R. Volba vhodné statistické metody a její odůvodnění je součástí zkoušky.
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.
  • Statistika zápisu (nejnovější)
  • Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2024/Bi1122