C1473 Vybrané kapitoly z aplikované matematiky pro biochemiky

Přírodovědecká fakulta
podzim 2024
Rozsah
1/0/0. 1 kr. Ukončení: z.
Vyučováno kontaktně
Vyučující
RNDr. Tomáš Raček, Ph.D. (přednášející)
RNDr. Ondřej Schindler, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Aleš Křenek, Ph.D. (přednášející)
Garance
RNDr. Tomáš Raček, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
C1471 Aplikovaná matematika pro biochemiky
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 20 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 7/20, pouze zareg.: 0/20, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/20
Mateřské obory/plány
Anotace
Cílem předmětu je navázat na základní matematické znalosti z předmětů M1035 a C1471 a ukázat vybrané problémy a specifika jejich řešení v praxi s využitím počítače.
Výstupy z učení
Na konci toho kurzu bude student schopen aplikovat vybrané metody na reálných příkladech s využitím počítače (jazyk Python, knihovny pro práci s daty, jejich vizualizace).
Klíčová témata
  • 1. Problémy s reprezentací reálných čísel v počítači.
  • 2. Redukce dimenzí a vizualizace n-rozměrných dat.
  • 3. Shluková analýza a její aplikace.
  • 4. Optimalizace a parametrizace metod.
  • 5. Praktické řešení soustav lineárních rovnic (nedostatky Gaussovy eliminace, LU dekompozice)
Studijní zdroje a literatura
    doporučená literatura
  • VANDERPLAS, Jacob T. Python data science handbook : essential tools for working with data. First edition. Tokyo: O'Reilly, 2017, xvi, 529. ISBN 9781491912058. info
Přístupy, postupy a metody používané ve výuce
Přednáška doplněná demonstrací probíraných konceptů na počítači.
Způsob ověření výstupů z učení a požadavky na ukončení
Aktivní účast. Závěrečný test.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2025.