Bi7799 Epigenetika

Přírodovědecká fakulta
podzim 2025
Rozsah
2/0. 2 kr. (plus 2 za zk). Ukončení: zk.
Vyučováno kontaktně
Vyučující
Ing. Václav Bačovský, Ph.D. (přednášející)
RNDr. Roman Hobza, Ph.D. (přednášející)
Ing. Vojtěch Hudzieczek, Ph.D. (přednášející)
Garance
RNDr. Roman Hobza, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: RNDr. Roman Hobza, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
Bi3060 Obecná genetika
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Cílem předmětu je seznámit studenty s epigenetickou regulací genové exprese a molekulárními procesy, které zahrnují epigenetickou dědičnost. Předmět se snaží obsáhnout všechny aspekty epigenetických procesů a jejich roli ve vývoji a evoluci. V konkrétních bodech se zaměřuje též na problematiku epigenetiky ve vztahu k chorobám, imunitě, výživě a vlivu prostředí na organismus.
Výstupy z učení
Student bude schopen porozumět základním epigenetickým procesům, jejich praktickým dopadům a molekulárním mechanismům, které se podílejí na epigenetickém řízení genové exprese.
Osnova
1. Úvod do epigenetiky, základní koncepty, historie oboru 2. Molekulární mechanismy epigenetických procesů I 2.1 Methylace DNA 2.2 Methylace DNA v kontextu evoluce 2.3 Methylace RNA 3. Molekulární mechanismy epigenetických procesů II 3.1 RNA interference (RNAi) 3.2 Vývojové procesy v souvislosti s RNAi 3.3 lncRNA a další regulační molekuly odvozené od RNA 4. Struktura chromatinu a jeho vyšší organizace I 4.1 Vztah struktury chromatinu a epigenetických modifikací 4.2 Kvasinky jako model struktury chromatinu 4.3 Nekódující složky genomu 5. Struktura chromatinu a jeho vyšší organizace II 5.1 Acetylace, fosforylace, methylace histonů 5.2 Ostatní histonové modifikace 5.3 Histonové varianty a jejich funkce 5.4 Role histonových modifikací při ontogenezi živočichů 6. Epigenetická paměť 6.1 Základní definice histon-remodelujících proteinů 6.2 Polycomb 6.3 Thritorax 6.4 Epigenetické reprogramování u savců a rostlin 7. Epigenetická dědičnost 7.1 Úloha epigenetických modifikací při buněčné determinaci 7.2 Typy epigenetické dědičnosti – základní pojmy 7.3 Transgenerační epigenetická dědičnost a její projevy 8. Genomický imprinting 8.1 Chakteristika a projevy imprintingu 8.2 Teorie parentálního konfliktu 8.3 Poruchy imprintingu a syndromy spojené s epigenetickou regulací 9. Dávková kompenzace 9.1 DC u živočichů a její forma 9.2 Úloha epigenetických faktorů při DC 9.3 Evoluce dávkové kompenzace a její základní mechanismus 9.4 Atypické modely dávkové kompenzace 9.5 Hlavní epigenetické poruchy při ontogenezi 10. Prostředí a epigenetika 10.1 Vnější faktory ovlivňující epigenetické mechanismy 10.2 Model Agouti viable yelow 10.3 Momme, metastabilní epigenetická variabilita 10.4 Epigenetika chování 11. Praktické využití epigenetických jevů 11.1 Pluripotence a buněčné klonování 11.2 Epigenetika a rakovina 11.3 Epibreeding 12. Metody pro studium epigenetických jevů 12.1 DNA/RNA methylace 12.2 DNA-protein interakce a chromatinová analýza 12.3 Metody chemické genetiky
Literatura
  • Epigenetics. Edited by C. David Allis. 2nd ed. Cold Spring Harbor, N.Y.: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2015, xiv, 984. ISBN 9781936113590. info
  • VYSKOT, Boris. Epigenetika. 1. vyd. Olomouc: Univerzita Palackého v Olomouci, 2010, 150 s. ISBN 9788024425344. info
Výukové metody
přednášky, diskuze, exkurze
Metody hodnocení
ústní zkouška
Náhradní absolvování
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Informace učitele
https://www.ibp.cz/cs/vyzkum/oddeleni/vyvojova-genetika-rostlin/e-learning
Další komentáře
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.
  • Statistika zápisu (nejnovější)
  • Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2025/Bi7799