C1171 Aplikovaná statistika pro bioinformatiky II

Přírodovědecká fakulta
podzim 2026
Rozsah
2/2. 5 kr. Ukončení: zk.
Vyučováno kontaktně
Vyučující
Mgr. Veronika Horská, Ph.D. (přednášející)
Garance
Mgr. Veronika Horská, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: RNDr. Tomáš Raček, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Čt 12:00–13:50 C04/118
  • Rozvrh seminárních/paralelních skupin:
C1171/01: Čt 14:00–15:50 C04/118, V. Horská
Předpoklady
Znalost základních statistických pojmů na úrovni předmětu C1170: Aplikovaná statistika pro bioinformatiku I.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
Anotace
Cílem předmětu je seznámit studenta s pojmy, principy a metodami vícevýběrového testování a statistického modelování a zajistit dostatečné procvičení těchto metod na reálných bioinformatických datech s využitím statistického softwaru R.
Výstupy z učení
Po absolvování předmětu bude student schopen: naplánovat vlastní experiment, včetně stanovení cílů experimentu; definovat statistické hypotézy, jejichž testování povede ke splnění cílů experimentu; provést datovou analýzu korektně ověřující definované statistické hypotézy; vyvodit z výsledků datové analýzy správné statistické závěry; správně interpretovat statistické závěry v oboru bioinformatiky; reprezentovat výsledky datové analýzy přehlednou formou v podobě prezentace.
Klíčová témata
Vybraná diskrétní a spojitá rozdělení a jejich vlastnosti; vícevýběrové parametrické testy; vícevýběrové neparametrické testy; základy statistického modelování; lineární modely; zobecněné lineární modely; lineární modely s korelacemi.
Studijní zdroje a literatura
    povinná literatura
  • PEKÁR, Stanislav a Marek BRABEC. Moderní analýza biologických dat 2. Lineární modely s korelacemi v prostředí R. 1. vyd. Brno: Masarykova universita, 2012, 256 s. ISBN 978-80-210-5812-5. info
  • PEKÁR, Stanislav a Marek BRABEC. Moderní analýza biologických dat 1 - 1. díl. Zobecněné lineární modely v prostředí R. 2. přepracované vydání. Brno: Masarykova univerzita, 2020, 278 s. ISBN 978-80-210-9622-6. info
  • SHAHBABA, Babak. Biostatistics with R : an introduction to statistics through biological data. Dordrecht: Springer, 2012, xvi, 352. ISBN 9781461413011. info
Přístupy, postupy a metody používané ve výuce
Přednášky: 2 hodiny týdně; teoretické přednášky zaměřené na seznámení se statistickými pojmy a metodami.
Cvičení: 2 hodiny týdně; praktická cvičení na počítači zaměřená na aplikaci statistických metod při analýze bioinformatických dat s využitím statistického softwaru R.
Způsob ověření výstupů z učení a požadavky na ukončení
Podmínka pro přihlášení na zkoušku: průběžná semestrální práce spočívající v aktivní prezenční účasti na cvičeních (povoleny jsou 2 neomluvené absence); zpracování a odevzdání řešení domácích úkolů reflektujících látky probírané na cvičeních.
Zkouška: závěrečná semestrální písemná práce (nutné získat alespoň 50 % bodů); prezentace výsledků statistické analýzy (cca 10 min), kterou student zpracovává buď na vlastních datech nebo na poskytnutých datech.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
  • Statistika zápisu (nejnovější)
  • Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2026/C1171