Představení studijního programu

This doctoral study programme is organized by the Faculty of Science in English and the studies are subject to tuition.

There is an alternative option for the international applicants to be accepted in the free programme administered in Czech with a possibility of receiving a scholarship. The study language of the programme is still English (Czech is the administrative language).

Before officially applying, please contact us at admission(zavináč/atsign)sci(tečka/dot)muni(tečka/dot)cz to find all the necessary information related to the scholarship and see our FAQ’s here (https://www.sci.muni.cz/en/studies/doctoral-degree-study-programme/admission-process-faq).

The study program Biomolecular chemistry and bioinformatics includes knowledge about the structure of biologically important bio(macro)molecules (proteins nucleic acids, oligosaccharides, etc.), and the relation between their structure and biological function. Students are trained in methods of carrying out and applying research on the 3-D structure and function of bio(macro)molecules. The technical facilities allow students regular use of the most modern methods, both experimental (nuclear magnetic resonance, x-ray diffraction, cryo-electron microscopy, methods in biomolecular interactions studies , methods of molecular biology) and computational (quantum chemistry, molecular mechanics and dynamics). Emphasis is placed on independent work by students in the context of implementing research projects, including the ability to communicate and present results in the English language. Students also learn to make use of information available in literature and electronic databases. The range of specialized lectures allows students to deepen their theoretical knowledge.

Study covers the following research areas:

Computational chemistry and chemoinformatics

Structural bioinformatics

Structural analysis using nuclear magnetic resonance, x-ray difraction and cryo-electron microscopy

Glycobiochemistry

Interaction of proteins with cell membrane

Structural virology

Structure and dynamics of nucleic acids

Structural biology of gene regulation

Non-coding genome

RNA quality control

Recombination and DNA repair

DNA sequence analysis

Next-generation sequencing

The program of studies is designed to be interdisciplinary, helping students learn to combine knowledge from various fields.

Studijní plány

Studium

  • Cíle

    Program Biomolekulární chemie a bioinformatika otevírá studentům cestu k hlubokým znalostem o stavbě biologicky významných bio(makro)molekul (proteinů, nukleových kyselin, oligosacharidů a pod.) a o vztahu mezi jejich strukturou a biologickou funkcí. Studenti jsou školeni v metodách získávání a aplikace poznatků o struktuře a funkci bio(makro)molekul. Technické zázemí umožní studentům běžně pro svou práci využívat nejmodernější metody experimentální (nukleární magnetická rezonance, rentgenová krystalografie, kryo-elektronová mikroskopie, moderní metody studia biomolekulárních interakcí, metody molekulární biologie) a výpočetní (kvantová chemie, molekulová mechanika a dynamika). Důraz je kladen na samostatnou práci studentů v rámci řešených projektů včetně schopnosti komunikovat a prezentovat výsledky v anglickém jazyce. Studenti se také naučí využívat informace dostupné v literatuře a elektronických databázích. Nabídka specializovaných přednášek umožní studentům prohloubení teoretických znalostí.

    Studium pokrývá následující výzkumné oblasti:

    Výpočetní chemie a chemoinformatika

    Strukturní bioinformatika

    Strukturní analýza pomocí nukleární magnetické rezonance, rentgenové difrakce a kryo elektronové mikroskopie

    Glykobiochemie

    Interakce proteinů s buněčnou membránou

    Strukturní virologie

    Struktura a dynamika nukleových kyselin

    Strukturní biologie genové regulace

    Nekódující genom

    Kontrola kvality RNA

    Rekombinace a oprava DNA

    Analýza sekvencí DNA

    Sekvenování nové generace

    Zaměření studijního programu je multidisciplinární a naučí studenty kombinovat poznatky různých oborů.

  • Výstupy z učení

    Absolvent je po úspěšném ukončení studia schopen:

    • samostatně a tvořivě plánovat a realizovat vědecké a výzkumné aktivity a zvládat metodiky a modely v oboru biomolekulární chemie a bioinformatika
    • sepsat a k publikaci připravit kritický vědecký text v podobě odborných článků pro zahraniční časopis v oboru biomolekulární chemie a bioinformatika
    • prezentovat a obhájit výsledky vlastního výzkumu na mezinárodním vědeckém foru v oblasti biomolekulární chemie a bioinformatika
    • chápat a umět využít širší odborné a teoretické znalosti v oboru biomolekulární chemie a bioinformatika
    • znát a kriticky hodnotit nejnovější poznatky a vědecký rozvoj v oboru biomolekulární chemie a bioinformatika
    • rozumět a zvládat plynulou odbornou komunikaci v angličtině
    • využívat zkušenosti získané z mezinárodní spolupráce
    • předávat znalosti a zkušenosti díky svým pedagogickým zkušenostem
    • využívat získané přenositelné zkušenosti při koncipování vědeckých projektů pro grantové žádosti a při organizování týmové práce ve výzkumu
  • Uplatnění absolventa

    The goal of the doctoral study programme is to prepare specialists at the highest level who will be not only specialists with detailed knowledge of certain techniques, but creative thinkers with a broad overview of the field of biomolecular chemistry and bioinformatics with good foundations in theory. Although the graduate will be qualified mainly for an academic career, he will also be a specialist capable of serving in the commercial sphere, especially in biochemical and pharmaceutical research, working with biologically-oriented databases, and in fields using advanced methods of computational chemistry and bioinformatics. As the experience of the past few years has shown, foreign contacts and study stays can help the graduate to find work at the top institutes abroad. Foreign contacts and study stays can help the graduate to find work at the top institutes abroad.

  • Standardy kvalifikačních prací

    Disertační práce musí obsahovat výsledky uveřejněné nebo přijaté ke zveřejnění. Podmínkou pro předložení disertační práce k obhajobě je minimálně 1 přijatý článek, kde je student prvním autorem, v časopise s IF, který je nad mediánem oboru nebo minimálně 2 prvoautorské články v jiných časopisech s IF (pod mediánem). Preferovanou formou disertační práce je soubor již uveřejněných nebo do tisku nebo k jinému typu zveřejnění přijatých prací k danému tématu, který student opatří uceleným úvodem do problematiky a komentářem (čl. 31, odst. 2 Studijního a zkušebního řádu MU). Formální požadavky na podobu disertační práce jsou upraveny Opatřením děkana Přírodovědecké fakulty č. 5/2012.

  • Další informace

Základní údaje

Typ
doktorský
Titul
Ph.D.
Doba studia
4 roky
Vyučovací jazyk
angličtina angličtina
Roční poplatek za studium
3000 €

Přírodovědecká fakulta
Program zajišťuje