Whole Genome Sequence of Treponema pallidum ssp. pallidum,
Strain Mexico A, Suggests Recombination between Yaws and
Syphilis Strains

J 2012

Whole Genome Sequence of Treponema pallidum ssp. pallidum, Strain Mexico A, Suggests Recombination between Yaws and Syphilis Strains

PĚTROŠOVÁ, Helena, Marie ZOBANÍKOVÁ, Darina ČEJKOVÁ, Lenka MIKALOVÁ, Petra POSPÍŠILOVÁ et. al.

Základní údaje

Originální název

Whole Genome Sequence of Treponema pallidum ssp. pallidum, Strain Mexico A, Suggests Recombination between Yaws and Syphilis Strains

Autoři

PĚTROŠOVÁ, Helena (203 Česká republika, garant, domácí), Marie ZOBANÍKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Darina ČEJKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Lenka MIKALOVÁ (203 Česká republika, domácí), Petra POSPÍŠILOVÁ (203 Česká republika, domácí), Michal STROUHAL (203 Česká republika, domácí), Lei CHEN (840 Spojené státy), Xiang QIN (840 Spojené státy), Donna M. MUZNY (840 Spojené státy), George M. WEINSTOCK (840 Spojené státy) a David ŠMAJS (203 Česká republika, domácí)

Vydání

PLOS Neglected Tropical Diseases, 2012, 1935-2735

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

URL

Impakt faktor

Impact factor: 4.569

Kód RIV

RIV/00216224:14110/12:00057663

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

DOI

http://dx.doi.org/10.1371/journal.pntd.0001832

UT WoS

000309528100032

Klíčová slova anglicky

Treponema pallidum; Mexico A strain; genome; syphilis; inter-strain recombination

Příznaky

Mezinárodní význam

Změněno: 3. 4. 2013 17:53, Ing. Mgr. Věra Pospíšilíková

Anotace

V originále

Treponema pallidum is a Gram-negative spirochete that causes diseases with distinct clinical manifestations and uses different transmission strategies. While syphilis (caused by subspecies pallidum) is a worldwide venereal and congenital disease, yaws (caused by subspecies pertenue) is a tropical disease transmitted by direct skin contact. Currently the genetic basis and evolution of these diseases remain unknown. In this study, we describe a high quality whole genome sequence of T. pallidum ssp. pallidum strain Mexico A, determined using the ?next generation? sequencing technique (Illumina). Although the genome of this strain contains no large rearrangements in comparison with other treponemal genomes, we found two genes which combined sequences from both subspecies pallidum and pertenue. The observed mosaic character of these two genes is likely a result of inter-strain recombination between pallidum and pertenue during simultaneous infection of a single host.

Návaznosti

GAP302/12/0574, projekt VaV

Název: Celogenomové sekvencování v analýze genomů a transkriptomů patogenních bakterií rodu Treponema

Investor: Grantová agentura ČR, Celogenomové sekvencování v analýze genomů a transkriptomů patogenních bakterií rodu Treponema

GA310/04/0021, projekt VaV

Název: Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum

Investor: Grantová agentura ČR, Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum

MSM0021622415, záměr

Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

NT11159, projekt VaV

Název: Mapování výskytu makrolidové rezistence původce syfilis v ČR a molekulární typizace jednotlivých syfilitických kmenů

Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Mapování výskytu makrolidové rezistence původce syfilis v ČR a molekulární typizace jednotlivých syfilitických kmenů

Citovat

PĚTROŠOVÁ, Helena, Marie ZOBANÍKOVÁ, Darina ČEJKOVÁ, Lenka MIKALOVÁ, Petra POSPÍŠILOVÁ, Michal STROUHAL, Lei CHEN, Xiang QIN, Donna M. MUZNY, George M. WEINSTOCK a David ŠMAJS. Whole Genome Sequence of Treponema pallidum ssp. pallidum, Strain Mexico A, Suggests Recombination between Yaws and Syphilis Strains. PLOS Neglected Tropical Diseases. 2012, roč. 6, č. 9, s. "nestrankovano", 10 s. ISSN 1935-2735. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pntd.0001832.

@article{1069116,
   author = {Pětrošová, Helena and Zobaníková, Marie and Čejková, Darina and Mikalová, Lenka and Pospíšilová, Petra and Strouhal, Michal and Chen, Lei and Qin, Xiang and Muzny, Donna M. and Weinstock, George M. and Šmajs, David},
   article_number = {9},
   doi = {http://dx.doi.org/10.1371/journal.pntd.0001832},
   keywords = {Treponema pallidum; Mexico A strain; genome; syphilis; inter-strain recombination},
   language = {eng},
   issn = {1935-2735},
   journal = {PLOS Neglected Tropical Diseases},
   note = {Art. No. e1832},
   title = {Whole Genome Sequence of Treponema pallidum ssp. pallidum, Strain Mexico A, Suggests Recombination between Yaws and Syphilis Strains},
   url = {http://www.plosntds.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pntd.0001832},
   volume = {6},
   year = {2012}
}

TY  - JOUR
ID  - 1069116
AU  - Pětrošová, Helena - Zobaníková, Marie - Čejková, Darina - Mikalová, Lenka - Pospíšilová, Petra - Strouhal, Michal - Chen, Lei - Qin, Xiang - Muzny, Donna M. - Weinstock, George M. - Šmajs, David
PY  - 2012
TI  - Whole Genome Sequence of Treponema pallidum ssp. pallidum, Strain Mexico A, Suggests Recombination between Yaws and Syphilis Strains
JF  - PLOS Neglected Tropical Diseases
VL  - 6
IS  - 9
SP  - "nestrankovano"
EP  - "nestrankovano"
SN  - 19352735
N1  - Art. No. e1832
KW  - Treponema pallidum
KW  - Mexico A strain
KW  - genome
KW  - syphilis
KW  - inter-strain recombination
UR  - http://www.plosntds.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pntd.0001832
L2  - http://www.plosntds.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pntd.0001832
N2  - Treponema pallidum is a Gram-negative spirochete that causes diseases with distinct clinical manifestations and uses different transmission strategies. While syphilis (caused by subspecies pallidum) is a worldwide venereal and congenital disease, yaws (caused by subspecies pertenue) is a tropical disease transmitted by direct skin contact. Currently the genetic basis and evolution of these diseases remain unknown. In this study, we describe a high quality whole genome sequence of T. pallidum ssp. pallidum strain Mexico A, determined using the ?next generation? sequencing technique (Illumina). Although the genome of this strain contains no large rearrangements in comparison with other treponemal genomes, we found two genes which combined sequences from both subspecies pallidum and pertenue. The observed mosaic character of these two genes is likely a result of inter-strain recombination between pallidum and pertenue during simultaneous infection of a single host.
ER  -

PĚTROŠOVÁ, Helena, Marie ZOBANÍKOVÁ, Darina ČEJKOVÁ, Lenka MIKALOVÁ, Petra POSPÍŠILOVÁ, Michal STROUHAL, Lei CHEN, Xiang QIN, Donna M. MUZNY, George M. WEINSTOCK a David ŠMAJS. Whole Genome Sequence of Treponema pallidum ssp. pallidum, Strain Mexico A, Suggests Recombination between Yaws and Syphilis Strains. \textit{PLOS Neglected Tropical Diseases}. 2012, roč.~6, č.~9, s.~''nestrankovano'', 10 s. ISSN~1935-2735. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pntd.0001832.

Podrobný výpis o publikaci