Complete genome sequence of Treponema pallidum strain DAL-1

J 2012

Complete genome sequence of Treponema pallidum strain DAL-1

ZOBANÍKOVÁ, Marie; Pavol MIKOLKA; Darina ČEJKOVÁ; Petra POSPÍŠILOVÁ; Lei CHEN et al.

Základní údaje

Originální název

Complete genome sequence of Treponema pallidum strain DAL-1

Autoři

ZOBANÍKOVÁ, Marie; Pavol MIKOLKA; Darina ČEJKOVÁ; Petra POSPÍŠILOVÁ; Lei CHEN; Michal STROUHAL; Xiang QIN; George M. WEINSTOCK a David ŠMAJS

Vydání

Standards in Genomic Sciences, 2012, 1944-3277

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

URL

Impakt faktor

Impact factor: 2.007

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14110/12:00057665

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

DOI

https://doi.org/10.4056/sigs.2615838

UT WoS

000314405900002

Klíčová slova anglicky

Spirochaetaceae; Treponema pallidum; syphilis

Příznaky

Mezinárodní význam

Změněno: 18. 10. 2012 09:48, Mgr. Michal Petr

Anotace

V originále

Treponema pallidum strain DAL-1 is a human uncultivable pathogen causing the sexually transmitted disease syphilis. Strain DAL-1 was isolated from the amniotic fluid of a pregnant woman in the secondary stage of syphilis. Here we describe the 1,139,971 bp long genome of T. pallidum strain DAL-1 which was sequenced using two independent sequencing methods (454 pyrosequencing and Illumina). In rabbits, strain DAL-1 replicated better than the T. pallidum strain Nichols. The comparison of the complete DAL-1 genome sequence with the Nichols sequence revealed a list of genetic differences that are potentially responsible for the increased rabbit virulence of the DAL-1 strain.

Návaznosti

GA310/07/0321, projekt VaV

Název: Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum

Investor: Grantová agentura ČR, Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum

MSM0021622415, záměr

Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Citovat

ZOBANÍKOVÁ, Marie; Pavol MIKOLKA; Darina ČEJKOVÁ; Petra POSPÍŠILOVÁ; Lei CHEN; Michal STROUHAL; Xiang QIN; George M. WEINSTOCK a David ŠMAJS. Complete genome sequence of Treponema pallidum strain DAL-1. Standards in Genomic Sciences. 2012, roč. 7, č. 1, s. "nestrankovano", 13 s. ISSN 1944-3277. Dostupné z: https://doi.org/10.4056/sigs.2615838.

@article{1069120,
   author = {Zobaníková, Marie and Mikolka, Pavol and Čejková, Darina and Pospíšilová, Petra and Chen, Lei and Strouhal, Michal and Qin, Xiang and Weinstock, George M. and Šmajs, David},
   article_number = {1},
   doi = {https://doi.org/10.4056/sigs.2615838},
   keywords = {Spirochaetaceae; Treponema pallidum; syphilis},
   language = {eng},
   issn = {1944-3277},
   journal = {Standards in Genomic Sciences},
   title = {Complete genome sequence of Treponema pallidum strain DAL-1},
   url = {http://standardsingenomics.org/index.php/sigen/article/view/sigs.2615838/784},
   volume = {7},
   year = {2012}
}

TY  - JOUR
ID  - 1069120
AU  - Zobaníková, Marie - Mikolka, Pavol - Čejková, Darina - Pospíšilová, Petra - Chen, Lei - Strouhal, Michal - Qin, Xiang - Weinstock, George M. - Šmajs, David
PY  - 2012
TI  - Complete genome sequence of Treponema pallidum strain DAL-1
JF  - Standards in Genomic Sciences
VL  - 7
IS  - 1
SP  - "nestrankovano"
EP  - "nestrankovano"
SN  - 19443277
KW  - Spirochaetaceae
KW  - Treponema pallidum
KW  - syphilis
UR  - http://standardsingenomics.org/index.php/sigen/article/view/sigs.2615838/784
L2  - http://standardsingenomics.org/index.php/sigen/article/view/sigs.2615838/784
N2  - Treponema pallidum strain DAL-1 is a human uncultivable pathogen causing the sexually transmitted disease syphilis. Strain DAL-1 was isolated from the amniotic fluid of a pregnant woman in the secondary stage of syphilis. Here we describe the 1,139,971 bp long genome of T. pallidum strain DAL-1 which was sequenced using two independent sequencing methods (454 pyrosequencing and Illumina). In rabbits, strain DAL-1 replicated better than the T. pallidum strain Nichols. The comparison of the complete DAL-1 genome sequence with the Nichols sequence revealed a list of genetic differences that are potentially responsible for the increased rabbit virulence of the DAL-1 strain.
ER  -

ZOBANÍKOVÁ, Marie; Pavol MIKOLKA; Darina ČEJKOVÁ; Petra POSPÍŠILOVÁ; Lei CHEN; Michal STROUHAL; Xiang QIN; George M. WEINSTOCK a David ŠMAJS. Complete genome sequence of Treponema pallidum strain DAL-1. \textit{Standards in Genomic Sciences}. 2012, roč.~7, č.~1, s.~''nestrankovano'', 13 s. ISSN~1944-3277. Dostupné z: https://doi.org/10.4056/sigs.2615838.

Přehled o publikaci