Význam dlouhých nekódujících RNA u nádorových onemocnění

ŠÁNA, Jiří, Petra FALTEJSKOVÁ, Simona HANKEOVÁ, Marek SVOBODA, Rostislav VYZULA a Ondřej SLABÝ. Význam dlouhých nekódujících RNA u nádorových onemocnění. In VIII. dny diagnostické, prediktivní a experimentální onkologie, Olomouc, 2012. 2012. ISSN 1802-4475.

Základní údaje

• Originální název: Význam dlouhých nekódujících RNA u nádorových onemocnění
• Název anglicky: The role of long non-coding RNAs in cancers
• Autoři: ŠÁNA, Jiří (203 Česká republika, domácí), Petra FALTEJSKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Simona HANKEOVÁ (203 Česká republika, domácí), Marek SVOBODA (203 Česká republika), Rostislav VYZULA (203 Česká republika) a Ondřej SLABÝ (203 Česká republika, garant, domácí).
• Vydání: VIII. dny diagnostické, prediktivní a experimentální onkologie, Olomouc, 2012, 2012.

Další údaje

• Originální jazyk: čeština
• Typ výsledku: Konferenční abstrakt
• Obor: 30200 3.2 Clinical medicine
• Stát vydavatele: Česká republika
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• Kód RIV: RIV/00216224:14740/12:00062156
• Organizační jednotka: Středoevropský technologický institut
• ISSN: 1802-4475
• Klíčová slova česky: nekódující RNA; microRNAs; siRNAs; piRNAs; lncRNAs; nádorová onemocnění
• Klíčová slova anglicky: non-coding RNAs; microRNAs; siRNAs; piRNAs; lncRNAs; cancer

Anotace

Většinu eukaryotického genomu představují DNA sekvence, které nekódují proteiny. Tyto sekvence jsou přepisovány buď podle vývojového programu daného organizmu, nebo v rámci odpovědi na vnější signály. Výsledkem transkripce takových sekvencí je pak velké množství dlouhých nekódujících RNA (lncRNA). Celogenomvé studie předpokládají existenci více než 3 300 lncRNA. Dlouhé nekódující RNA jsou definovány jako molekuly nekódujících RNA o délce více než 200 nukleotidů. Ačkoli bylo dosud funkčně charakterizováno pouze omezené množství lncRNA, jejich regulační potenciál je již dnes evidentní. LncRNA hrají klíčové role jak v tanskripčních, tak v posttranskripčních regulačních drahách. U mnoha nádorových onemocnění dochází k deregulaci lncRNA, co společně s jejich funkčními vlastnostmi naznačuje jejich potenciál v procesech maligní transformace. Jednou ze tříd lncRNA jsou přepisované vysoce konzervované oblasti (T-UCR) vyznačující se vysokou homologií mezi ortologními oblastmi lidského, potkaního a myšího genomu. V současné době je známo 481 takových sekvencí. Z funkčního hlediska se T-UCR jeví jako inhibitory proteinkódujících genů a některých nekódujících RNA, včetně mikroRNA. Nedávané studie naznačily, že epxrese T-UCR je u vybraných nádorových onemocnění deregulována a dokonce koreluje s klinicko-patologickými charakteristikami pacientů. Výsledky naší práce budou zaměřené na studium T-UCR u CRC.

Anotace anglicky

The main part of eukaryotic genom is represented by DNA sequences that do not encode proteins. These sequences are transcribed according to developmental programm of particular organism or as an answer on external signals. It results in existence of large amount of long non-coding RNAs (lncRNAs). Whole-genome studies suppose that more than 3 300 lncRNAs exist. lncRNAs are defined as molecules of non-coding RNAs that are longer than 200 nucleotides. Up to now, only several lncRNAs have to been characterized, however, their regulatory potencial is evident. They play key roles in transcriptional as well as in post-transcriptional regulatory processes. They are often deregulated in different types of cancers and can affect the processes of malignant transformation. One of the class of lncRNAs are transcribed ultraconserved regionsa (T-UCR) that are highly homologic among human, rat and mouse genomes. Currently, 481 T-UCRs are known. They probably function as inhibitors of protein-coding genes and some non-coding RNAs including miRNAs. Recent studies proved that expression of T-UCR is deregulated in different types of cancers and correlates with clinical-pathological characteristics of patients. The results of our research are focused on the study of T-UCRs in CRC samples.

Návaznosti

• ED1.1.00/02.0068, projekt VaV: Název: CEITEC - central european institute of technology
• NT13514, projekt VaV: Název: Analýza mikroRNA v glioblastomových kmenových buňkách: predikce léčebné odpovědi a identifikace nových terapeutických cílů u pacientů s glioblastomem