a 2012

Hladiny miR-210 v nádorové tkáni a funkční efekty jejího utlumení na buňky renálního karcinomu

ILIEV, Robert; Martina RÉDOVÁ; Alexandr POPRACH; Andrej BEŠŠE; Kateřina KANTOROVÁ et al.

Základní údaje

Originální název

Hladiny miR-210 v nádorové tkáni a funkční efekty jejího utlumení na buňky renálního karcinomu

Název anglicky

The levels of miR-210 in tumor tissue and function of this miRNA in renal cell carcinoma

Autoři

ILIEV, Robert; Martina RÉDOVÁ; Alexandr POPRACH; Andrej BEŠŠE; Kateřina KANTOROVÁ; Jana NEKVINDOVÁ; Radek LAKOMÝ; Lenka RADOVÁ; Marek SVOBODA; Rostislav VYZULA a Ondřej SLABÝ

Vydání

VIII. dny diagnostické, prediktivní a experimentální onkologie, Olomouc, 2012, 2012

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

30200 3.2 Clinical medicine

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14740/12:00064923

Organizační jednotka

Středoevropský technologický institut

ISSN

Klíčová slova česky

mikroRNA; prognostické markery; renální karcinom; in vitro analýzy

Klíčová slova anglicky

microRNA; prognostic markers; renal cell carcinoma; in vitro analyses
Změněno: 4. 12. 2012 12:45, Mgr. Petra Vychytilová, Ph.D.

Anotace

V originále

Renální karcinom (RCC) je nejčastější nádorové onemocnění ledvin v dospělém věku čítající asi 3 % dospělých malignit. MikroRNA (miRNA) jsou krátké nekódující jednovláknové RNA, které regulují genovou expresi na post-transkripční úrovni. Za použití qRT-PCR TaqMan low density array (TLDA) jsme analyzovali globální expresní profily miRNA u RCC a u nenádorového renálního parenchymu. Získaná data byla normalizována (RNU48, RNU6B) a poté statisticky vyhodnocena v prostředí statistického jazka R pomocí programu Bioconductor v kombinaci s hierarchickým klastrováním. Získaná data jsme dále validovali na nezávislém souboru pacientů. In vitro experimenty byly prováděny na buněčných liniích renálního karcinomu ACHN a CAKI-2, kde jsme analyzovali vliv transfekce anti-miR-210 na životaschopnost buněk, apoptózu, buněčný cyklus, migraci a invazivitu.

Anglicky

Renal cell carcinoma (RCC) is the most frequent tumor disease of kidneys of adults. MicroRNAs (miRNAs) are short non-coding singlestranded RNAs that post-transcriptionally regulate gene expression. Using qRT-PCR TaqMan low density array (TLDA), global expression profiles of miRNAs in RCC and non-tumoral parenchym were analyzed. Data were normalized using RNU48 and RNU6B and subsequently analyzed in R using Bioconductor and hierarchical clustering. The results were further validated on independent set of samples. Finally, in vitro analyses were carried out using cell lines ACHN and CAKI-2 and effects of transfection of anti-miR-210 on cell viability, apoptosis, cell cycle, migration and invasivity were analyzed.

Návaznosti

NT13547, projekt VaV
Název: Studium mikroRNA a genů asociovaných s procesem epiteliálně-mezenchymální tranzice jako potenciálních markerů pro predikci rizika a časný záchyt metastazování u pacientů s renálním karcinomem