Metodické aspekty analýzy extracelulárních mikroRNA v moči pro účely diagnostiky urologických nádorů

MLČOCHOVÁ, Hana, Renata HÉŽOVÁ, Barbora PELTANOVÁ, Jan DOLEŽEL, Alexandr POPRACH, Radek LAKOMÝ a Ondřej SLABÝ. Metodické aspekty analýzy extracelulárních mikroRNA v moči pro účely diagnostiky urologických nádorů. In VIII. dny diagnostické, prediktivní a experimentální onkologie, Olomouc, 2012. ISSN 1802-4475. 2012.

Základní údaje

• Originální název: Metodické aspekty analýzy extracelulárních mikroRNA v moči pro účely diagnostiky urologických nádorů
• Název anglicky: Methodical aspects of analysis of extracellular microRNAs in urine for the purpose of diagnosticts of urological tumors
• Autoři: MLČOCHOVÁ, Hana (203 Česká republika, domácí), Renata HÉŽOVÁ (203 Česká republika, domácí), Barbora PELTANOVÁ (203 Česká republika, domácí), Jan DOLEŽEL (203 Česká republika), Alexandr POPRACH (203 Česká republika), Radek LAKOMÝ (203 Česká republika) a Ondřej SLABÝ (203 Česká republika, garant, domácí).
• Vydání: VIII. dny diagnostické, prediktivní a experimentální onkologie, Olomouc, 2012, 2012.

Další údaje

• Originální jazyk: čeština
• Typ výsledku: Konferenční abstrakt
• Obor: 30200 3.2 Clinical medicine
• Stát vydavatele: Česká republika
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• Kód RIV: RIV/00216224:14740/12:00062170
• Organizační jednotka: Středoevropský technologický institut
• ISSN: 1802-4475
• Klíčová slova česky: mikroRNA; diagnostické markery; urologické nádory; qRT-PCR
• Klíčová slova anglicky: microRNA; diagnostic markers; urological tumors; qRT-PCR

Anotace

Nádory močového měchýře, ledvin a prostaty jako nejvýznamnější urologické malignity představují v ČR přibližně 13 % nově diagnostikovaných zhoubných nádorů a podílejí se ze 3 % na celkové populační úmrtnosti. Zatímco v případě karcinomu prostaty je k dispozici účinný sérový biomarker PSA, u renálního či uroteliálního karcinomu žádný podobný biomarker není dostupný. V současné době je velmi moderním přístupem při studiu a klasifikaci solidních nádorů na molekulární úrovni analýza mikroRNA (miRNA). MiRNA jsou krátké nekódující RNA schopné post-transkripčně regulovat expresi více než poloviny genů v lidském genomu, včetně významných onkogenů či nádorových supresorů. Změny expresních profilů miRNA v nádorové tkáni, stejně jako v tělních tekutinách, jsou dnes intenzivně studovány u celé řady nádorových onemocnění včetně urologickcýh nádorů. V posledních 3 letech bylo publikováno několik prací zabývajících se možným využitím miRNA v moči pro účely diagnostiky urologických nádorů. Před použitím močových miRNA jako nové třídy biomarkerů pro onkologickou diagnostiku je ovšem nutné vyřešit celou řadu metodických aspektů jejich analýzy. Hlavním cílem naší práce bylo analyzovat vybrané miRNA (miR-125b, miR-21) v supernatantu moči metodou qRT-PCR na souboru zdravých kontrol a nastavit základní parametry analýzy, stanovit vhodnou endogenní kontrolu a ověřit stabilitu miRNA. Následně byla optimalizována metodika detekce miRNA v moči aplikována ve studiích zaměřených na identifikaci diagnostických biomarkerů u renálního a uroteliálního karcinomu. Výsledky pilotní studie jsou součástí našeho sdělení.

Anotace anglicky

Tumors of urinary bladder, kidneys and prostate are very often in the Czech Republic and are responsible for 3% of cancer related death. This is because there is no reliable and sensitive biomarker. MicroRNAs (miRNAs) are short non-coding RNAs that post-transcriptionally regulate gene expression of more then one-half of human genes including important oncogens and tumor suppressors. Deregulated expression profiles of miRNAs have been described in tumor tissues as well as in body fluids. Recently, several papers were published analyzing miRNAs in urine in order to diagnose early stages of urological tumors. Before it will be possible to use urine miRNAs as new biomarkers, it is necessary to solve several problems and methodical approaches. The main aim of our study was to analyze expression of miR-125b and miR-21 in supernatant of urine of healthy donors using qRT-PCR and set the main parameters of analysis, find an appropriate endogenous control and vereficate the stability of miRNAs. Subsequently, the methods of detection were optimized.

Návaznosti

• NT13547, projekt VaV: Název: Studium mikroRNA a genů asociovaných s procesem epiteliálně-mezenchymální tranzice jako potenciálních markerů pro predikci rizika a časný záchyt metastazování u pacientů s renálním karcinomem