Molekulární mechanismy metastazování u low-grade karcinomů
prsu: Od proteomického profilování k funkční charakterizaci

p 2012

Molekulární mechanismy metastazování u low-grade karcinomů prsu: Od proteomického profilování k funkční charakterizaci

BOUCHAL, Pavel; Monika DVOŘÁKOVÁ; Theodoros ROUMELIOTIS; Iva STRUHÁROVÁ; Eva BUDINSKÁ et al.

Základní údaje

Originální název

Molekulární mechanismy metastazování u low-grade karcinomů prsu: Od proteomického profilování k funkční charakterizaci

Autoři

BOUCHAL, Pavel; Monika DVOŘÁKOVÁ; Theodoros ROUMELIOTIS; Iva STRUHÁROVÁ; Eva BUDINSKÁ; Zbyněk BORTLÍČEK; Juraj LENČO; Spiros D. GARBIS; Rudolf NENUTIL a Bořivoj VOJTĚŠEK

Vydání

XXIII. Biochemický sjezd. Brno, 26.-29.8. 2012. p. 86, 2012

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Vyžádané přednášky

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Označené pro přenos do RIV

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

Klíčová slova anglicky

proteomics, breast cancer

Změněno: 24. 3. 2017 18:19, doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D.

Anotace

V originále

V první fázi projektu jsme se zaměřili na vyhledávání prometastatických cílů v souboru 96 charakterizovaných nádorů prsu zahrnujícího stratifikaci vzorků podle grade, exprese hormonálních receptorů a stavu lymfatických uzlin. Primární proteomická studie byla založena na metodice zahrnující štěpení komplexních lyzátů trypsinem, značení peptidů isobarickými značkami (iTRAQ), separaci peptidů dvourozměrnou kapalinovou chromatografií a identifikaci a kvantifikaci proteinů na bázi vysokorozlišovací hmotnostní spektrometrie (iTRAQ-2DLC-MS/MS). Soubor 95 vybraných genů pak byl profilován na transkriptové úrovni. Statistika zahrnující Spearmanovu korelaci odhalila dva klastry související se stavem lymfatických uzlin u low garde karcinomů. Sada proteinů, změny jejichž exprese byly potvrzeny na proteinové i transkriptové úrpovni, byla dále validována pomocí imunohostochemie. Naše výsledky potvrzují, že molekulární mechanismy metastazování u low-grade karcinomů prsu zahrnují aktivaci proteolýzy, NF-kappaB dráhy, změny v cytoskeletálních a adhezních proteinech a liší se od mechanismů u high-grade karcinomů. V další fázi výzkumného programu se zaměřujeme na funkční charakterizaci identifikovaných proteinů zejména ve vztahu k buněčné migraci. Exprese cytoskeletálního aktin vážícího souboru transgelinu byla umlčena v buněčné linii BT549 pomocí siRNA, což výrazně snížilo migrační vlastnosti buněk. Analýza protein-protein interakcí pomocí proteomického přístupu odhalila cathepsin D, marker špatné prognózy u karcinomu prsu, jako jeden ze silných interakčních partnerů transgelinu. Rovněž byla studována role methylace promotoru v regulaci genové exprese transgelinu. Zjištěné výsledky poukazují na významnou úlohu transgelinu v metastazování nádorů karcinomu prsu. Práce byla podporována projektem Grantové agentury České republiky č. P304/10/0868 a Evropským fondem pro regionální rozvoj a státním rozpočtem České republiky (RECAMO, CZ.1.05/2.1.00/03.0101).

Návaznosti

GAP304/10/0868, projekt VaV

Název: Studium molekulárních mechanismů časného metastazování do lymfatických uzlin u karcinomu prsu nízkého stupně malignity pomocí proteomických technik

Investor: Grantová agentura ČR, Studium molekulárních mechanismů časného metastazování do lymfatických uzlin u karcinomu prsu nízkého stupně malignity pomocí proteomických technik

Citovat

BOUCHAL, Pavel; Monika DVOŘÁKOVÁ; Theodoros ROUMELIOTIS; Iva STRUHÁROVÁ; Eva BUDINSKÁ; Zbyněk BORTLÍČEK; Juraj LENČO; Spiros D. GARBIS; Rudolf NENUTIL a Bořivoj VOJTĚŠEK. Molekulární mechanismy metastazování u low-grade karcinomů prsu: Od proteomického profilování k funkční charakterizaci. In XXIII. Biochemický sjezd. Brno, 26.-29.8. 2012. p. 86. 2012.

@misc{1094693,
   author = {Bouchal, Pavel and Dvořáková, Monika and Roumeliotis, Theodoros and Struhárová, Iva and Budinská, Eva and Bortlíček, Zbyněk and Lenčo, Juraj and Garbis, Spiros D. and Nenutil, Rudolf and Vojtěšek, Bořivoj},
   booktitle = {XXIII. Biochemický sjezd. Brno, 26.-29.8. 2012. p. 86},
   keywords = {proteomics, breast cancer},
   language = {cze},
   title = {Molekulární mechanismy metastazování u low-grade karcinomů prsu: Od proteomického profilování k funkční charakterizaci},
   year = {2012}
}

TY  - SLIDE
ID  - 1094693
AU  - Bouchal, Pavel - Dvořáková, Monika - Roumeliotis, Theodoros - Struhárová, Iva - Budinská, Eva - Bortlíček, Zbyněk - Lenčo, Juraj - Garbis, Spiros D. - Nenutil, Rudolf - Vojtěšek, Bořivoj
PY  - 2012
TI  - Molekulární mechanismy metastazování u low-grade karcinomů prsu: Od proteomického profilování k funkční charakterizaci
KW  - proteomics, breast cancer
N2  - V první fázi projektu jsme se zaměřili na vyhledávání prometastatických cílů v souboru 96 charakterizovaných nádorů prsu zahrnujícího stratifikaci vzorků podle grade, exprese hormonálních receptorů a stavu lymfatických uzlin. Primární proteomická studie byla založena na metodice zahrnující štěpení komplexních lyzátů trypsinem, značení peptidů isobarickými značkami (iTRAQ), separaci peptidů dvourozměrnou kapalinovou chromatografií a identifikaci a kvantifikaci proteinů na bázi vysokorozlišovací hmotnostní spektrometrie (iTRAQ-2DLC-MS/MS). Soubor 95 vybraných genů pak byl profilován na transkriptové úrovni. Statistika zahrnující Spearmanovu korelaci odhalila dva klastry související se stavem lymfatických uzlin u low garde karcinomů. Sada proteinů, změny jejichž exprese byly potvrzeny na proteinové i transkriptové úrpovni, byla dále validována pomocí imunohostochemie. Naše výsledky potvrzují, že molekulární mechanismy metastazování u low-grade karcinomů prsu zahrnují aktivaci proteolýzy, NF-kappaB dráhy, změny v cytoskeletálních a adhezních proteinech a liší se od mechanismů u high-grade karcinomů. V další fázi výzkumného programu se zaměřujeme na funkční charakterizaci identifikovaných proteinů zejména ve vztahu k buněčné migraci. Exprese cytoskeletálního aktin vážícího souboru transgelinu byla umlčena v buněčné linii BT549 pomocí siRNA, což výrazně snížilo migrační vlastnosti buněk. Analýza protein-protein interakcí pomocí proteomického přístupu odhalila cathepsin D, marker špatné prognózy u karcinomu prsu, jako jeden ze silných interakčních partnerů transgelinu. Rovněž byla studována role methylace promotoru v regulaci genové exprese transgelinu. Zjištěné výsledky poukazují na významnou úlohu transgelinu v metastazování nádorů karcinomu prsu. Práce byla podporována projektem Grantové agentury České republiky č. P304/10/0868 a Evropským fondem pro regionální rozvoj a státním rozpočtem České republiky (RECAMO, CZ.1.05/2.1.00/03.0101).
ER  -

BOUCHAL, Pavel; Monika DVOŘÁKOVÁ; Theodoros ROUMELIOTIS; Iva STRUHÁROVÁ; Eva BUDINSKÁ; Zbyněk BORTLÍČEK; Juraj LENČO; Spiros D. GARBIS; Rudolf NENUTIL a Bořivoj VOJTĚŠEK. Molekulární mechanismy metastazování u low-grade karcinomů prsu: Od proteomického profilování k funkční charakterizaci. In \textit{XXIII. Biochemický sjezd. Brno, 26.-29.8. 2012. p. 86}. 2012.

Přehled o publikaci