ČEJKOVÁ, Darina, Marie ZOBANÍKOVÁ, Petra POSPÍŠILOVÁ, Michal STROUHAL, Lenka MIKALOVÁ, George M. WEINSTOCK a David ŠMAJS. Structure of rrn operons in pathogenic noncultivable treponemes: sequence but not genomic position of intergenic spacers correlates with classification of Treponema pallidum and Treponema paraluiscuniculi strains. Journal of Medical Microbiology, Reading: Society for General Microbiology, 2013, roč. 62, č. 2, s. 196-207. ISSN 0022-2615. doi:10.1099/jmm.0.050658-0.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Structure of rrn operons in pathogenic noncultivable treponemes: sequence but not genomic position of intergenic spacers correlates with classification of Treponema pallidum and Treponema paraluiscuniculi strains
Autoři ČEJKOVÁ, Darina (203 Česká republika, domácí), Marie ZOBANÍKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Petra POSPÍŠILOVÁ (203 Česká republika, domácí), Michal STROUHAL (203 Česká republika, domácí), Lenka MIKALOVÁ (203 Česká republika, domácí), George M. WEINSTOCK (840 Spojené státy americké) a David ŠMAJS (203 Česká republika, garant, domácí).
Vydání Journal of Medical Microbiology, Reading, Society for General Microbiology, 2013, 0022-2615.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Spojené království
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor Impact factor: 2.266
Kód RIV RIV/00216224:14110/13:00065613
Organizační jednotka Lékařská fakulta
Doi http://dx.doi.org/10.1099/jmm.0.050658-0
UT WoS 000315554000004
Klíčová slova anglicky article; bacterial strain; bacterium isolate; controlled study; gene deletion; genotype; nonhuman; operon; polymerase chain reaction; priority journal; RNA sequence; Treponema; Treponema pallidum; Treponema paraluiscuniculi
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Ing. Mgr. Věra Pospíšilíková, učo 9005. Změněno: 15. 4. 2014 16:24.
Anotace
This study examined the sequences of the two rRNA (rrn) operons of pathogenic non-cultivable treponemes, comprising 11 strains of T. pallidum ssp. pallidum (TPA), five strains of T. pallidum ssp. pertenue (TPE), two strains of T. pallidum ssp. endemicum (TEN), a simian Fribourg-Blanc strain and a rabbit T. paraluiscuniculi (TPc) strain. PCR was used to determine the type of 16S- 23S ribosomal intergenic spacers in the rrn operons from 30 clinical samples belonging to five different genotypes. When compared with the TPA strains, TPc Cuniculi A strain had a 17 bp deletion, and the TPE, TEN and Fribourg-Blanc isolates had a deletion of 33 bp. Other than these deletions, only 17 heterogeneous sites were found within the entire region (excluding the 16S- 23S intergenic spacer region encoding tRNA-Ile or tRNA-Ala). The pattern of nucleotide changes in the rrn operons corresponded to the classification of treponemal strains, whilst two different rrn spacer patterns (Ile/Ala and Ala/Ile) appeared to be distributed randomly across species/ subspecies classification, time and geographical source of the treponemal strains. It is suggested that the random distribution of tRNA genes is caused by reciprocal translocation between repetitive sequences mediated by a recBCD-like system.
Návaznosti
GAP302/12/0574, projekt VaVNázev: Celogenomové sekvencování v analýze genomů a transkriptomů patogenních bakterií rodu Treponema
Investor: Grantová agentura ČR, Standardní projekty
NT11159, projekt VaVNázev: Mapování výskytu makrolidové rezistence původce syfilis v ČR a molekulární typizace jednotlivých syfilitických kmenů
Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Resortní program výzkumu a vývoje - MZ III. na léta 2010 - 2015 (IGA)
Typ Název Vložil/a Vloženo Práva
1115115 /1 Böhmová, S. 8. 7. 2013

Vlastnosti

Název
1115115
Aplikace
Obnovit.
Adresa v ISu
https://is.muni.cz/auth/repo/1115115/
Adresa ze světa
https://is.muni.cz/repo/1115115/
Adresa do Správce
https://is.muni.cz/auth/repo/1115115/?info
Ze světa do Správce
https://is.muni.cz/repo/1115115/?info
Vloženo
Po 8. 7. 2013 16:14, Soňa Böhmová

Práva

Právo číst
  • kdokoliv v Internetu
Právo vkládat
 
Právo spravovat
  • osoba Ing. Mgr. Věra Pospíšilíková, učo 9005
Atributy
 
cejkova.pdf   Verze souboru Böhmová, S. 8. 7. 2013

Práva

Právo číst
 
Právo vkládat
 
Právo spravovat
  • osoba Ing. Mgr. Věra Pospíšilíková, učo 9005
Atributy
 
Vytisknout
Požádat autora o autorský výtisk Zobrazeno: 15. 12. 2019 16:35