2013
Molecular characterization of brewing and wine yeast strains in the Czech Republic
KOPECKÁ, Jana; Dagmar MATOULKOVÁ; Markéta JELÍNKOVÁ; Jürgen FELSBERG; Miroslav NĚMEC et al.Základní údaje
Originální název
Molecular characterization of brewing and wine yeast strains in the Czech Republic
Název česky
Molekulární charakterizace pivovarských a vinařských kmenů kvasinek v České republice
Autoři
KOPECKÁ, Jana; Dagmar MATOULKOVÁ; Markéta JELÍNKOVÁ; Jürgen FELSBERG a Miroslav NĚMEC
Vydání
26th International Conference on Yeast Genetics and Molecular Biology, 2013
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Konferenční abstrakt
Obor
10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele
Velká Británie a Severní Irsko
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Odkazy
Impakt faktor
Impact factor: 1.742
Označené pro přenos do RIV
Ano
Kód RIV
RIV/00216224:14310/13:00069170
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
ISSN
UT WoS
Klíčová slova česky
pivovarské kvasinky vinařské kvasinky rozlišení
Klíčová slova anglicky
brewing yeasts wine yeasts differentiation
Příznaky
Mezinárodní význam
Změněno: 14. 12. 2013 11:29, Mgr. Jana Čmielová, Ph.D.
V originále
The hybrid origin of lager yeasts causes problems in determination of the technologically diverse species S. pastorianus and S. cerevisiae. Wine and brewing yeast S. cerevisiae could be differentiated on the DNA level. In our study we chose FLO and HIS4 gene, the regions ITS, RRL2 and YBR033w and mtDNA as target sequences. A group of 28 brewing, wine and type yeast strains was analyzed by PCR and RFLP techniques. Detection of flocculation genes did not document any species-specific representation in any of the strain under study. Gene LgFLO, considered as typical for lager yeast, was detected also in ale yeast. Other analyses led to an identical species classification only in 7 yeast strains. Using digestion of the ITS region, 26 strains, including all of lager yeast were identified as S. cerevisiae; this region is thus unsuitable for identification of industrial yeast strains. Identification of ale and lager yeast should partially reflect the maximum temperature of growth. However, growth at different temperatures did not allow for reliable differentiation. Digestion of mtDNA with 4 different enzymes resulted in 9-12 restriction pattern. Identical pattern have 4 of 9 ale with lager stran; wine yeast exhibitd different restriction pattern from brewing and type strains. This project was supported by MEYS, MŠMT in Czech (FRVŠ 424/2013).
Česky
Hybridní původ spodních pivovarských kvasinek často způsobuje problémy při určování technologických kmenů kvasinek S. pastorianus a S. cerevisiae. Vinařské a pivovarské kvasinky S. cerevisiae mohou být rozlišeny na úrovni DNA. V naší práci jsme jako cílové sekvence vybrali FLO a HIS4 geny, ITS, RRL2 a YBR033w regiony a mtDNA. Celkem 28 pivovarských, vinařských a typových kmenů kvasinek bylo analyzováno pomocí PCR a RFLP. Detekce flokulačních genů neodhalila druhově specifické zastoupení genů u studovaných kmenů. Gen LgFLO, který je typický pro spodní kvasinky, byl detekován i u schvrchních kvasinek. Ostatní analýzy se v druhovém určení shodovaly pouze u 7 kmenů. 26 kmenů, včetně všech spodních kvasinek, bylo určeno jako S. cerevisiae na základě štěpení ITS regionu; tento region je tedy nevhodný pro určení průmyslových kmenů kvasinek. Rozlišení spodních a svrchních kmenů by mělo odpovídat maximální teplotě růstu. Bohužel růst za různých teplot není spolehlivý marker pro identifikaci. Štěpení mtDNA č různými enzymy vedlo k 9-12 restrikčním profilům. 4 z 9 svrchních kmenů sdílelo stejný profil jako spodní kvasinky; vinařské kvasinky měly odlišný profil než pivovarské a typové kmeny. Tento projekt byl podpořen MŠMT (FRVŠ 424/2013).
Návaznosti
| FRVS/424/2013, interní kód MU |
|