Interaction of oligonucleotides with benzo[c]phenanthridine
alkaloid sanguilutine

J 2013

Interaction of oligonucleotides with benzo[c]phenanthridine alkaloid sanguilutine

RYBÁKOVÁ, Stanislava; Michal RÁJECKÝ; Jana URBANOVÁ; Kristýna PĚNČÍKOVÁ; Eva TÁBORSKÁ et al.

Základní údaje

Originální název

Interaction of oligonucleotides with benzo[c]phenanthridine alkaloid sanguilutine

Autoři

RYBÁKOVÁ, Stanislava; Michal RÁJECKÝ ; Jana URBANOVÁ; Kristýna PĚNČÍKOVÁ; Eva TÁBORSKÁ; Raimundo GARGALLO a Petr TÁBORSKÝ

Vydání

Chemical Papers, WARSAW, Versita, 2013, 0366-6352

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10406 Analytical chemistry

Stát vydavatele

Polsko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

URL

Impakt faktor

Impact factor: 1.193

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14310/13:00070284

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

DOI

https://doi.org/10.2478/s11696-013-0340-x

UT WoS

000314882900012

Klíčová slova anglicky

alkaloid; sanguilutine; DNA; intercalation; fluorescent probe; luminescence

Štítky

AKR, podil, rivok

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno

Změněno: 7. 4. 2014 13:01, Ing. Andrea Mikešková

Anotace

V originále

Benzo[c]phenanthridine alkaloid sanguilutine (present in plant Sanguinaria canadensis) was extracted and separated from the plant material (dried roots). Interaction of the positively charged iminium form of alkaloid with double stranded DNA is reported in this article. Significant changes in fluorescence properties in the presence or absence of various oligonucleotides have allowed us to study this system by means of luminescence spectroscopy. Results have shown that interaction with different double stranded oligonucleotides is not specific to A-T or G-C base pairs and also no preference of homogeneous or heterogeneous base composition of strands was found. Association constants (log K) were calculated to be in the range of 5.11 to 6.16. The response of luminescence intensity at 610 nm to low concentrations of double stranded DNA was found to be linear and can be potentially used for fluorometric quantification of DNA. The limit of detection was estimated to be 120 ng.ml-1 of DNA (calculated by 3 sigma method).

Návaznosti

LH12176, projekt VaV

Název: Benzofenanthridinové alkaloidy - studium účinků na celulární a molekulární úrovni (Akronym: KBF)

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Benzofenathridinové alkaloidy-studium účinků na celulární a molekulární úrovni

MUNI/A/0818/2012, interní kód MU

Název: Příspěvek chemických a biochemických metodik ke studiu molekulární podstaty vybraných patologických stavů a onemocnění (Akronym: BIOMET 2)

Investor: Masarykova univerzita, Příspěvek chemických a biochemických metodik ke studiu molekulární podstaty vybraných patologických stavů a onemocnění, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty

Citovat

RYBÁKOVÁ, Stanislava; Michal RÁJECKÝ; Jana URBANOVÁ; Kristýna PĚNČÍKOVÁ; Eva TÁBORSKÁ; Raimundo GARGALLO a Petr TÁBORSKÝ. Interaction of oligonucleotides with benzo[c]phenanthridine alkaloid sanguilutine. Chemical Papers. WARSAW: Versita, 2013, roč. 67, č. 5, s. 568-572. ISSN 0366-6352. Dostupné z: https://doi.org/10.2478/s11696-013-0340-x.

@article{1131047,
   author = {Rybáková, Stanislava and Rájecký, Michal and Urbanová, Jana and Pěnčíková, Kristýna and Táborská, Eva and Gargallo, Raimundo and Táborský, Petr},
   article_location = {WARSAW},
   article_number = {5},
   doi = {https://doi.org/10.2478/s11696-013-0340-x},
   keywords = {alkaloid; sanguilutine; DNA; intercalation; fluorescent probe; luminescence},
   language = {eng},
   issn = {0366-6352},
   journal = {Chemical Papers},
   title = {Interaction of oligonucleotides with benzo[c]phenanthridine alkaloid sanguilutine},
   url = {http://link.springer.com/article/10.2478%2Fs11696-013-0340-x},
   volume = {67},
   year = {2013}
}

TY  - JOUR
ID  - 1131047
AU  - Rybáková, Stanislava - Rájecký, Michal - Urbanová, Jana - Pěnčíková, Kristýna - Táborská, Eva - Gargallo, Raimundo - Táborský, Petr
PY  - 2013
TI  - Interaction of oligonucleotides with benzo[c]phenanthridine alkaloid sanguilutine
JF  - Chemical Papers
VL  - 67
IS  - 5
SP  - 568-572
EP  - 568-572
PB  - Versita
SN  - 03666352
KW  - alkaloid
KW  - sanguilutine
KW  - DNA
KW  - intercalation
KW  - fluorescent probe
KW  - luminescence
UR  - http://link.springer.com/article/10.2478%2Fs11696-013-0340-x
L2  - http://link.springer.com/article/10.2478%2Fs11696-013-0340-x
N2  - Benzo[c]phenanthridine alkaloid sanguilutine (present in plant Sanguinaria canadensis) was extracted and separated from the plant material (dried roots). Interaction of the positively charged iminium form of alkaloid with double stranded DNA is reported in this article. Significant changes in fluorescence properties in the presence or absence of various oligonucleotides have allowed us to study this system by means of luminescence spectroscopy. Results have shown that interaction with different double stranded oligonucleotides is not specific to A-T or G-C base pairs and also no preference of homogeneous or heterogeneous base composition of strands was found. Association constants (log K) were calculated to be in the range of 5.11 to 6.16. The response of luminescence intensity at 610 nm to low concentrations of double stranded DNA was found to be linear and can be potentially used for fluorometric quantification of DNA. The limit of detection was estimated to be 120 ng.ml-1 of DNA (calculated by 3 sigma method).
ER  -

RYBÁKOVÁ, Stanislava; Michal RÁJECKÝ; Jana URBANOVÁ; Kristýna PĚNČÍKOVÁ; Eva TÁBORSKÁ; Raimundo GARGALLO a Petr TÁBORSKÝ. Interaction of oligonucleotides with benzo[c]phenanthridine alkaloid sanguilutine. \textit{Chemical Papers}. WARSAW: Versita, 2013, roč.~67, č.~5, s.~568-572. ISSN~0366-6352. Dostupné z: https://doi.org/10.2478/s11696-013-0340-x.

Přehled o publikaci