HOUŠKA, Jan, Eladia María PEÑA-MÉNDEZ, Juan Ramón HERNANDEZ-FERNAUD, Eduardo SALIDO, Aleš HAMPL, Josef HAVEL a Petr VAŇHARA. Tissue profiling by nanogold-mediated mass spectrometry and artificial neural networks in the mouse model of human primary hyperoxaluria 1. Journal of Applied Biomedicine. České Budějovice: Faculty of Health and Social Care, University of South Bohemia, 2014, roč. 12, č. 2, s. 119-125. ISSN 1214-021X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jab.2013.12.001.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Tissue profiling by nanogold-mediated mass spectrometry and artificial neural networks in the mouse model of human primary hyperoxaluria 1
Autoři HOUŠKA, Jan (203 Česká republika, domácí), Eladia María PEÑA-MÉNDEZ (724 Španělsko), Juan Ramón HERNANDEZ-FERNAUD (724 Španělsko), Eduardo SALIDO (724 Španělsko), Aleš HAMPL (203 Česká republika, domácí), Josef HAVEL (203 Česká republika, domácí) a Petr VAŇHARA (203 Česká republika, garant, domácí).
Vydání Journal of Applied Biomedicine, České Budějovice, Faculty of Health and Social Care, University of South Bohemia, 2014, 1214-021X.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10406 Analytical chemistry
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 1.302
Kód RIV RIV/00216224:14110/14:00073478
Organizační jednotka Lékařská fakulta
Doi http://dx.doi.org/10.1016/j.jab.2013.12.001
UT WoS 000334441900007
Klíčová slova anglicky MALDI-TOF mass spectrometry; Primary hyperoxaluria I; Artificial neural networks; Diagnostics; Tissue profiling
Štítky artificial neural networks, EL OK, MALDI-TOF mass spectrometry, podil, Primary hyperoxaluria I
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Ing. Mgr. Věra Pospíšilíková, učo 9005. Změněno: 18. 1. 2015 18:52.
Anotace
Correct assessment of tissue histopathology is a necessary prerequisite for any clinical diagnosis. Nowadays, classical methods of histochemistry and immunohistochemistry are complemented by various techniques adopted from molecular biology and bioanalytical chemistry. Mass spectrometry profiling or imaging offered a new level of tissue visualization in the last decade, revealing hidden patterns of tissue molecular organization. It can be adapted to diagnostic purposes to improve decisions on complex and morphologically not apparent diagnoses. In this work, we successfully combined tissue profiling by mass spectrometry with analysis by artificial neural networks to classify normal and diseased liver and kidney tissues in a mouse model of primary hyperoxaluria type 1. Lack of the liver L-alanine: glyoxylate aminotransferase catalyzing conversion of L-alanine and glyoxylate to pyruvate and glycine causes accumulation of oxalate salts in various tissues, especially urinary system, resulting in compromised renal function and finally end stage renal disease. As the accumulation of oxalate salts alters chemical composition of affected tissues, it makes it available for examination by bioanalytical methods. We demonstrated that the direct tissue MALDI-TOF MS combined with neural computing offers an efficient tool for diagnosis of primary hyperoxaluria type I and potentially for other metabolic disorders altering chemical composition of tissues.
Návaznosti
GA202/07/1669, projekt VaVNázev: Depozice termomechanicky stabilních nanostrukturovaných diamantu-podobných tenkých vrstev ve dvojfrekvenčních kapacitních výbojích
Investor: Grantová agentura ČR, Depozice termomechanicky stabilních nanostrukturovaných diamantu-podobných tenkých vrstev ve dvojfrekvenčních kapacitních výbojích
MSM0021622411, záměrNázev: Studium a aplikace plazmochemických reakcí v neizotermickém nízkoteplotním plazmatu a jeho interakcí s povrchem pevných látek
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Studium a aplikace plazmochemických reakcí v neizotermickém nízkoteplotním plazmatu a jeho interakcí s povrchem pevných látek
MSM0021622430, záměrNázev: Funkční a molekulární charakteristiky nádorových a normálních kmenových buněk - identifikace cílů pro nová terapeutika a terapeutické strategie
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Funkční a molekulární charakteristiky nádorových a normálních kmenových buněk - identifikace cílů pro nová terapeutika a terapeutické strategie
MUNI/M/0041/2013, interní kód MUNázev: Bioanalytical Cell and Tissue Authentication using Physical Chemistry Methods and Artificial Intelligence
Investor: Masarykova univerzita, Bioanalytical Cell and Tissue Authentication using Physical Chemistry Methods and Artificial Intelligence, INTERDISCIPLINARY - Mezioborové výzkumné projekty
VytisknoutZobrazeno: 19. 9. 2024 13:24