ŠPONER, Jiří, Judit ŠPONEROVÁ, Arnošt MLÁDEK, Pavel BANÁŠ, Petr JURECKA a Michal OTYEPKA. How to understand quantum chemical computations on DNA and RNA systems? A practical guide for non-specialists. Methods. SAN DIEGO: ACADEMIC PRESS INC ELSEVIER SCIENCE, roč. 64, č. 1, s. 3-11. ISSN 1046-2023. doi:10.1016/j.ymeth.2013.05.025. 2013.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název How to understand quantum chemical computations on DNA and RNA systems? A practical guide for non-specialists
Autoři ŠPONER, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí), Judit ŠPONEROVÁ (348 Maďarsko, domácí), Arnošt MLÁDEK (203 Česká republika, domácí), Pavel BANÁŠ (203 Česká republika), Petr JURECKA (203 Česká republika) a Michal OTYEPKA (203 Česká republika).
Vydání Methods, SAN DIEGO, ACADEMIC PRESS INC ELSEVIER SCIENCE, 2013, 1046-2023.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Spojené státy
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor Impact factor: 3.221
Kód RIV RIV/00216224:14740/13:00072151
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.1016/j.ymeth.2013.05.025
UT WoS 000326430100002
Klíčová slova anglicky DNA structure; Quantum chemistry; Molecular mechanics; Molecular structures and energies
Štítky ok, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 15. 2. 2014 17:53.
Anotace
In this review primarily written for non-experts we explain basic methodological aspects and interpretation of modern quantum chemical (QM) computations applied to nucleic acids. We introduce current reference QM computations on small model systems consisting of dozens of atoms. Then we comment on recent advance of fast and accurate dispersion-corrected density functional theory methods, which will allow computations of small but complete nucleic acids building blocks in the near future. The qualitative difference between QM and molecular mechanics (MM, force field) computations is discussed. We also explain relation of QM and molecular simulation computations to experiments. (C) 2013 Elsevier Inc. All rights reserved.
Návaznosti
ED1.1.00/02.0068, projekt VaVNázev: CEITEC - central european institute of technology
VytisknoutZobrazeno: 28. 3. 2024 16:05