a 2013

Fish MHC genes - quality vs quantity

CIVÁŇOVÁ, Kristína

Základní údaje

Originální název

Fish MHC genes - quality vs quantity

Autoři

CIVÁŇOVÁ, Kristína (703 Slovensko, garant, domácí)

Vydání

ECIP, Annual Team Building Workshop No.2, Hradec nad Moravicí, Czech Republic, 2013, 2013

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Kód RIV

RIV/00216224:14310/13:00067000

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

Klíčová slova anglicky

MHC genes-qPCR-cyprinidae
Změněno: 16. 3. 2014 10:06, RNDr. Kristína Křížová, Ph.D.

Anotace

V originále

Even if the role, variability and evolutionary mechanism of selection of genes of major histocompatibility complex (MHC genes) has been proved for several times to be very important in immunoecological studies and in investigation of associations between multiple parasites and host immunocompetence in cyprinids, the question of quantitative expression of these genes stays still unanswered. Our research reveals that not only “quality” (genomic variability or allelic richness) but also “quantity” of these genes (active gene expression and its level) may play an important role in host-parasite interactions and may be useful for evolutionary and population studies. By utilizing two modern approaches (high resolution melting analysis – HRM and quantitative PCR – qPCR) we obtained notable primary results that could supplement or possibly stand in the analysis by classical methods in MHC research (CE-SSCP, automatic sequencing based on Sanger technology or 454 clonal pyrosequencing).

Návaznosti

GBP505/12/G112, projekt VaV
Název: ECIP - Evropské centrum ichtyoparazitologie
Investor: Grantová agentura ČR, ECIP - Evropské centrum ichtyoparazitologie