a 2014

The role of alternative splicing in auxin and cytokinin pathways

HRTYAN, Mónika; Eva ŠLIKOVÁ; Jan HEJÁTKO a Kamil RŮŽIČKA

Základní údaje

Originální název

The role of alternative splicing in auxin and cytokinin pathways

Autoři

HRTYAN, Mónika; Eva ŠLIKOVÁ; Jan HEJÁTKO ORCID a Kamil RŮŽIČKA

Vydání

9th Tri-National Arabidopsis Meeting (TNAM) 2014, 2014

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Německo

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14310/14:00077162

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

Klíčová slova anglicky

alternative splicing; PIN; AHP6; cell plate
Změněno: 13. 4. 2015 10:30, Olga Křížová

Anotace

V originále

Alternative splicing is a tightly regulated process accompanying gene expression. It leads to multiple protein variants from a single primary transcipt. Transcriptome sequencing revealed that >60 % of Arabidopsis genes are alternatively spliced. This raises the question if all the identified isoforms have biologically functional relevance. Our aim is to answer this question for three members of auxin and cytokinin pathways: PIN4 (PINFORMED 4), PIN7 and AHP6 (ARABIDOPSIS HISTIDINE PHOSPHOTRANSFER PROTEIN 6), where all of them are known to be processed into more alternatively spliced mRNAs. PIN4 and PIN7 are processed into two isoforms called a and b, respectively, which differ in their subcellular localization. Also two isoforms of AHP6 have been described, AHP6b and AHP6a. We found that both of them are expressed as stable proteins and are actively transported into nuclei.

Návaznosti

EE2.3.20.0189, projekt VaV
Název: Rozvoj výzkumné excelence v oblasti evoluční cytogenomiky, epigenetiky a buněčné signalizace