Genome-Wide Screening of Cytogenetic Abnormalities in Multiple
Myeloma Patients Using Array-CGH Technique: A Czech Multicenter
Experience

J 2014

Genome-Wide Screening of Cytogenetic Abnormalities in Multiple Myeloma Patients Using Array-CGH Technique: A Czech Multicenter Experience

SMETANA, Jan, Jan FRÖHLICH, Romana ZAORALOVÁ, Vladimíra VALLOVÁ, Henrieta GREŠLIKOVÁ et. al.

Základní údaje

Originální název

Genome-Wide Screening of Cytogenetic Abnormalities in Multiple Myeloma Patients Using Array-CGH Technique: A Czech Multicenter Experience

Autoři

SMETANA, Jan (203 Česká republika, garant, domácí), Jan FRÖHLICH (203 Česká republika, domácí), Romana ZAORALOVÁ (203 Česká republika, domácí), Vladimíra VALLOVÁ (703 Slovensko, domácí), Henrieta GREŠLIKOVÁ (703 Slovensko, domácí), Renata KUPSKÁ (203 Česká republika, domácí), Pavel NĚMEC (203 Česká republika, domácí), Aneta MIKULÁŠOVÁ (203 Česká republika, domácí), Martina ALMAŠI (203 Česká republika, domácí), Luděk POUR (203 Česká republika), Zdeněk ADAM (203 Česká republika), Viera SANDECKÁ (703 Slovensko), Lenka ZAHRADOVÁ (203 Česká republika), Roman HÁJEK (203 Česká republika, domácí) a Petr KUGLÍK (203 Česká republika, domácí)

Vydání

BioMed Research International, Hindawi Publishing Corporation, 2014, 2314-6133

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

URL

Impakt faktor

Impact factor: 1.579

Kód RIV

RIV/00216224:14310/14:00078288

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

DOI

http://dx.doi.org/10.1155/2014/209670

UT WoS

000337382600001

Klíčová slova anglicky

Multiple myeloma; genome-wide profiling; array-CGH; cytogenetics; FISH

Štítky

AKR, rivok

Příznaky

Recenzováno

Změněno: 8. 4. 2015 14:05, Ing. Andrea Mikešková

Anotace

V originále

Characteristic recurrent copy number aberrations (CNAs) play a key role in multiple myeloma (MM) pathogenesis and have important prognostic significance for MM patients. Array-based comparative genomic hybridization (aCGH) provides a powerful tool for genome-wide classification of CNAs and thus should be implemented into MM routine diagnostics. We demonstrate the possibility of effective utilization of oligonucleotide-based aCGH in 91 MM patients. Chromosomal aberrations associated with effect on the prognosis of MM were initially evaluated by I-FISH and were found in 93.4% (85/91). Incidence of hyperdiploidy was 49.5% (45/91); del(13)(q14) was detected in 57.1% (52/91); gain(1)(q21) occurred in 58.2% (53/91); del(17)(p13) was observed in 15.4% (14/91); and t(4;14)(p16;q32) was found in 18.6% (16/86). Genome-wide screening using Agilent 44K aCGH microarrays revealed copy number alterations in 100% (91/91). Most common deletions were found at 13q (58.9%), 1p (39.6%), and 8p (31.1%), whereas gain of whole 1q was the most often duplicated region (50.6%). Furthermore, frequent homozygous deletions of genes playing important role in myeloma biology such as TRAF3, BIRC1/BIRC2, RB1, or CDKN2C were observed. Taken together, we demonstrated the utilization of aCGH technique in clinical diagnostics as powerful tool for identification of unbalanced genomic abnormalities with prognostic significance for MM patients.

Návaznosti

EE2.3.20.0183, projekt VaV

Název: Centrum experimentální biomedicíny

MSM0021622434, záměr

Název: Od klasických prognostických markerů ke klinicky aplikovatelným farmakogenomickým a farmakoproteomickým projektům u mnohočetného myelomu a monoklonálních gamapatií

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Od klasických prognostických markerů ke klinicky aplikovatelným farmakogenomickým a farmakoproteomickým projektům u mnohočetného myelomu a monoklonálních gamapatií

NT11154, projekt VaV

Název: Úloha mitotické disrupce v B lymfocytech u mnohočetném myelomu

Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Úloha mitotické disrupce v B lymfocytech u mnohočetného myelomu

NT13190, projekt VaV

Název: Molekulární charakteristika centrozomálních abnormalit a jejich prognostický význam pro pacienty s mnohočetným myelomem

Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Molekulární charakteristika centrozomálních abnormalit a jejich prognostický význam pro pacienty s mnohočetným myelomem

NT13492, projekt VaV

Název: Úloha genetických abnormalit ve vývoji a progresi prekancerózy monoklonální gamapatie nejasného významu

Citovat

SMETANA, Jan, Jan FRÖHLICH, Romana ZAORALOVÁ, Vladimíra VALLOVÁ, Henrieta GREŠLIKOVÁ, Renata KUPSKÁ, Pavel NĚMEC, Aneta MIKULÁŠOVÁ, Martina ALMAŠI, Luděk POUR, Zdeněk ADAM, Viera SANDECKÁ, Lenka ZAHRADOVÁ, Roman HÁJEK a Petr KUGLÍK. Genome-Wide Screening of Cytogenetic Abnormalities in Multiple Myeloma Patients Using Array-CGH Technique: A Czech Multicenter Experience. BioMed Research International. Hindawi Publishing Corporation, 2014, Neuveden, MAY, s. "nestrankovano", 9 s. ISSN 2314-6133. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1155/2014/209670.

@article{1216373,
   author = {Smetana, Jan and Fröhlich, Jan and Zaoralová, Romana and Vallová, Vladimíra and Grešliková, Henrieta and Kupská, Renata and Němec, Pavel and Mikulášová, Aneta and Almaši, Martina and Pour, Luděk and Adam, Zdeněk and Sandecká, Viera and Zahradová, Lenka and Hájek, Roman and Kuglík, Petr},
   article_number = {MAY},
   doi = {http://dx.doi.org/10.1155/2014/209670},
   keywords = {Multiple myeloma; genome-wide profiling; array-CGH; cytogenetics; FISH},
   language = {eng},
   issn = {2314-6133},
   journal = {BioMed Research International},
   title = {Genome-Wide Screening of Cytogenetic Abnormalities in Multiple Myeloma Patients Using Array-CGH Technique: A Czech Multicenter Experience},
   url = {http://www.hindawi.com/journals/bmri/2014/209670/},
   volume = {Neuveden},
   year = {2014}
}

TY  - JOUR
ID  - 1216373
AU  - Smetana, Jan - Fröhlich, Jan - Zaoralová, Romana - Vallová, Vladimíra - Grešliková, Henrieta - Kupská, Renata - Němec, Pavel - Mikulášová, Aneta - Almaši, Martina - Pour, Luděk - Adam, Zdeněk - Sandecká, Viera - Zahradová, Lenka - Hájek, Roman - Kuglík, Petr
PY  - 2014
TI  - Genome-Wide Screening of Cytogenetic Abnormalities in Multiple Myeloma Patients Using Array-CGH Technique: A Czech Multicenter Experience
JF  - BioMed Research International
VL  - Neuveden
IS  - MAY
SP  - "nestrankovano"
EP  - "nestrankovano"
PB  - Hindawi Publishing Corporation
SN  - 23146133
KW  - Multiple myeloma
KW  - genome-wide profiling
KW  - array-CGH
KW  - cytogenetics
KW  - FISH
UR  - http://www.hindawi.com/journals/bmri/2014/209670/
L2  - http://www.hindawi.com/journals/bmri/2014/209670/
N2  - Characteristic recurrent copy number aberrations (CNAs) play a key role in multiple myeloma (MM) pathogenesis and have important prognostic significance for MM patients. Array-based comparative genomic hybridization (aCGH) provides a powerful tool for genome-wide classification of CNAs and thus should be implemented into MM routine diagnostics. We demonstrate the possibility of effective utilization of oligonucleotide-based aCGH in 91 MM patients. Chromosomal aberrations associated with effect on the prognosis of MM were initially evaluated by I-FISH and were found in 93.4% (85/91). Incidence of hyperdiploidy was 49.5% (45/91); del(13)(q14) was detected in 57.1% (52/91); gain(1)(q21) occurred in 58.2% (53/91); del(17)(p13) was observed in 15.4% (14/91); and t(4;14)(p16;q32) was found in 18.6% (16/86). Genome-wide screening using Agilent 44K aCGH microarrays revealed copy number alterations in 100% (91/91). Most common deletions were found at 13q (58.9%), 1p (39.6%), and 8p (31.1%), whereas gain of whole 1q was the most often duplicated region (50.6%). Furthermore, frequent homozygous deletions of genes playing important role in myeloma biology such as TRAF3, BIRC1/BIRC2, RB1, or CDKN2C were observed. Taken together, we demonstrated the utilization of aCGH technique in clinical diagnostics as powerful tool for identification of unbalanced genomic abnormalities with prognostic significance for MM patients.
ER  -

SMETANA, Jan, Jan FRÖHLICH, Romana ZAORALOVÁ, Vladimíra VALLOVÁ, Henrieta GREŠLIKOVÁ, Renata KUPSKÁ, Pavel NĚMEC, Aneta MIKULÁŠOVÁ, Martina ALMAŠI, Luděk POUR, Zdeněk ADAM, Viera SANDECKÁ, Lenka ZAHRADOVÁ, Roman HÁJEK a Petr KUGLÍK. Genome-Wide Screening of Cytogenetic Abnormalities in Multiple Myeloma Patients Using Array-CGH Technique: A Czech Multicenter Experience. \textit{BioMed Research International}. Hindawi Publishing Corporation, 2014, Neuveden, MAY, s.~''nestrankovano'', 9 s. ISSN~2314-6133. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1155/2014/209670.

Podrobný výpis o publikaci