Detekce genově specifických mikrosatelitních markerů jetele lučního

ŘEPKOVÁ, Jana, Jan IŠTVÁNEK, Jana DLUHOŠOVÁ, Jan NEDĚLNÍK a Hana JAKEŠOVÁ. Detekce genově specifických mikrosatelitních markerů jetele lučního. 2014.

Základní údaje

• Originální název: Detekce genově specifických mikrosatelitních markerů jetele lučního
• Název česky: Detekce genově specifických mikrosatelitních markerů jetele lučního
• Název anglicky: Identification of gene specific microsatellite markers in red clover
• Autoři: ŘEPKOVÁ, Jana (203 Česká republika, garant, domácí), Jan IŠTVÁNEK (203 Česká republika, domácí), Jana DLUHOŠOVÁ (203 Česká republika, domácí), Jan NEDĚLNÍK (203 Česká republika) a Hana JAKEŠOVÁ (203 Česká republika).
• Vydání: 2014.

Další údaje

• Originální jazyk: čeština
• Typ výsledku: Cert., akred., schvál. metodiky, specializované mapy, léčebné, památkové postupy
• Obor: Genetika a molekulární biologie
• Stát vydavatele: Česká republika
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• Kód RIV: RIV/00216224:14310/14:00073263
• Organizační jednotka: Přírodovědecká fakulta
• Klíčová slova česky: SSR marker; oligonukleoid; kódující sekvence; jetel luční; šlechtění
• Klíčová slova anglicky: SSR marker; oligonucleoid; coding sequences; red clover; breeding
• Technické parametry: ESSENCE LINE, s.r.o. Plzeňská 130/221, Praha 5 IČO 26505142 zastoupený Ing. Petrem Novotným, jednatelem, podpis smlouvy 13.11.2014
• Štítky: AKR, rivok
• Příznaky: Recenzováno

Anotace

Metodický postup a řešení se týká navržení sady mikrosatelitních markerů ve specifických genech Trifolium pratense (jetel luční) definovaných na základě vlastního sekvenování další generace. Zahrnuje druhově specifické SSR markery v kódujících sekvencích (exonech) genů pro desaturázy, polyfenoloxidázy a noduliny, které jsou součástí metabolických drah biosyntézy mastných kyselin, důležitých pro kvalitu bílkovin a pro fixaci dusíku, a dále zahrnuje SSR markery v genech pro rezistenci a pro výnosové charakteristiky. Metodika se také vztahuje k postupu amplifikace cílových sekvencí SSR markerů pomocí specifických sond. Testovací sada mikrosatelitních markerů je určena pro oblast šlechtění jetele lučního.

Anotace anglicky

Method and procedure concern set of microsatellite markers in specific genes of Trifolium pratense (red clover) based on our own next generation sequencing. The set includs species specific SSR markers in coding sequences (exons) for desaturases, polyphenol oxidases and nodulins participating in biosynthesis of fatty acids, proteine quality and nitrogen fixation, in addition of markers in genes for resistance and yield. Methods includ specific oligonucleotides and amplification cycles of targeted SSR markes. The marker set has been intended for red clover breeding.

Návaznosti

• QI111A019, projekt VaV: Název: Nové genomické postupy pro šlechtění cizosprašných plodin na zlepšení užitkových vlastností (Akronym: HJ2010)

Investor: Ministerstvo zemědělství ČR, Nové genomické postupy pro šlechtění cizosprašných plodin na zlepšení užitkových vlastností, Udržitelný rozvoj agrárního sektoru