POSPÍCHALOVÁ, Vendula, Jan SVOBODA, Zankruti DAVE, Anna KOTRBOVÁ, Karol KAISER, Dobromila KLEMOVÁ, Ladislav ILKOVICS, Aleš HAMPL, Igor CRHA, Eva JANDÁKOVÁ, Luboš MINÁŘ, Vít WEINBERGER a Vítězslav BRYJA. Simplified protocol for flow cytometry analysis of fluorescently labeled exosomes and microvesicles using dedicated flow cytometer. Journal of Extracellular Vesicles. Järfälla: Co-Action Publishing, roč. 4, č. 25530, s. 1-15. ISSN 2001-3078. doi:10.3402/jev.v4.25530. 2015.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Simplified protocol for flow cytometry analysis of fluorescently labeled exosomes and microvesicles using dedicated flow cytometer
Autoři POSPÍCHALOVÁ, Vendula (203 Česká republika, domácí), Jan SVOBODA (203 Česká republika), Zankruti DAVE (356 Indie, domácí), Anna KOTRBOVÁ (203 Česká republika, domácí), Karol KAISER (703 Slovensko, domácí), Dobromila KLEMOVÁ (203 Česká republika, domácí), Ladislav ILKOVICS (203 Česká republika, domácí), Aleš HAMPL (203 Česká republika, domácí), Igor CRHA (203 Česká republika), Eva JANDÁKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Luboš MINÁŘ (203 Česká republika), Vít WEINBERGER (203 Česká republika) a Vítězslav BRYJA (203 Česká republika, domácí).
Vydání Journal of Extracellular Vesicles, Järfälla, Co-Action Publishing, 2015, 2001-3078.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele Švédsko
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Kód RIV RIV/00216224:14310/15:00080746
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
Doi http://dx.doi.org/10.3402/jev.v4.25530
UT WoS 000365076000001
Klíčová slova anglicky CFSE; ascites; exosomes; extracellular vesicles; flow cytometry; fluorescent labeling; lipophilic styryl dye; microvesicles; quantification
Štítky AKR, EL OK, podil, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 8. 4. 2016 14:29.
Anotace
Flow cytometry is a powerful method, which is widely used for high-throughput quantitative and qualitative analysis of cells. However, its straightforward applicability for extracellular vesicles (EVs) and mainly exosomes is hampered by several challenges, reflecting mostly the small size of these vesicles (exosomes: similar to 80-200 nm, microvesicles: similar to 200-1,000 nm), their polydispersity, and low refractive index. The current best and most widely used protocol for beads-free flow cytometry of exosomes uses ultracentrifugation (UC) coupled with floatation in sucrose gradient for their isolation, labeling with lipophilic dye PKH67 and antibodies, and an optimized version of commercial high-end cytometer for analysis. However, this approach requires an experienced flow cytometer operator capable of manual hardware adjustments and calibration of the cytometer. Here, we provide a novel and fast approach for quantification and characterization of both exosomes and microvesicles isolated from cell culture media as well as from more complex human samples (ascites of ovarian cancer patients) suitable for multiuser labs by using a flow cytometer especially designed for small particles, which can be used without adjustments prior to data acquisition. EVs can be fluorescently labeled with protein-(Carboxyfluoresceinsuccinimidyl ester, CFSE) and/or lipid- (FM) specific dyes, without the necessity of removing the unbound fluorescent dye by UC, which further facilitates and speeds up the characterization of microvesicles and exosomes using flow cytometry. In addition, double labeling with protein-and lipid-specific dyes enables separation of EVs from common contaminants of EV preparations, such as protein aggregates or micelles formed by unbound lipophilic styryl dyes, thus not leading to overestimation of EV numbers. Moreover, our protocol is compatible with antibody labeling using fluorescently conjugated primary antibodies. The presented methodology opens the possibility for routine quantification and characterization of EVs from various sources. Finally, it has the potential to bring a desired level of control into routine experiments and non-specialized labs, thanks to its simple bead-based standardization.
Návaznosti
EE2.3.30.0009, projekt VaVNázev: Zaměstnáním čerstvých absolventů doktorského studia k vědecké excelenci
GAP301/11/0747, projekt VaVNázev: Molekulární mechanismy nekanonické Wnt signalizace v leukémii
Investor: Grantová agentura ČR, Molekulární mechanismy nekanonické Wnt signalizace v leukémii
MUNI/M/1050/2013, interní kód MUNázev: Automatizovaná analýza elektronmikroskopických snímků pro použití v biologii a medicíně (Akronym: Analýza TEM snímků)
Investor: Masarykova univerzita, Automatizovaná analýza elektronmikroskopických snímků pro použití v biologii a medicíně, INTERDISCIPLINARY - Mezioborové výzkumné projekty
VytisknoutZobrazeno: 20. 4. 2024 05:25