ZEMAN, Michal, Ivana MAŠLAŇOVÁ, Adéla INDRÁKOVÁ a Roman PANTŮČEK. Charakteristika genómu dvoch baktériofágov indukovaných zo Staphylococcus sciuri. In Študentská vedecká konferencia PriF UK 2015. Sborník recenzovaných príspevkov. Bratislava: Univerzita Komenského v Bratislave, 2015, s. 855-860. ISBN 978-80-223-3859-2.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Charakteristika genómu dvoch baktériofágov indukovaných zo Staphylococcus sciuri
Název anglicky Genomic characterization of two Staphyloccus sciuri bacteriophages
Autoři ZEMAN, Michal, Ivana MAŠLAŇOVÁ, Adéla INDRÁKOVÁ a Roman PANTŮČEK.
Vydání Bratislava, Študentská vedecká konferencia PriF UK 2015. Sborník recenzovaných príspevkov, od s. 855-860, 6 s. 2015.
Nakladatel Univerzita Komenského v Bratislave
Další údaje
Originální jazyk slovenština
Typ výsledku Stať ve sborníku
Obor Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele Slovensko
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Forma vydání paměťový nosič (CD, DVD, flash disk)
WWW URL
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
ISBN 978-80-223-3859-2
Klíčová slova anglicky Staphylococcus sciuri; bacteriophage; prophage; genome; Siphoviridae
Příznaky Recenzováno
Změnil Změnil: prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D., učo 842. Změněno: 30. 4. 2015 13:41.
Anotace
V tomto príspevku sme prezentovali prvých dvoch bakteriofágov pochádzajúcich zo Staphylococcus sciuri, ktorý boli popísaný na úrovní genómu. Oba fágy majú štruktúru genómu podobnú ako ostatné bakteriofágy z čeľade Siphoviridae napádajúce stafylokoky. Relatívne nízka podobnosť na úrovni proteínových sekvencii ku známym proteínom naznačuje, že ide o doposiaľ nepopísané vírusy. U fága phi575 sa našli potenciálne virulenčné faktory, ktoré by mohli prispievať ku zvýšeniu patogénneho potenciálu po začlenení do hostiteľského genómu. Ďalšia analýza týchto fágov by mohla pomôcť objasniť ich úlohu pri horizontálnom prenose génov.
Anotace anglicky
The draft genomes of two temperate Staphylococcus sciuri bacteriophages, phi575 a phi879 have been analysed. Genomes are 41052 and 38506 bp long. Their 57 and 53 open reading frames (ORFs) are arranged in functional modules encoding packaging, head and tail morphogenesis, lysis, integration and DNA replication. According to their genome structure and electron microscopy they both belong to Siphoviridae family. Bioinformatic analysis allowed us to assign putative function to 32 from 57, and 32 from 53 gene products respectively. Phages phi575 a phi879 show similarities mostly in modules for head-tail morphogenesis and DNA replication.
Návaznosti
GP13-05069P, projekt VaVNázev: Horizontální přenos stafylokokové chromozomové kazety mec (SCCmec) prostřednictvím bakteriofágů napříč kmeny rodu Staphylococcus
Investor: Grantová agentura ČR, Horizontální přenos stafylokokové chromozomové kazety mec (SCCmec) prostřednictvím bakteriofágů napříč kmeny rodu Staphylococcus
VytisknoutZobrazeno: 1. 9. 2024 01:34