2015
Charakteristika genómu dvoch baktériofágov indukovaných zo Staphylococcus sciuri
ZEMAN, Michal; Ivana MAŠLAŇOVÁ; Adéla INDRÁKOVÁ a Roman PANTŮČEKZákladní údaje
Originální název
Charakteristika genómu dvoch baktériofágov indukovaných zo Staphylococcus sciuri
Název anglicky
Genomic characterization of two Staphyloccus sciuri bacteriophages
Autoři
Vydání
Bratislava, Študentská vedecká konferencia PriF UK 2015. Sborník recenzovaných príspevkov, od s. 855-860, 6 s. 2015
Nakladatel
Univerzita Komenského v Bratislave
Další údaje
Jazyk
slovenština
Typ výsledku
Stať ve sborníku
Obor
Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele
Slovensko
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Forma vydání
paměťový nosič (CD, DVD, flash disk)
Odkazy
Označené pro přenos do RIV
Ne
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
ISBN
978-80-223-3859-2
Klíčová slova anglicky
Staphylococcus sciuri; bacteriophage; prophage; genome; Siphoviridae
Příznaky
Recenzováno
Změněno: 30. 4. 2015 13:41, prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D.
V originále
V tomto príspevku sme prezentovali prvých dvoch bakteriofágov pochádzajúcich zo Staphylococcus sciuri, ktorý boli popísaný na úrovní genómu. Oba fágy majú štruktúru genómu podobnú ako ostatné bakteriofágy z čeľade Siphoviridae napádajúce stafylokoky. Relatívne nízka podobnosť na úrovni proteínových sekvencii ku známym proteínom naznačuje, že ide o doposiaľ nepopísané vírusy. U fága phi575 sa našli potenciálne virulenčné faktory, ktoré by mohli prispievať ku zvýšeniu patogénneho potenciálu po začlenení do hostiteľského genómu. Ďalšia analýza týchto fágov by mohla pomôcť objasniť ich úlohu pri horizontálnom prenose génov.
Anglicky
The draft genomes of two temperate Staphylococcus sciuri bacteriophages, phi575 a phi879 have been analysed. Genomes are 41052 and 38506 bp long. Their 57 and 53 open reading frames (ORFs) are arranged in functional modules encoding packaging, head and tail morphogenesis, lysis, integration and DNA replication. According to their genome structure and electron microscopy they both belong to Siphoviridae family. Bioinformatic analysis allowed us to assign putative function to 32 from 57, and 32 from 53 gene products respectively. Phages phi575 a phi879 show similarities mostly in modules for head-tail morphogenesis and DNA replication.
Návaznosti
| GP13-05069P, projekt VaV |
|