KŘÍŽOVÁ, Lenka, Jana MCGINNIS, Martina MAIXNEROVÁ, Matěj NEMEC, Laurent POIREL, Lisa MINGLE, Ondrej ŠEDO, William WOLFGANG a Alexandr NEMEC. Acinetobacter variabilis sp nov (formerly DNA group 15 sensu Tjernberg & Ursing), isolated from humans and animals. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. Berks (England): Society for General Microbiology, 2015, roč. 65, č. 3, s. 857-863. ISSN 1466-5026. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1099/ijs.0.000028.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Acinetobacter variabilis sp nov (formerly DNA group 15 sensu Tjernberg & Ursing), isolated from humans and animals
Autoři KŘÍŽOVÁ, Lenka (203 Česká republika), Jana MCGINNIS (840 Spojené státy), Martina MAIXNEROVÁ (203 Česká republika), Matěj NEMEC (203 Česká republika), Laurent POIREL (756 Švýcarsko), Lisa MINGLE (840 Spojené státy), Ondrej ŠEDO (203 Česká republika, garant, domácí), William WOLFGANG (840 Spojené státy) a Alexandr NEMEC (203 Česká republika).
Vydání International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Berks (England), Society for General Microbiology, 2015, 1466-5026.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Velká Británie a Severní Irsko
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 2.439
Kód RIV RIV/00216224:14740/15:00080812
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.1099/ijs.0.000028
UT WoS 000353670100018
Klíčová slova anglicky GENUS ACINETOBACTER; CATTLE
Štítky rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 29. 3. 2016 15:42.
Anotace
We aimed to define the taxonomic status of 16 strains which were phenetically congruent with Acinetobacter DNA group 15 described by Tjernberg & Ursing in 1989. The strains were isolated from a variety of human and animal specimens in geographically distant places over the last three decades. Taxonomic analysis was based on an Acinetobacter-targeted, genus-wide approach that included the comparative sequence analysis of housekeeping, protein-coding genes, whole-cell profiling based on matrix-assisted laser desorption ionization-time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS), an array of in-house physiological and metabolic tests, and whole-genome comparative analysis. Based on analyses of the rpoB and gyrB genes, the 16 strains formed respective, strongly supported clusters clearly separated from the other species of the genus Acinetobacter. The distinctness of the group at the species level was indicated by average nucleotide identity values of <= 82% between the whole genome sequences of two of the 16 strains (NIPH 2171(T) and NIPH 899) and those of the known species. In addition, the coherence of the group was also supported by MALDI-TOF MS. All 16 strains were non-haemolytic and non-gelatinase-producing, grown at 41 degrees C and utilized a rather limited number of carbon sources. Virtually every strain displayed a unique combination of metabolic and physiological features. We conclude that the 16 strains represent a distinct species of the genus Acinetobacter, for which the name Acinetobacter variabilis sp. nov. is proposed to reflect its marked phenotypic heterogeneity. The type strain is NIPH 2171(T) (=CIP 110486(T)=CCUG 26390(T)=CCM 8555(T)).
Návaznosti
GA13-26693S, projekt VaVNázev: Genetická diverzita a fylogeneze rodu Acinetobacter v přírodních ekosystémech.
Investor: Grantová agentura ČR, Genetická diverzita a fylogeneze rodu Acinetobacter v přírodních ekosystémech
VytisknoutZobrazeno: 28. 8. 2024 11:42