BOTKA, Tibor, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Hana KONEČNÁ, Roman PANTŮČEK, Ivan RYCHLÍK, Zbyněk ZDRÁHAL, Petr PETRÁŠ a Jiří DOŠKAŘ. Complete genome analysis of ETA-converting bacteriophages isolated from impetigo strains of Staphylococcus aureus. In R. Gaillyová, I. Valášková, M. Jarkovská. Týden lékařské genetiky v Brně - The Biomania Student Scientific Meeting 2015. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, Brno. s. 33. ISBN 978-80-210-7933-5. 2015.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Complete genome analysis of ETA-converting bacteriophages isolated from impetigo strains of Staphylococcus aureus
Autoři BOTKA, Tibor, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Hana KONEČNÁ, Roman PANTŮČEK, Ivan RYCHLÍK, Zbyněk ZDRÁHAL, Petr PETRÁŠ a Jiří DOŠKAŘ.
Vydání 1. vyd. Brno, Týden lékařské genetiky v Brně - The Biomania Student Scientific Meeting 2015, s. 33-33, 2015.
Nakladatel Masarykova univerzita, Brno
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Stať ve sborníku
Obor Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Forma vydání tištěná verze "print"
WWW The Biomania Student Scientific Meeting 2015
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
ISBN 978-80-210-7933-5
Klíčová slova anglicky ETA phage, Exfoliative toxin A, structure proteins spectre, genome analysis
Štítky NZ
Příznaky Recenzováno
Změnil Změnila: Ing. Nicole Zrilić, učo 240776. Změněno: 10. 5. 2018 09:35.
Anotace
Exfoliative toxin A (ETA)-coding temperate bacteriophages are the main contributors to the toxic phenotype of impetigo strains of Staphylococcus aureus. Two eta gene-positive phages isolated from S. aureus strains which recently caused massive outbreaks of pemphigus neonatorum in several Czech maternity hospitals were characterized in detail to elucidate their genome diversity. The phages, designated phiB166 and phiB236, were able to transfer the eta gene into a prophageless S. aureus strain which afterwards converted into an ETA producer. Complete phage genome sequences were determined and described. In addition, promoters and intrinsic terminators were predicted. With respect to the functional genomic architecture, the genomes were divided into five regions. The comparative analysis revealed major variances between the phages. They differed in the genome size, number of open reading frames (ORFs) and genome architecture. High mutual sequence similarity was detected only in the terminal region. Proteomic analysis showed differences in virion protein patterns. When compared with the so far described eta and non eta phages, noticeable differences were found. Sequences gained by possible recombination were identified in genomes of both phages. Thus, these phages represent two new types of as yet not characterized bacteriophages of the Siphoviridae family having impact on pathogenicity of impetigo strains of S. aureus.
Návaznosti
ED1.1.00/02.0068, projekt VaVNázev: CEITEC - central european institute of technology
GBP206/12/G151, projekt VaVNázev: Centrum nových přístupů k bioanalýze a molekulární diagnostice
NT12395, projekt VaVNázev: Molekulární průkaz a analýza invazivních kmenů small colony variants (SCV) a rezistentních kmenů S. aureus od pacientů s cystickou fibrózou
VytisknoutZobrazeno: 19. 4. 2024 16:02