Štiepenie plazmidovej DNA pomocou iónov Nd3+

D 2011

Štiepenie plazmidovej DNA pomocou iónov Nd3+

ZOVČÁKOVÁ, Monika, Alena ŠPANOVÁ, Roman PANTŮČEK, Jiří DOŠKAŘ, Bohuslav RITTICH et. al.

Základní údaje

Originální název

Štiepenie plazmidovej DNA pomocou iónov Nd3+

Název anglicky

Cleavage of plasmid DNA using Nd3 + ions

Autoři

ZOVČÁKOVÁ, Monika, Alena ŠPANOVÁ, Roman PANTŮČEK, Jiří DOŠKAŘ a Bohuslav RITTICH

Vydání

Brno, XV. Setkání biochemiků a molekulárních biologů: Sborník příspěvků, s. 100-100, 2011

Nakladatel

Masarykova univerzita

Další údaje

Jazyk

slovenština

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Forma vydání

tištěná verze "print"

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

ISBN

978-80-210-5594-0

Klíčová slova česky

plazmidová DNA; Staphylococcus aureus; lantanoidové ionty; Nd3+

Změněno: 16. 1. 2016 21:03, prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D.

Anotace

V originále

V poslednej dobe sa zvýšil záujem v navrhovaní malých kovových komplexov, ktoré sú schopné katalytickej hydrolýzy deoxyribonukleovej kyseliny (DNA) a ribonukleovej kyseliny (RNA) .[1] Väčšina známych syntetických katalyzátorov pre DNA hydrolýzu sú kovové ióny a ich komplexy. Predovšetkým lanthanoidy sú známe ako výborné katalyzátory k štiepeniu DNA. Hydrolyzujú fosfodiesterové väzby na jednoduché estery fosfátu, oligonukleotidy, RNA a jednoreťazcovú DNA.[2] Hoci je známe množstvo prirodzene pôsobiacich hydroláz, vývoj syntetických nukleáz by mal veľký úžitok a význam. [1,3] Možno najväčší význam syntetických hydroláz by bolo ich použitie ako artificiálne reštrikčné enzýmy.[4,5] Je možné ich využiť i k linearizácii plazmidov [2], ktoré sa vyskytujú v klinicky významných kmeňoch baktérií vzhľadom k premenlivosti ich genómu. Cieľom práce bolo štiepenie plazmidovej DNA pUC19 (kontrola) a plazmidovej DNA izolovanej z kmeňov Staphylococcus aureus P2, Staphylococcus aureus P9, Staphylococcus aureus P12, Staphylococcus aureus P23 a Staphylococcus aureus PO7/235 pomocou iónov Nd3+. Štiepenie plazmidovej DNA prebiehalo pri 63 C a reakčný čas bol v rozmedzí 0 - 4 hodín. Reakcia bola zastavená prídavkom 0,5M EDTA. Naštiepená plazmidová DNA bola detekovaná pomocou agarózovej gélovej elektroforézy. Optimálna doba štiepenia bola 4 hodiny. U niektorých kmeňov došlo k linearizácii plazmidov iónmi neodýmia. Veľkosti fragmentov linearizovanej formy boli použité k charakterizácii (určeniu veľkosti) neznámych plazmidov, izolovaných z klinických kmeňov Staphylococus aureus. Bolo zistené, že jednotlivé kmene obsahujú 1-3 plazmidy rôznych dĺžok. Použité lanthanoidové ióny Nd3+ sa ukázali byť vhodným prostriedkom k neenzymatickému štiepeniu plazmidovej DNA.

Návaznosti

MSM0021622415, záměr

Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Citovat

ZOVČÁKOVÁ, Monika, Alena ŠPANOVÁ, Roman PANTŮČEK, Jiří DOŠKAŘ a Bohuslav RITTICH. Štiepenie plazmidovej DNA pomocou iónov Nd3+. In Wimmerová, M. - Beneš, P. XV. Setkání biochemiků a molekulárních biologů: Sborník příspěvků. Brno: Masarykova univerzita, 2011, s. 100. ISBN 978-80-210-5594-0.

@inproceedings{1324605,
   author = {Zovčáková, Monika and Španová, Alena and Pantůček, Roman and Doškař, Jiří and Rittich, Bohuslav},
   address = {Brno},
   booktitle = {XV. Setkání biochemiků a molekulárních biologů: Sborník příspěvků},
   editor = {Wimmerová, M. - Beneš, P.},
   howpublished = {tištěná verze "print"},
   language = {sla},
   location = {Brno},
   isbn = {978-80-210-5594-0},
   pages = {100-100},
   publisher = {Masarykova univerzita},
   title = {Štiepenie plazmidovej DNA pomocou iónov Nd3+},
   year = {2011}
}

TY  - JOUR
ID  - 1324605
AU  - Zovčáková, Monika - Španová, Alena - Pantůček, Roman - Doškař, Jiří - Rittich, Bohuslav
PY  - 2011
TI  - Štiepenie plazmidovej DNA pomocou iónov Nd3+
PB  - Masarykova univerzita
CY  - Brno
SN  - 9788021055940
N2  - V poslednej dobe sa zvýšil záujem v navrhovaní malých kovových komplexov, ktoré sú schopné katalytickej hydrolýzy deoxyribonukleovej kyseliny (DNA) a ribonukleovej kyseliny (RNA) .[1] Väčšina známych syntetických katalyzátorov pre DNA hydrolýzu sú kovové ióny a ich komplexy. Predovšetkým lanthanoidy sú známe ako výborné katalyzátory k štiepeniu DNA. Hydrolyzujú fosfodiesterové väzby na jednoduché estery fosfátu, oligonukleotidy, RNA a jednoreťazcovú DNA.[2] Hoci je známe množstvo prirodzene pôsobiacich hydroláz, vývoj syntetických nukleáz by mal veľký úžitok a význam. [1,3] Možno najväčší význam syntetických hydroláz by bolo ich použitie ako artificiálne reštrikčné enzýmy.[4,5] Je možné ich využiť i k linearizácii plazmidov [2], ktoré sa vyskytujú v klinicky významných kmeňoch baktérií vzhľadom k premenlivosti ich genómu. Cieľom práce bolo štiepenie plazmidovej DNA pUC19 (kontrola) a plazmidovej DNA izolovanej z kmeňov Staphylococcus aureus P2, Staphylococcus aureus P9, Staphylococcus aureus P12, Staphylococcus aureus P23 a Staphylococcus aureus PO7/235 pomocou iónov Nd3+. Štiepenie plazmidovej DNA prebiehalo pri 63 C a reakčný čas bol v rozmedzí 0 - 4 hodín. Reakcia bola zastavená prídavkom 0,5M EDTA. Naštiepená plazmidová DNA bola detekovaná pomocou agarózovej gélovej elektroforézy. Optimálna doba štiepenia bola 4 hodiny. U niektorých kmeňov došlo k linearizácii plazmidov iónmi neodýmia. Veľkosti fragmentov linearizovanej formy boli použité k charakterizácii (určeniu veľkosti) neznámych plazmidov, izolovaných z klinických kmeňov Staphylococus aureus. Bolo zistené, že jednotlivé kmene obsahujú 1-3 plazmidy rôznych dĺžok. Použité lanthanoidové ióny Nd3+ sa ukázali byť vhodným prostriedkom k neenzymatickému štiepeniu plazmidovej DNA.
ER  -

ZOVČÁKOVÁ, Monika, Alena ŠPANOVÁ, Roman PANTŮČEK, Jiří DOŠKAŘ a Bohuslav RITTICH. Štiepenie plazmidovej DNA pomocou iónov Nd3+. In Wimmerová, M. - Beneš, P. \textit{XV. Setkání biochemiků a molekulárních biologů: Sborník příspěvků}. Brno: Masarykova univerzita, 2011, s.~100. ISBN~978-80-210-5594-0.

Podrobný výpis o publikaci