BAKKAIOVA, Jana, María Victoria MARINI PALOMEQUE, Smaranda WILLCOX, Jozef NOSEK, Jack D. GRIFFITH, Lumír KREJČÍ a Lubomir TOMASKA. Yeast mitochondrial HMG proteins: DNA-binding properties of the most evolutionarily divergent component of mitochondrial nucleoids. Bioscience Reports, London: Portland Press LTD, 2016, roč. 36, č. 1, s. "nestránkováno". ISSN 0144-8463. doi:10.1042/BSR20150275.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Yeast mitochondrial HMG proteins: DNA-binding properties of the most evolutionarily divergent component of mitochondrial nucleoids
Autoři BAKKAIOVA, Jana (703 Slovensko), María Victoria MARINI PALOMEQUE (858 Uruguay, domácí), Smaranda WILLCOX (840 Spojené státy americké), Jozef NOSEK (703 Slovensko), Jack D. GRIFFITH (840 Spojené státy americké), Lumír KREJČÍ (203 Česká republika, garant, domácí) a Lubomir TOMASKA (703 Slovensko).
Vydání Bioscience Reports, London, Portland Press LTD, 2016, 0144-8463.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele Spojené království
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor Impact factor: 2.906
Kód RIV RIV/00216224:14110/16:00087782
Organizační jednotka Lékařská fakulta
Doi http://dx.doi.org/10.1042/BSR20150275
UT WoS 000371296900008
Klíčová slova anglicky DNA binding protein; DNA compaction; HMG-box containing protein; mitochondrial DNA (mtDNA); Holliday junction; mitochondrial nucleoid
Štítky EL OK, podil
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Ing. Mgr. Věra Pospíšilíková, učo 9005. Změněno: 4. 8. 2016 16:19.
Anotace
Yeast mitochondrial DNA (mtDNA) is compacted into nucleoprotein structures called mitochondrial nucleoids (mt-nucleoids). The principal mediators of nucleoid formation are mitochondrial HMG-box containing (mtHMG) proteins. Although these proteins are some of the fastest evolving components of mtnucleoids, it is not known whether the divergence of mtHMG proteins on the level of their amino acid sequences is accompanied by diversification of their biochemical properties. In this study we performed a comparative biochemical analysis of yeast mtHMG proteins from Saccharomyces cerevisiae (ScAbf2p), Yarrowia lipolytica (YlMhb1p) and Candida parapsilosis (CpGcf1p). We found that all three proteins exhibit relatively weak binding to intact double-stranded (ds) DNA. In fact, ScAbf2p and YlMhb1p bind quantitatively to this substrate only at very high protein to DNA ratios and CpGcf1p shows only negligible binding to dsDNA. In contrast, the proteins exhibit much higher preference for recombination intermediates such as Holliday junctions and replication forks. Therefore, we hypothesize that the roles of the yeast mtHMG proteins in maintenance and compaction of mtDNA in vivo are in large part mediated by their binding to recombination/replication intermediates. We also speculate that the distinct biochemical properties of CpGcf1p may represent one of the prerequisites for frequent evolutionary tinkering with the form of the mitochondrial genome in the CTG-clade of hemiascomycetous yeast species.
Návaznosti
GAP207/12/2323, projekt VaVNázev: Endonuleazová a translokázová aktivita v restričních-modifikáčních komplexéch typu I
Investor: Grantová agentura ČR, Standardní projekty
GA13-26629S, projekt VaVNázev: SUMO a stability genomu
Investor: Grantová agentura ČR, Standardní projekty
VytisknoutZobrazeno: 15. 10. 2019 18:35