2015
HotSpot Wizard 2.0
ŠTOURAČ, Jan; Jaroslav BENDL; Eva ŠEBESTOVÁ; Ondřej VÁVRA; Miloš MUSIL et al.Základní údaje
Originální název
HotSpot Wizard 2.0
Autoři
ŠTOURAČ, Jan; Jaroslav BENDL; Eva ŠEBESTOVÁ; Ondřej VÁVRA; Miloš MUSIL; Jan BREZOVSKÝ a Jiří DAMBORSKÝ
Vydání
2015
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Software
Obor
10201 Computer sciences, information science, bioinformatics
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Odkazy
Označené pro přenos do RIV
Ano
Kód RIV
RIV/00216224:14310/15:00080424
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
Klíčová slova česky
proteinové inženýrství, design chytrých knihoven, výpočetní mutageneze, predikce hotspotů
Klíčová slova anglicky
protein engineering; smart library design; computational mutagenesis; hotspot prediction
Technické parametry
Integrated platform for protein engineering.
Štítky
Změněno: 23. 5. 2016 14:10, Ing. Jaroslav Bendl
Anotace
V originále
HotSpot Wizard is a web server for automatic identification of hot spots for engineering of substrate specificity, activity or entantioselectivity of enzymes and for annotation of protein structures. HSW 2.0 integrates 3 databases and 18 computational tools, including our in-house tool for analysis of protein tunnels and channels Caver 3.0. In the output, users can explore hot spots based on 4 protein engineering strategies: (i) functional hot spots represented by highly mutable residues located in the active site pocket or access tunnels, (ii) stability hot spots represented by flexible residues, (iii) stability hot spots identified by back-to-consensus approach, and (iv) correlated hot spots represented by pairs of coevolving residues that modulate enzyme activity and selectivity.
Návaznosti
| TA04021380, projekt VaV |
|