a 2015

Computational study of carbonic anhydrase IX

ŠKULTÉTY, Michal a Petr KULHÁNEK

Základní údaje

Originální název

Computational study of carbonic anhydrase IX

Autoři

ŠKULTÉTY, Michal a Petr KULHÁNEK

Vydání

Modeling Interactions in Biomolecules VII, Praha, Czech Republic, 14-18 September, 2015, 2015. 2015

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Označené pro přenos do RIV

Ne

Organizační jednotka

Středoevropský technologický institut
Změněno: 29. 3. 2016 12:13, RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D.

Anotace

V originále

CA IX consists of proteoglycan domain (PG), catalytic domain (CA), transmembrane helix and intracytoplasmatic portion. The catalytic domain has a globular shape and accommodates a conical cavity where the active site is located [2]. The PG domain is a unique structural element to the isoform IX. It is assumed that it is a key to the excellent catalytic properties of CA IX. Despite numerous experimental efforts, the structure and exact function of the PG domain is not known. We employed molecular dynamics simulations to reveal its structure and function. Several constructs were simulated on s time scales including the PG domain alone and constructs including both the CA and PG domains. Results indicate that the PG domain is rather unstructured portion of CA IX

Návaznosti

CZ.1.05/1.1.00/02.0068, interní kód MU
Název: CEITEC - středoevropský technologický institut (Akronym: CEITEC)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, CEITEC - středoevropský technologický institut, 1.1 Evropská centra excelence