JURČÍK, Adam, Julius PARULEK, Jiří SOCHOR a Barbora KOZLÍKOVÁ. Accelerated Visualization of Transparent Molecular Surfaces in Molecular Dynamics. In IEEE Pacific Visualization Symposium 2016. Taipei, Taiwan: IEEE, 2016. s. 112-119. ISBN 978-1-5090-1451-4. doi:10.1109/PACIFICVIS.2016.7465258.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Accelerated Visualization of Transparent Molecular Surfaces in Molecular Dynamics
Autoři JURČÍK, Adam (203 Česká republika, domácí), Julius PARULEK (703 Slovensko), Jiří SOCHOR (203 Česká republika, domácí) a Barbora KOZLÍKOVÁ (203 Česká republika, garant, domácí).
Vydání Taipei, Taiwan, IEEE Pacific Visualization Symposium 2016, od s. 112-119, 8 s. 2016.
Nakladatel IEEE
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Stať ve sborníku
Obor 10201 Computer sciences, information science, bioinformatics
Stát vydavatele Tchaj-wan
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Forma vydání paměťový nosič (CD, DVD, flash disk)
Kód RIV RIV/00216224:14330/16:00089793
Organizační jednotka Fakulta informatiky
ISBN 978-1-5090-1451-4
ISSN 2165-8765
Doi http://dx.doi.org/10.1109/PACIFICVIS.2016.7465258
UT WoS 000386185000015
Klíčová slova česky Počítačová geometrie a modelování objektů;hraniční reprezentace;3D grafika a realismus;Algoritmy viditelnosti čar/povrchů
Klíčová slova anglicky Computational Geometry and Object Modeling;Boundary representations; Three-Dimensional Graphics and Realism;Visible line/surface algorithms
Štítky firank_B
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnil: RNDr. Pavel Šmerk, Ph.D., učo 3880. Změněno: 14. 5. 2020 15:20.
Anotace
The reactivity of the biomolecular structures is highly influenced by their structural features. Thus, studying these features along with the exploration of their dynamic behavior helps to understand the processes ongoing in living cells. This can be reached by the visual representation of these processes as visualization is one of the most natural ways to convey such information. However, none of the currently available techniques provides the biochemists with an intuitive real-time representation of the dynamic movements of molecules and precise geometrical based extraction of their structural features performed instantly. In this paper we introduce such a technique enabling the user to compute and also to visualize the molecular surface along with inner voids. To obtain a better insight into the molecule, our technique enables to visualize the molecular surface transparently. The opacity can be adjusted by changing user-defined parameters in order to enhance the perception of the surfaces of inner voids. All integrated algorithms run in real-time which gives the user a big variety of exploration possibilities. The importance of our approach is even amplified with respect to the fact that currently the size of molecular dynamics simulations is increasing dramatically and offline rendering thus becomes impracticable. The usability of our technique was evaluated by the domain experts.
Návaznosti
MUNI/A/0935/2015, interní kód MUNázev: Zapojení studentů Fakulty informatiky do mezinárodní vědecké komunity (Akronym: SKOMU)
Investor: Masarykova univerzita, Zapojení studentů Fakulty informatiky do mezinárodní vědecké komunity, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty
VytisknoutZobrazeno: 19. 3. 2024 07:52