2016
Sada pro detekci a identifikaci mykotických patogenů
LENGEROVÁ, Martina; Matěj BEZDÍČEK; Zdeněk RÁČIL; Jiří MAYER; Iva KOCMANOVÁ et al.Základní údaje
Originální název
Sada pro detekci a identifikaci mykotických patogenů
Název anglicky
Kit for detection and identification of mycotic pathogens
Vydání
2016
Další údaje
Jazyk
čeština
Typ výsledku
Výsledky s právní ochranou
Obor
30200 3.2 Clinical medicine
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Odkazy
Označené pro přenos do RIV
Ano
Kód RIV
RIV/00216224:14740/16:00087615
Organizační jednotka
Středoevropský technologický institut
Klíčová slova česky
invazivní mykotické infekce; molekulární diagnostika; analýza teplot tání s vysokým rozlišením; panfungální PCR
Klíčová slova anglicky
invasive fungal disease; molecular diagnostics; high resolution melting analysis; panfungal PCR
Štítky
Změněno: 3. 5. 2017 08:54, Mgr. Eva Špillingová
V originále
I přes pokroky v léčbě zůstává míra mortality u invazivních houbových infekcí vysoká. Vzhledem k rozšiřujícímu se spektru možných původců je nezbytná rychlá a přesná diagnostika těchto infekcí. Námi předložená metoda panfungální PCR cílí na vysoce variabilní úsek ITS2 v oblasti rDNA genů a využívá analýzu teplot tání s vysokým rozlišením k druhové identifikaci patogena. V důsledku vysoké variability úseku ITS2 získáme rozdílné teploty tání pro rozdílné druhy fungálních patogenů, díky čemuž jsme schopni patogen identifikovat bez použití časově i finančně náročné sekvenace. Vysoká specificita, pozitivní i negativní prediktivní hodnota, rychlost a časová nenáročnost předložené metody ji činí vhodnou zejména pro rychlý screening vzorků od pacientů v riziku invazivní houbové infekce.
Anglicky
Despite advances in the treatment of invasive fungal diseases, mortality rates remain high. Moreover, due to the expanding spectrum of causative agents, fast and accurate pathogen identification is necessary. We designed a panfungal PCR which targets the highly variable ITS2 region of rDNA genes and uses high resolution melting analysis for subsequent species identification. High ITS region variability leads to obtaining divergent melting peaks for different fungal species and omission of the expensive and time consuming sequencing step is possible. With the high specificity, positive and negative predictive values, short time needed to obtain a result, and low price, the presented assay is intended to be used as a quick screening method for patients at risk of invasive fungal diseases.
Návaznosti
| TE02000058, projekt VaV |
|