Sada pro detekci a identifikaci mykotických patogenů

LENGEROVÁ, Martina, Matěj BEZDÍČEK, Zdeněk RÁČIL, Jiří MAYER a Iva KOCMANOVÁ. Sada pro detekci a identifikaci mykotických patogenů. 2016.

Základní údaje

• Originální název: Sada pro detekci a identifikaci mykotických patogenů
• Název anglicky: Kit for detection and identification of mycotic pathogens
• Autoři: LENGEROVÁ, Martina (203 Česká republika, garant, domácí), Matěj BEZDÍČEK (203 Česká republika), Zdeněk RÁČIL (203 Česká republika, domácí), Jiří MAYER (203 Česká republika, domácí) a Iva KOCMANOVÁ (203 Česká republika).
• Vydání: 2016.

Další údaje

• Originální jazyk: čeština
• Typ výsledku: Výsledky s právní ochranou
• Obor: 30200 3.2 Clinical medicine
• Stát vydavatele: Česká republika
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• WWW: URL
• Kód RIV: RIV/00216224:14740/16:00087615
• Organizační jednotka: Středoevropský technologický institut
• Klíčová slova česky: invazivní mykotické infekce; molekulární diagnostika; analýza teplot tání s vysokým rozlišením; panfungální PCR
• Klíčová slova anglicky: invasive fungal disease; molecular diagnostics; high resolution melting analysis; panfungal PCR
• Štítky: rivok

Anotace

I přes pokroky v léčbě zůstává míra mortality u invazivních houbových infekcí vysoká. Vzhledem k rozšiřujícímu se spektru možných původců je nezbytná rychlá a přesná diagnostika těchto infekcí. Námi předložená metoda panfungální PCR cílí na vysoce variabilní úsek ITS2 v oblasti rDNA genů a využívá analýzu teplot tání s vysokým rozlišením k druhové identifikaci patogena. V důsledku vysoké variability úseku ITS2 získáme rozdílné teploty tání pro rozdílné druhy fungálních patogenů, díky čemuž jsme schopni patogen identifikovat bez použití časově i finančně náročné sekvenace. Vysoká specificita, pozitivní i negativní prediktivní hodnota, rychlost a časová nenáročnost předložené metody ji činí vhodnou zejména pro rychlý screening vzorků od pacientů v riziku invazivní houbové infekce.

Anotace anglicky

Despite advances in the treatment of invasive fungal diseases, mortality rates remain high. Moreover, due to the expanding spectrum of causative agents, fast and accurate pathogen identification is necessary. We designed a panfungal PCR which targets the highly variable ITS2 region of rDNA genes and uses high resolution melting analysis for subsequent species identification. High ITS region variability leads to obtaining divergent melting peaks for different fungal species and omission of the expensive and time consuming sequencing step is possible. With the high specificity, positive and negative predictive values, short time needed to obtain a result, and low price, the presented assay is intended to be used as a quick screening method for patients at risk of invasive fungal diseases.

Návaznosti

• TE02000058, projekt VaV: Název: Centrum kompetence pro molekulární diagnostiku a personalizovanou medicínu (Akronym: MOLDIMED)

Investor: Technologická agentura ČR, Centrum kompetence pro molekulární diagnostiku a personalizovanou medicínu